; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11580 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11580
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionextensin-like
Genome locationCarg_Chr17:9840959..9842787
RNA-Seq ExpressionCarg11580
SyntenyCarg11580
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576117.1 hypothetical protein SDJN03_26756, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-227100Show/hide
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KAG7014636.1 hypothetical protein SDJN02_24815 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-260100Show/hide
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XP_022991372.1 extensin-like [Cucurbita maxima]4.9e-21794.54Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.8e-25999.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein8.3e-17878.45Show/hide
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A0A1S3CB81 extensin2.9e-17578.86Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin2.9e-17578.86Show/hide
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A0A6J1GPH0 formin-2-like1.2e-25898.72Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like2.4e-21794.54Show/hide
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Query:  PRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP
        PRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP
Subjt:  PRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P13983 Extensin2.1e-0840.55Show/hide
Query:  KTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPS----SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTW
        ++P P   S  + P  P YS P P P   P P    P  PP P   + P P   +PP  P   PP P + P PS    SPPPP   PPPPP     P T+
Subjt:  KTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPS----SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTW

Query:  IPYVSPFSPPPPLSSSSPPS-----PPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFAPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFATPPPPAF
        +P   P SPPPP  S  PP+     PPP + S P    P  SPPPP  SPPPP + + P    P +PP   PPPPA+ P  P T+ P  PP  +PPPPA+
Subjt:  IPYVSPFSPPPPLSSSSPPS-----PPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFAPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFATPPPPAF

Query:  --DPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWI----PHFPPSPPQGLQNQKP
           P  P T+ P  PP +SPPPP+     P   +    P F P PP+ +    P
Subjt:  --DPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWI----PHFPPSPPQGLQNQKP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 32.1e-0837.79Show/hide
Query:  LSYRPLKKNASLCGDQKEKTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPF---PSFPLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPSSPPPP
        LS  P+   +  CG      P  +T         PP S P P PP P F   P+   PP P  PP  Y P P  P PP +  P PP PP  P P   PPP
Subjt:  LSYRPLKKNASLCGDQKEKTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPF---PSFPLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPSSPPPP

Query:  SAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPSPPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFAP--PPPPAFDPRDPRTWI
          PPPPPP  +  P    P  SP  PPPP+ S  PP PPP     P  + P   PPP   SPPPP S +    +    PP  P  PPPP F P  P  + 
Subjt:  SAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPSPPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFAP--PPPPAFDPRDPRTWI

Query:  PHIPPFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP
           PP     PP   P  P +  P I P+ SPPPP   +  P     + PP PP  ++   P
Subjt:  PHIPPFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.0e-3440.94Show/hide
Query:  TISLLLFLLSFFANLFGLTAE----TPASVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVD
        ++++ LF+L  F  +  L+++     P     I+++G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E ++FS NRTT+++G+Y++ I S+D
Subjt:  TISLLLFLLSFFANLFGLTAE----TPASVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVD

Query:  GSNCVDGMTMQSFCQATLIGT---SSEVCNVPGLRTATEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCG
           C D  ++ S CQA+LIG    S   CN+PG RT T+++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG
Subjt:  GSNCVDGMTMQSFCQATLIGT---SSEVCNVPGLRTATEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCG

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.5e-0937.79Show/hide
Query:  LSYRPLKKNASLCGDQKEKTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPF---PSFPLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPSSPPPP
        LS  P+   +  CG      P  +T         PP S P P PP P F   P+   PP P  PP  Y P P  P PP +  P PP PP  P P   PPP
Subjt:  LSYRPLKKNASLCGDQKEKTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPF---PSFPLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPSSPPPP

Query:  SAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPSPPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFAP--PPPPAFDPRDPRTWI
          PPPPPP  +  P    P  SP  PPPP+ S  PP PPP     P  + P   PPP   SPPPP S +    +    PP  P  PPPP F P  P  + 
Subjt:  SAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPSPPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFAP--PPPPAFDPRDPRTWI

Query:  PHIPPFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP
           PP     PP   P  P +  P I P+ SPPPP   +  P     + PP PP  ++   P
Subjt:  PHIPPFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP

AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.1e-0438.65Show/hide
Query:  PFFPPYSFPFPFPPLPPFPSFPLPP---LPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPS-SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPL
        P  P  S P P PP P  P  P+ P    PP+ P P F  PS P+ PS     PPLPP  PSP    P PS+PPP  P  +  P    P  + + PPPP 
Subjt:  PFFPPYSFPFPFPPLPPFPSFPLPP---LPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPS-SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPL

Query:  SSSSPPSPPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLP---SPPPPFSLSDPRTWIPHVP-PFAPPPPPAF--DPRDPRTWIPHIPPFATPPPPA----FDPRDPRTW
        +  SPPSPPP     P T+ P  S PPP P   SP PP     P+T+ P  P P  PP  P +   P  P  ++P  P FA+PPPPA      P+ P   
Subjt:  SSSSPPSPPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLP---SPPPPFSLSDPRTWIPHVP-PFAPPPPPAF--DPRDPRTWIPHIPPFATPPPPA----FDPRDPRTW

Query:  IPHIPP------FFSPPPPAFDLRDP-----RTWIPHFPPSPPQGLQNQKP
           +PP      + SPPPP   +  P        I + PP PP    N  P
Subjt:  IPHIPP------FFSPPPPAFDLRDP-----RTWIPHFPPSPPQGLQNQKP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein5.9e-5147.86Show/hide
Query:  TRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCVDGMTMQSFCQATLIGTSSE---VCN
        +RI+VVG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE+++ SVNRTT++ GVY+LEIP VDG +CVDG+ + S C A ++ TSS+    C+
Subjt:  TRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCVDGMTMQSFCQATLIGTSSE---VCN

Query:  VPGLRTATEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGD-------QKEKTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYF
        +P  +TAT E+SIKSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCG+       + EK       SKFF P+  PY FP+P+P         LPPLP LPP P F
Subjt:  VPGLRTATEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGD-------QKEKTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYF

Query:  PLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPSSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSP
        P       PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+  F P
Subjt:  PLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPSSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein4.8e-3744.58Show/hide
Query:  ISLLLFLLSFFANLFGLTAETPASVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCV
        I LLL L     N   L   +     +I+V+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E ++FS NRTT++ G+Y+L+I S++G  C 
Subjt:  ISLLLFLLSFFANLFGLTAETPASVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCV

Query:  DGM---TMQSFCQATLIGTSSEVCNVPGLRTATEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCG
              ++ + CQA+LIG S + CNVPG RT TE++  KSK  NLC++   AL++RPL+KN  LCG
Subjt:  DGM---TMQSFCQATLIGTSSEVCNVPGLRTATEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTTGTTTGTAGTGAATACAATAATCATTTTCTCTTTTCTCATTACAGTTGGTCTAACACCAAGAACTCACGGGCACATTATATGCAAACAGTATATAGCAAACAA
ACGCTTCAAAATTTTAAGGACTTACCCATTGATGCTCAACCTCCTCCCTCCTTCAGTCTTTCTTATGGATCCAACCATTTCTCTCCTCCTTTTTTTACTATCTTTCTTCG
CTAACTTGTTTGGCCTTACAGCTGAAACCCCAGCGTCGGTCACTCGAATCTCGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGCGACACATGTTTGAGCAACAGTATCTCGAAACACAGC
TACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTTAGAGCAGTTGCTCCCAAAATGGCCGAGCAAATGAGCTTCTCTGTCAACAGAACTACAGATAAATATGG
AGTATATAGGTTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAAGCAATTGTGTGGATGGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAAGCAACCTTAATAGGAACCTCATCGGAAGTCTGCA
ATGTTCCAGGTTTAAGAACTGCAACCGAAGAGATATCGATTAAGTCTAAGCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCCTTGAGTTACAGGCCTCTTAAGAAGAAT
GCAAGCTTATGTGGAGATCAGAAAGAGAAAACTCCAGATCCCTTGACCGCCTCAAAGTTTTTTCTCCCCTTCTTTCCTCCTTATTCATTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCT
GCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCGCTTCCTCCATTGCCCCCTGTTCCATATTTTCCTCTCCCTTCGTGTCCTAACCCGCCATCTTTACCATTTCCTTTCCCAC
CTTTGCCTCCTTTCTTTCCTTCACCTTCAAGTCCACCTCCGCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCTCCATTCAGTCTTAGCGATCCAAGGACCTGGATACCATATGTTTCC
CCATTTTCTCCTCCACCACCTCTGTCATCATCATCGCCACCGTCACCACCTCCATTCAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCATATGTTTCTCCTCCACCACCTCT
GCCATCGCCGCCACCTCCATTCAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTGCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTTGATCCCCGAGACCCTAGAA
CATGGATTCCCCATATCCCACCATTTGCTACTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTCGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCTCTCCTCCACCT
CCTGCATTTGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCACATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGCCTCCAAAATCAAAAGCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCTTAAAAGAATCCTTTTCCTAATCAACCGGAGCTTTTATTTTATTCACTGCAGTTCCTAATGAAGTCTATGAAATTGCCTAAGAAGGCTCCACATTTCTTCTTCTTTT
TTCACGGCCTTTCTTGGGTGCTAAAGACAATGGAAGTTCCATTTATTGGACAGTCGGTAGAAACAAGAAAGGCTTGTTCATAACATCTTTCCAGATCTAGGAAATCAAAC
ACCCTTTTAATCAATCCCATTTATCTCCGAATCTGCCTAAAAAGACTTAAACTACAAACCCCTTTCCTTTTACGCTTGCCCCCACATTCAGCCAAAAACCTTCTTCACAT
GTCTTTGTTTGTAGTGAATACAATAATCATTTTCTCTTTTCTCATTACAGTTGGTCTAACACCAAGAACTCACGGGCACATTATATGCAAACAGTATATAGCAAACAAAC
GCTTCAAAATTTTAAGGACTTACCCATTGATGCTCAACCTCCTCCCTCCTTCAGTCTTTCTTATGGATCCAACCATTTCTCTCCTCCTTTTTTTACTATCTTTCTTCGCT
AACTTGTTTGGCCTTACAGCTGAAACCCCAGCGTCGGTCACTCGAATCTCGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGCGACACATGTTTGAGCAACAGTATCTCGAAACACAGCTA
CTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTTAGAGCAGTTGCTCCCAAAATGGCCGAGCAAATGAGCTTCTCTGTCAACAGAACTACAGATAAATATGGAG
TATATAGGTTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAAGCAATTGTGTGGATGGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAAGCAACCTTAATAGGAACCTCATCGGAAGTCTGCAAT
GTTCCAGGTTTAAGAACTGCAACCGAAGAGATATCGATTAAGTCTAAGCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCCTTGAGTTACAGGCCTCTTAAGAAGAATGC
AAGCTTATGTGGAGATCAGAAAGAGAAAACTCCAGATCCCTTGACCGCCTCAAAGTTTTTTCTCCCCTTCTTTCCTCCTTATTCATTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGC
CACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCGCTTCCTCCATTGCCCCCTGTTCCATATTTTCCTCTCCCTTCGTGTCCTAACCCGCCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCT
TTGCCTCCTTTCTTTCCTTCACCTTCAAGTCCACCTCCGCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCTCCATTCAGTCTTAGCGATCCAAGGACCTGGATACCATATGTTTCCCC
ATTTTCTCCTCCACCACCTCTGTCATCATCATCGCCACCGTCACCACCTCCATTCAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCATATGTTTCTCCTCCACCACCTCTGC
CATCGCCGCCACCTCCATTCAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTGCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTTGATCCCCGAGACCCTAGAACA
TGGATTCCCCATATCCCACCATTTGCTACTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTCGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCTCTCCTCCACCTCC
TGCATTTGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCACATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGCCTCCAAAATCAAAAGCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSLFVVNTIIIFSFLITVGLTPRTHGHIICKQYIANKRFKILRTYPLMLNLLPPSVFLMDPTISLLLFLLSFFANLFGLTAETPASVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHS
YFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCVDGMTMQSFCQATLIGTSSEVCNVPGLRTATEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKN
ASLCGDQKEKTPDPLTASKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPFPFPPLPPFFPSPSSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVS
PFSPPPPLSSSSPPSPPPFSLSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFAPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPP
PAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP