; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12023 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12023
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionF-box protein PP2-B15-like
Genome locationCarg_Chr05:9234472..9235366
RNA-Seq ExpressionCarg12023
SyntenyCarg12023
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599205.1 F-box protein PP2-B15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-12797.91Show/hide
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KAG7030140.1 F-box protein PP2-B15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.6e-132100Show/hide
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XP_023545312.1 F-box protein PP2-B15-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-12697.49Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DQK9 F-box protein VBF-like4.8e-8969.42Show/hide
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        VWL+RK++    +E LFYGNRRER  KL     G+  + NG+
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A0A6J1G450 F-box protein PP2-B15-like4.9e-12697.07Show/hide
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A0A6J1G464 F-box protein PP2-B15-like1.5e-12294.56Show/hide
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A0A6J1KDI1 F-box protein PP2-B15-like1.9e-12293.72Show/hide
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A0A6J1KF36 F-box protein PP2-B15-like1.1e-12293.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80494 F-box protein PP2-B151.4e-4543.93Show/hide
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Q3E6P4 F-box protein At2g022401.3e-3847.54Show/hide
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        G S   VLPEDC+S I+S T+P DA   + VS TF SA  SD VW +FLP  Y  +V+ S +       SK+E +F LC +P+LI+ GKKSF LE+ SGK
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         C  LS++EL ITW S P  W W S P+SRF ++AEL    W EI G+T    LSP T  + AY+V K  ++  GL  +P +V
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Q9C7J9 F-box protein PP2-B131.6e-4142.22Show/hide
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        +LPE CV+ IL+ T+P DA   S VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S         SK+E +  LC  +LID  +K F++ +FSGKI Y LSA
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        R+++IT+S      SW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LSPNT  +GAYL++K++   YGLDL+PA+  V+  +  Q+++ + +L   ++  
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         +M+ LFYGNR ER      A  GD
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Q9C7K0 F-box protein VBF5.6e-4242.22Show/hide
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        +LPE C++ IL+ T+P DA   S VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S       + SK+E +  LC  +LID  +K F++ +FSGKI Y LSA
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        R+++IT S     WSW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LS NT  +GAYL+VK+++  YGLDL+PA+  ++  +  Q S+ + +L   ++  
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         +M+ LFYGNR ER      A  GD
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Q9ZVQ6 F-box protein PP2-B101.5e-3444.07Show/hide
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        PEDC+S I+S T P DA   + VS TF S  +SD++W +FLP +Y  ++  S +       SK+E +F LC+ P+L D  KKS  LE+ SGK C  LSA 
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Query:  ELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTFVHGAYLVVKISEKRYGLDLMPAQVCV
         L+I W  +P  W W   P+SRF +VA+LR   W EI GRT T  LSP T  + AY+V K  +K YG   +  +  V
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09155.1 phloem protein 2-B151.0e-4643.93Show/hide
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        +LPE CV+ ILS TTP D    + VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S         SK+E +  LC  ILID G+K F++E+ SGKI Y LS+
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         +ME +FYG R +R
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AT1G56240.1 phloem protein 2-B131.1e-4242.22Show/hide
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        +LPE CV+ IL+ T+P DA   S VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S         SK+E +  LC  +LID  +K F++ +FSGKI Y LSA
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        R+++IT+S      SW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LSPNT  +GAYL++K++   YGLDL+PA+  V+  +  Q+++ + +L   ++  
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         +M+ LFYGNR ER      A  GD
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AT1G56250.1 phloem protein 2-B144.0e-4342.22Show/hide
Query:  VLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKRETFFRLCSPILIDGGKKSFELERFSGKICYTLSA
        +LPE C++ IL+ T+P DA   S VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S       + SK+E +  LC  +LID  +K F++ +FSGKI Y LSA
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKRETFFRLCSPILIDGGKKSFELERFSGKICYTLSA

Query:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTFVHGAYLVVKISEKRYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSN
        R+++IT S     WSW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LS NT  +GAYL+VK+++  YGLDL+PA+  ++  +  Q S+ + +L   ++  
Subjt:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTFVHGAYLVVKISEKRYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSN

Query:  LKMESLFYGNRRERAIKLFAADLGD
         +M+ LFYGNR ER      A  GD
Subjt:  LKMESLFYGNRRERAIKLFAADLGD

AT2G02240.1 F-box family protein9.1e-4047.54Show/hide
Query:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKRETFFRLC-SPILIDGGKKSFELERFSGK
        G S   VLPEDC+S I+S T+P DA   + VS TF SA  SD VW +FLP  Y  +V+ S +       SK+E +F LC +P+LI+ GKKSF LE+ SGK
Subjt:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKRETFFRLC-SPILIDGGKKSFELERFSGK

