; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11775 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11775
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionthioredoxin H-type-like
Genome locationCarg_Chr05:1177976..1178953
RNA-Seq ExpressionCarg11775
SyntenyCarg11775
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013766 - Thioredoxin domain
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598471.1 hypothetical protein SDJN03_08249, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-5999.16Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLL+ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

KAG7029408.1 hypothetical protein SDJN02_07747, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-59100Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

XP_022962291.1 thioredoxin H-type-like [Cucurbita moschata]2.0e-5898.32Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLL+ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPY SQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

XP_022997534.1 thioredoxin H-type-like [Cucurbita maxima]2.5e-5695.8Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        +AQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYF QLAKNHPSVIFLEVDVDELK VAFKWDIEAL TFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPA AASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

XP_023547172.1 thioredoxin H-type-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.3e-5999.16Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTA WCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BB48 thioredoxin H1-like4.3e-3866.67Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        M +EG VIAC   SEW+A+L   KESGKL+VV FTASWCGP R IAPYFS+LAKNHP V+FL+VDVDEL  +A +W I A+PTF+F+K G+  H+IVG D
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKIEELKTPAAAAST
        RAALL+KIEELKT  AAA++
Subjt:  RAALLRKIEELKTPAAAAST

A0A6J1GHE8 thioredoxin H-type-like3.0e-3966.94Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA+EG VIAC   +EW+A L   KESGKLIVV FTASWCGP R IAPYFS+LAKNHP V+FL+VDVDEL  VA +W+I A+PTF+F+KRG+  H+IVG D
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKIEELKTPAAAASTA
        ++ALL+KIEELKTP AA +++
Subjt:  RAALLRKIEELKTPAAAASTA

A0A6J1HCP9 thioredoxin H-type-like9.8e-5998.32Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLL+ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPY SQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

A0A6J1KBN3 thioredoxin H-type-like1.2e-5695.8Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        +AQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYF QLAKNHPSVIFLEVDVDELK VAFKWDIEAL TFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPA AASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

A0A6J1KLL7 thioredoxin H-type-like3.0e-3967.5Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA+EG VIAC   +EW+A L   KESGKLIVV FTASWCGP R IAPYFS+LAKNHP V+FL+VDVDEL  VA +W+I A+PTF+F+KRG+  H+IVG D
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKIEELKTPAAAAST
        ++ALL+KIEELKTP AA ++
Subjt:  RAALLRKIEELKTPAAAAST

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65049 Thioredoxin H-type1.1e-2549.57Show/hide
Query:  EGNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAA
        EGNV AC ST  W + L +  ++ +L+ V FTA+WCGP R+I P F +L+K  P + FL+VDVDEL+ VA +WD+EA+PTFIF+K G+   ++VG  +  
Subjt:  EGNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAA

Query:  LLRKIEELKTPAAAAST
        L RK+  L   AAAA+T
Subjt:  LLRKIEELKTPAAAAST

P29448 Thioredoxin H11.4e-2554.37Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR
        ++EG VIAC +   WN  L K  ES  L+VV FTASWCGP R IAP+F+ LAK  P+V+FL+VD DELK VA  W I+A+PTF+FLK G+   ++VG  +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR

Query:  AAL
          L
Subjt:  AAL

P29449 Thioredoxin H-type 16.2e-2647.46Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR
        ++EG V  C    EWN    K  E+ KL+VV FTASWCGP R IAP  + +AK  P VIFL+VDVDELK V+ +W +EA+PTF+F+K G++  R+VG  +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR

Query:  AALLRKIEELKTPAAAAS
          L + I +   PA   +
Subjt:  AALLRKIEELKTPAAAAS

Q0D840 Thioredoxin H12.3e-2546.67Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR
        A+EG VIAC +  E++A +   KE+GK++++ FTASWCGP R IAP F++ AK  P  +FL+VDVDELK VA K+++EA+PTF+F+K G ++ ++VG  +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR

Query:  AALLRKIEELKTPAAAASTA
          L   I +     AA+++A
Subjt:  AALLRKIEELKTPAAAASTA

Q96419 Thioredoxin H-type8.6e-2855.56Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA+E  VIAC +  EWN      K+SGKLIV+ FTASWCGP R+I PY S+LAK  P V F +VDVD+LK VA ++ +EA+P+F+ LK GQ+  RIVG  
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKI
        +  LL KI
Subjt:  RAALLRKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19730.1 Thioredoxin superfamily protein1.7e-2350Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNH-PSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        A+EG VI C +   W   L   KES KLIV+ FTASWC P R+IAP F+ LAK    S IF +VDVDEL+ VA ++ +EA+PTF+F+K G+   ++VG +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNH-PSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKI
        +  L  KI
Subjt:  RAALLRKI

AT1G45145.1 thioredoxin H-type 57.7e-2447.22Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA EG VIAC +   WN  +    ES KLIV+ FTASWC P R IAP F+++AK   +V+F ++DVDEL+ VA ++ +EA+PTF+F+K G    R+VG  
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKI
        +  +  K+
Subjt:  RAALLRKI

AT3G08710.1 thioredoxin H-type 95.5e-2241.12Show/hide
Query:  GNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAAL
        GNV    +   W+  L +    GK++V +F+A+WCGP +++AP+F +L++ H S++FL VDVDEL   +  WDI+A PTF FLK GQ+  ++VG ++  L
Subjt:  GNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAAL

Query:  LRKIEEL
         +K+  +
Subjt:  LRKIEEL

AT3G51030.1 thioredoxin H-type 19.8e-2754.37Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR
        ++EG VIAC +   WN  L K  ES  L+VV FTASWCGP R IAP+F+ LAK  P+V+FL+VD DELK VA  W I+A+PTF+FLK G+   ++VG  +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLK--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR

Query:  AAL
          L
Subjt:  AAL

AT5G42980.1 thioredoxin 32.2e-2648.31Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA EG VIAC +  +W   L    ES KLIV+ FTA+WC P R IAP F+ LAK H  V+F +VDVDEL  VA ++ ++A+PTFIF+K G+    +VG  
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKIEELKTPAAAA
        +  ++  +E+ KT  AAA
Subjt:  RAALLRKIEELKTPAAAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCAAGAAGGAAATGTGATTGCCTGTCGTAGTACTTCTGAATGGAATGCTGTATTGTTGAAAGAATCTGGAAAACTGATTGTGGTGCATTTTACTGCTTCCTGGTG
CGGGCCACGCCGATTAATTGCTCCATATTTCTCACAATTGGCTAAGAATCATCCTAGTGTCATTTTCCTGGAAGTAGACGTCGATGAATTGAAACGTGTTGCTTTCAAGT
GGGATATTGAGGCATTACCGACGTTTATTTTCCTGAAAAGAGGGCAAAAATCTCACAGGATTGTTGGTACTGATAGAGCGGCGCTATTGAGGAAAATAGAAGAGCTTAAA
ACTCCAGCAGCTGCTGCTTCTACTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTCAAGAAGGAAATGTGATTGCCTGTCGTAGTACTTCTGAATGGAATGCTGTATTGTTGAAAGAATCTGGAAAACTGATTGTGGTGCATTTTACTGCTTCCTGGTG
CGGGCCACGCCGATTAATTGCTCCATATTTCTCACAATTGGCTAAGAATCATCCTAGTGTCATTTTCCTGGAAGTAGACGTCGATGAATTGAAACGTGTTGCTTTCAAGT
GGGATATTGAGGCATTACCGACGTTTATTTTCCTGAAAAGAGGGCAAAAATCTCACAGGATTGTTGGTACTGATAGAGCGGCGCTATTGAGGAAAATAGAAGAGCTTAAA
ACTCCAGCAGCTGCTGCTTCTACTGCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLKESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYFSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAALLRKIEELK
TPAAAASTA