; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11711 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11711
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionMembrane lipoprotein, putative
Genome locationCarg_Chr02:3632684..3633124
RNA-Seq ExpressionCarg11711
SyntenyCarg11711
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605337.1 hypothetical protein SDJN03_02654, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-6898.63Show/hide
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KAG7035293.1 hypothetical protein SDJN02_02088, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-69100Show/hide
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XP_022947828.1 uncharacterized protein LOC111451588 [Cucurbita moschata]7.7e-6897.26Show/hide
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XP_023533092.1 uncharacterized protein LOC111795084 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.5e-6695.21Show/hide
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XP_038900833.1 uncharacterized protein LOC120087896 [Benincasa hispida]2.8e-4167.55Show/hide
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        N   ESP+ D G + ++ED    +QR+SNSSSN+S ASRESE PLAIT GS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJX6 Uncharacterized protein1.1e-3864.05Show/hide
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         N     ES Q D G + N++++N  QR SNSSSN+S  SRESE PLAIT  S
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A0A1S3CDW9 Uncharacterized protein1.2e-3762.75Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S++SGGGCLLMY+ LPE+E+T WLP+ GLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACG+RVSLG    ED    N N+N +NN
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          N    ESP+ D G + N++++N  QR+SNSSSN+S  SRESE PLAIT  S
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A0A5A7TCV0 Uncharacterized protein2.6e-3761.69Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S++SGGGCLLMY+ LPE+E+T WLP+ GLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACG+RVSLG   +     TNN N +NN 
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         N      ESP+ D G + N++++N  QR+SNSSSN+S  SRESE PLAIT  S
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A0A6J1EV39 uncharacterized protein LOC1114383196.9e-3862.84Show/hide
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        MSLVDPS GR  +W V F LFL +LSGG CLL+YI LPETE+TAWLPVAGLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACGFRVSL +  + +    ++ N +NN+
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          ESP+ DA  QA ++ +N  QR+SN SSN+S  SRESE P AI+ GS
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A0A6J1G7P7 uncharacterized protein LOC1114515883.7e-6897.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G30770.1 Putative membrane lipoprotein3.9e-1740.24Show/hide
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        M + DP  G+  I ++T  LFLS+  GGGCL+ Y  LP      WL   G+  VCLPWFFW LTF YRI+SR  GFR+ +G          NN N +  T
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        R+        ESP  D     A  Q       + + ++++ ++SSNS+ AS ESE PLAI+  S
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AT5G17590.1 Putative membrane lipoprotein4.9e-0433.33Show/hide
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        +D   G   I+I+T VLFLS +  GG LL    +    N  +L  AG+  V +PW FWFL ++Y  + + C   VS   + N  +  + + E  D N   
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Query:  ES
        E+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTTGGTCGATCCATCAATTGGACGTGTATTAATATGGATCGTTACTTTCGTTCTCTTCCTCTCTGTTCTCAGCGGCGGTGGATGCCTTTTGATGTATATTACCCT
ACCTGAGACCGAAAACACCGCGTGGCTACCGGTCGCAGGCTTGTCTTTGGTCTGCCTCCCTTGGTTCTTTTGGTTCTTAACTTTCTTGTATAGAATCATCTCACGTGCAT
GTGGTTTTAGAGTCTCTCTTGGCTTAGTTGTGAACGAAGATGCAGCGGCAACAAATAACGAAAATGCGGATAATAATACTCGTAATGAATCCCCTCAAAGTGATGCAGGG
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A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GTGGTTTTAGAGTCTCTCTTGGCTTAGTTGTGAACGAAGATGCAGCGGCAACAAATAACGAAAATGCGGATAATAATACTCGTAATGAATCCCCTCAAAGTGATGCAGGG
TGTCAGGCTAATAAGGAGGACAGCAATCAAAGGCAAAGCAATTCATCATCGAACAGCTCGGGAGCGTCTCGTGAAAGTGAAAAGCCATTAGCCATAACAACGGGGTCGTA
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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