; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12039 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12039
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRAB GTPase homolog 1A
Genome locationCarg_Chr05:9345004..9349395
RNA-Seq ExpressionCarg12039
SyntenyCarg12039
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7030156.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-108100Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

XP_004147230.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucumis sativus]1.8e-10799.01Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+ETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

XP_022155520.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Momordica charantia]1.1e-10799.01Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTV+IRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

XP_022948506.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita moschata]3.6e-10899.5Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

XP_022965188.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita maxima]5.2e-10798.51Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+E+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5E9 Uncharacterized protein8.7e-10899.01Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+ETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

A0A1S3BJX6 GTP-binding protein YPTM2-like8.7e-10899.01Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+ETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

A0A6J1DMM8 GTP-binding protein YPTM2-like5.1e-10899.01Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTV+IRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

A0A6J1G9D5 GTP-binding protein YPTM2-like1.8e-10899.5Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

A0A6J1KZK2 GTP-binding protein YPTM21.8e-10899.5Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVN+KSGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a1.0e-9786.7Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTD++SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNKKSGC
        QWL+EIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLT N+ + +ETAKAFADEIGIPFMETSAK ATNVEQAFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTVQIRGQPV +K+GC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNKKSGC

Query:  CSS
        CS+
Subjt:  CSS

P40392 Ras-related protein RIC11.1e-9486.14Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYL+SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQ+SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTVQIRGQPVNKKSGC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DL  N+VVS+E  KA ADEIGIPF+ETSAK ATNVE+AFM MA EIKNRMA+QP  NA +P TVQ+RGQPV ++S C
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTVQIRGQPVNKKSGC

Query:  CS
        CS
Subjt:  CS

Q05737 GTP-binding protein YPTM21.1e-9990.15Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTDQ+SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTVQIRGQPVNKKSGC
        QWLNEIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLTANKVV+ ETAKAFADE+GIPFMETSAK+ATNV+QAFMAMAA IK+RMA+QP   NARP TVQIRGQPVN+K+ C
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTVQIRGQPVNKKSGC

Query:  CSS
        CSS
Subjt:  CSS

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b5.4e-9988.61Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQIRGQPVN++SGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c2.1e-9888.12Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   ++PPTVQIRGQPVN++SGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 57.3e-9986.7Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTD++SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNKKSGC
        QWL+EIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLT N+ + +ETAKAFADEIGIPFMETSAK ATNVEQAFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTVQIRGQPV +K+GC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNKKSGC

Query:  CSS
        CS+
Subjt:  CSS

AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E1.4e-6560.39Show/hide
Query:  EYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWL
        +YDYL KLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVELDGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVTD+ SFNN++ W+
Subjt:  EYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWL

Query:  NEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK-VVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNK-------
          I+++AS++VNK+LVGNK+D+  +K  V     +A ADE GI F ETSAK+  NVEQ F+++A +IK R+ T+    A P  ++I  Q  NK       
Subjt:  NEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK-VVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNK-------

Query:  -KSGCCS
         KS CCS
Subjt:  -KSGCCS

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein8.1e-8272.77Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+E DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYD T+ +SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPTVQIRGQPVNKKSG
        QWL+EIDRYA+E+V KLL+GNK+D+  +KVVS ET +A ADE+GIPF+ETSAK + NVEQAF+ +A EIK +M +Q   N  + P TVQ++GQP+ + +G
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPTVQIRGQPVNKKSG

Query:  CC
         C
Subjt:  CC

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C1.5e-9988.12Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   ++PPTVQIRGQPVN++SGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A3.9e-10088.61Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVK
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQIRGQPVN++SGCC
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCC

Query:  SS
        SS
Subjt:  SS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTCCTGAATATGATTATTTGTTTAAGCTCTTGCTTATTGGTGACTCTGGTGTTGGAAAATCTTGTCTTCTTCTGAGGTTTGCAGATGATTCATATTTGGATAGCTA
CATTAGCACCATCGGGGTTGACTTCAAAATCCGCACAGTGGAACTCGATGGGAAGACTATTAAGCTCCAAATATGGGATACTGCTGGCCAAGAGCGTTTTAGAACAATAA
CCAGCAGCTACTACCGTGGTGCTCACGGCATTATTGTTGTCTATGATGTCACAGACCAAGACAGTTTCAATAATGTCAAGCAATGGTTAAATGAAATTGATCGTTATGCA
AGCGAAAACGTGAACAAGCTTCTTGTGGGCAATAAGTCTGACCTTACGGCAAACAAAGTTGTGTCCCATGAGACAGCGAAGGCATTCGCGGATGAAATTGGGATTCCCTT
TATGGAAACAAGTGCTAAAAGTGCCACGAACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATGGCGACTCAACCAATGAACAATGCGCGGCCGC
CAACTGTGCAAATTCGAGGACAGCCTGTGAACAAAAAGTCTGGTTGCTGCTCATCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATTTTCAAATTTATTGCGCTGCAGATTTCTAGGTTCTTCAGAAACGCAAATCCAAATCATTCTCCTTCTTCATCTTTCACTTTCATTCAACAAATCCGTCTTCTCCGGT
GAATTCCTCCGCATTCCGATCGAAACTCGCCGGGAAAATTCACGCCTCTCCAGTACTGTGGTGAATTCTCTCTGATTCCGTCGATCTCCGCTGCTCATCGCCATGACTCC
TGAATATGATTATTTGTTTAAGCTCTTGCTTATTGGTGACTCTGGTGTTGGAAAATCTTGTCTTCTTCTGAGGTTTGCAGATGATTCATATTTGGATAGCTACATTAGCA
CCATCGGGGTTGACTTCAAAATCCGCACAGTGGAACTCGATGGGAAGACTATTAAGCTCCAAATATGGGATACTGCTGGCCAAGAGCGTTTTAGAACAATAACCAGCAGC
TACTACCGTGGTGCTCACGGCATTATTGTTGTCTATGATGTCACAGACCAAGACAGTTTCAATAATGTCAAGCAATGGTTAAATGAAATTGATCGTTATGCAAGCGAAAA
CGTGAACAAGCTTCTTGTGGGCAATAAGTCTGACCTTACGGCAAACAAAGTTGTGTCCCATGAGACAGCGAAGGCATTCGCGGATGAAATTGGGATTCCCTTTATGGAAA
CAAGTGCTAAAAGTGCCACGAACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATGGCGACTCAACCAATGAACAATGCGCGGCCGCCAACTGTG
CAAATTCGAGGACAGCCTGTGAACAAAAAGTCTGGTTGCTGCTCATCTTAAAAGAAAAAAGAGGAGAGATCTCTCTATGATTAGCACTGTAACCGTATGGTTGGTTGGTC
ACGACGCGCATGTAAAACTCTTTGGATTAGCTTTTCTTCTAAAGCTTTGTTTTGTTTTCTTCTCTCCACCATTTACTTTCTTGATCAGCACTTTGTTTAAAGTTCCCATT
CTTTTCAATGTATTTGATTATCATAACC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYA
SENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNKKSGCCSS