; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11570 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11570
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationCarg_Chr17:9785221..9786862
RNA-Seq ExpressionCarg11570
SyntenyCarg11570
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576106.1 hypothetical protein SDJN03_26745, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.2e-105100Show/hide
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XP_022991817.1 uncharacterized protein LOC111488350 [Cucurbita maxima]1.2e-10096.95Show/hide
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XP_023547639.1 uncharacterized protein LOC111806522 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.0e-10098.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein2.8e-8786.14Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988825.5e-8385.35Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein3.1e-8686.14Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557801.9e-10498.98Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883505.9e-10196.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein1.3e-2844.44Show/hide
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)2.9e-3647.5Show/hide
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AT2G33510.2 unknown protein3.0e-3344.19Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGGAACAATGCCTCGATTTGAAGACTGGGGAAGTCTACTATAGAAATTGCCGGACCGGAATGAGAGTAACGGAAGATCCGAGGACAGCGGAAGCACACAGCCGAGATTTA
TACTCGGAAGATGACGACGACAACGATGCGGATGAGAGCTCGTCGGACGACGGCAGCGAGGAGTCGTGTTCTTCGTCGTCGTACGGTGCTAGTAGACAGCAATACCCGCC
GGGAAAGGAGGAGGACGTGCTAGTGGTTGCCGGATGCAAGAGATGCTTCATGTACTTCATGGTGCCGAAACAGGTGGAAGATTGCCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTCTTG
TTCATTTCGATCGCTCCGAGGACAGTAATGGCTTCCCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCCATCTCATCTCTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCAGATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCCCTC
GAGCAGTCTTTCCGTACCTTCTCCCTCAACCACCGTCTGGTCTCAGCTGCCCCCTCGGCCGGTGTTCGTAGGTCGTCGTCTTCTTCTTCTTCCGCCGACGAACGTCATCT
TCCTCTTAATCAACATCATCGCTTCGACACAACCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCTCTCCCTCCTTTCTGGGAACAATGCCTCGATTTGAAGACTGGGGAAGTCTACT
ATAGAAATTGCCGGACCGGAATGAGAGTAACGGAAGATCCGAGGACAGCGGAAGCACACAGCCGAGATTTATACTCGGAAGATGACGACGACAACGATGCGGATGAGAGC
TCGTCGGACGACGGCAGCGAGGAGTCGTGTTCTTCGTCGTCGTACGGTGCTAGTAGACAGCAATACCCGCCGGGAAAGGAGGAGGACGTGCTAGTGGTTGCCGGATGCAA
GAGATGCTTCATGTACTTCATGGTGCCGAAACAGGTGGAAGATTGCCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGAGGACAGTAATGGCTTCCCAT
AAAAGAACGAACCACAATTTTTTAAAAATCAAACTGTGTTTGGGTTAATTCTGACATAATCATTGATTCTTTCTCTTTGGATTAATTTGGTGAGCAAAGGCAAATGGGGT
TTAATTTCGTAGCTCGATGTATACGCCTCTCTCCCTCCCTTTGACGTTGTTTTATGAGTTTTAATTGTATGGATATATATTTTACAAAGCTTGAATTGAGAAGCTAAAGA
AAAAGAAAAGGAATCTGGGGGGGGGCCGCCATGGATGTGTGAGTGGGAGATGCAGAAAATATGCAGGCATGAATGGGATGATGGTCAACGACTCAAACGAAGAAGGAATA
ACATTTTGCTCGTGAAGACAGCGACTCATTGCTTTCATTATTCCACAACCCTCTCTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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