Query:  ICYTLSARELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTFVHGAYLVVKISEKRYGLDLMPAQV
         C  LS++EL ITW S P  W W S P+SRF ++AEL    W EI G+T    LSP T  + AY+V K  ++  GL  +P +V
Subjt:  ICYTLSARELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTFVHGAYLVVKISEKRYGLDLMPAQV

AT2G02360.1 phloem protein 2-B101.0e-3544.07Show/hide
Query:  PEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKRETFFRLCS-PILIDGGKKSFELERFSGKICYTLSAR
        PEDC+S I+S T P DA   + VS TF S  +SD++W +FLP +Y  ++  S +       SK+E +F LC+ P+L D  KKS  LE+ SGK C  LSA 
Subjt:  PEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKRETFFRLCS-PILIDGGKKSFELERFSGKICYTLSAR

Query:  ELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTFVHGAYLVVKISEKRYGLDLMPAQVCV
         L+I W  +P  W W   P+SRF +VA+LR   W EI GRT T  LSP T  + AY+V K  +K YG   +  +  V
Subjt:  ELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTFVHGAYLVVKISEKRYGLDLMPAQVCV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGAATTTCGAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTGTTTCGGCGATTCTGTCACTCACGACTCCCACCGACGCCGGGAAATTGTCCCTCGTCTCGTCGACATT
CCGATCAGCGGCGGAATCCGACGTCGTTTGGAGCAGATTTTTGCCTAAAAACTACGCCGAAATCGTGGCCGCCTCTGATATCTCCGGCGAATCGCCACTCTGTTCGAAGA
GAGAAACTTTCTTCCGACTCTGTTCTCCGATCCTAATCGACGGCGGAAAAAAGAGCTTTGAGTTGGAGAGATTTTCCGGGAAGATCTGTTATACATTGTCAGCAAGAGAG
CTGGCGATCACTTGGAGCTCCGATCCACTCTGTTGGAGCTGGAAATCCGATCCTCAATCAAGATTCGCAGAAGTTGCAGAGCTCAGAGCATCGAGCTGGGTGGAAATCCA
TGGAAGAACAAGAACAGGACGGCTGTCTCCGAACACATTTGTACACGGAGCTTATCTTGTGGTGAAGATTTCAGAGAAGAGGTATGGGTTGGATTTGATGCCAGCCCAAG
TTTGTGTTCAATTGGGGGATGCGTTGCAGAGCTCCCAAGGCTCTGTTTGGCTGCGCCGCAAGGAACAGAGCAACCTTAAAATGGAGTCTCTGTTTTATGGGAATCGGAGG
GAGAGAGCCATAAAGCTATTCGCTGCTGATCTGGGAGACAATTTTGATAGCAACGGAAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGGAATTTCGAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTGTTTCGGCGATTCTGTCACTCACGACTCCCACCGACGCCGGGAAATTGTCCCTCGTCTCGTCGACATT
CCGATCAGCGGCGGAATCCGACGTCGTTTGGAGCAGATTTTTGCCTAAAAACTACGCCGAAATCGTGGCCGCCTCTGATATCTCCGGCGAATCGCCACTCTGTTCGAAGA
GAGAAACTTTCTTCCGACTCTGTTCTCCGATCCTAATCGACGGCGGAAAAAAGAGCTTTGAGTTGGAGAGATTTTCCGGGAAGATCTGTTATACATTGTCAGCAAGAGAG
CTGGCGATCACTTGGAGCTCCGATCCACTCTGTTGGAGCTGGAAATCCGATCCTCAATCAAGATTCGCAGAAGTTGCAGAGCTCAGAGCATCGAGCTGGGTGGAAATCCA
TGGAAGAACAAGAACAGGACGGCTGTCTCCGAACACATTTGTACACGGAGCTTATCTTGTGGTGAAGATTTCAGAGAAGAGGTATGGGTTGGATTTGATGCCAGCCCAAG
TTTGTGTTCAATTGGGGGATGCGTTGCAGAGCTCCCAAGGCTCTGTTTGGCTGCGCCGCAAGGAACAGAGCAACCTTAAAATGGAGTCTCTGTTTTATGGGAATCGGAGG
GAGAGAGCCATAAAGCTATTCGCTGCTGATCTGGGAGACAATTTTGATAGCAACGGAAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKRETFFRLCSPILIDGGKKSFELERFSGKICYTLSARE
LAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTFVHGAYLVVKISEKRYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNLKMESLFYGNRR
ERAIKLFAADLGDNFDSNGN