; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11739 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11739
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RGLG4 isoform X2
Genome locationCarg_Chr02:3824403..3825073
RNA-Seq ExpressionCarg11739
SyntenyCarg11739
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605359.1 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-4992.8Show/hide
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KAG7035320.1 hypothetical protein SDJN02_02115 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.8e-67100Show/hide
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XP_022947336.1 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG4 isoform X1 [Cucurbita moschata]5.0e-5694.03Show/hide
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XP_023533277.1 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.5e-4987.31Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1G650 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG4 isoform X12.4e-5694.03Show/hide
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A0A6J1G665 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG4 isoform X22.4e-5694.03Show/hide
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A0A6J1KZS5 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG41.2e-4279.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCGCTAACAGCATGGTTCAGCAATATGGGCAGTTTGGTCAGCTCCTCTTCTAAACGGAGCGGTGGCGGAGAAAAGCCTGCCAAAGCGGCTTCAGAACCGTCGTTCGG
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AAATGGCTGCACAACCGTCGGTTAAAAATATGGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGTGGCTGTGGCGGTGGCCGTGGAAAGGGCTCGAGATTGTCTGAGAAGAAGGCTTCTTTC
CGGCAGAAGTACGGTTTCATAGCAGATAATTTCTCTTCCATTGACCAGAAATTGGATGAGACCGTAAAAGAAATTACAGTCTTTAACCATGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCGGTAAGAAATATCCGCTCCATTCCCGTCACCGCAGAGAATCCAATTCCTTCCTTATTGTCCTCTCGGTTTCCACTTTCCAACCCCACCAATCCACTTCTAAAGCATG
CCGCTAACAGCATGGTTCAGCAATATGGGCAGTTTGGTCAGCTCCTCTTCTAAACGGAGCGGTGGCGGAGAAAAGCCTGCCAAAGCGGCTTCAGAACCGTCGTTCGGCGG
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