; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12275 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12275
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionhelicase protein MOM1 isoform X3
Genome locationCarg_Chr01:2628056..2628572
RNA-Seq ExpressionCarg12275
SyntenyCarg12275
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607145.1 Helicase protein MOM1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.8e-53100Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

KAG7036831.1 Helicase protein MOM1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.8e-53100Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

KAG7036832.1 hypothetical protein SDJN02_00452, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-56100Show/hide
Query:  MQIKSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLH
        MQIKSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLH
Subjt:  MQIKSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLH

Query:  HLLKPEISQLCQILKFPVWV
        HLLKPEISQLCQILKFPVWV
Subjt:  HLLKPEISQLCQILKFPVWV

XP_022949439.1 helicase protein MOM1 isoform X1 [Cucurbita moschata]9.8e-53100Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

XP_022949441.1 helicase protein MOM1 isoform X2 [Cucurbita moschata]9.8e-53100Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GC12 helicase protein MOM1 isoform X34.7e-53100Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

A0A6J1GC13 helicase protein MOM1 isoform X24.7e-53100Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

A0A6J1GCT4 helicase protein MOM1 isoform X14.7e-53100Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

A0A6J1K931 helicase protein MOM1 isoform X36.4e-5095.61Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        K EIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDE LTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLS SSLTANDI KILDYKSVGFDA+RKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

A0A6J1KDL3 helicase protein MOM1 isoform X16.4e-5095.61Show/hide
Query:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL
        K EIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDE LTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLS SSLTANDI KILDYKSVGFDA+RKLIDLRKSLHHLL
Subjt:  KSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLL

Query:  KPEISQLCQILKFP
        KPEISQLCQILKFP
Subjt:  KPEISQLCQILKFP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAATCAAATCGGAGATTGAGGAATCTTTGAGGAAACGTAAAAAGGTGTCAAATAGCAATGTAAAAGTTGCACAAGATGAATACTTAACTAACAAGGAAAAAGAAGA
TACTTCTGAAGCTCCAAAACATACATGCCAAAATTCAACTAGTTTAGCTGCTTGTGAGGATGATTCATACATTGAGAATCATCTGTCCAAATCATCTTTGACAGCTAATG
ATATCTCAAAAATTCTTGACTATAAGTCAGTTGGATTTGATGCAGTAAGAAAGCTGATTGATCTACGAAAGAGTCTCCATCATCTTTTGAAGCCTGAAATATCTCAGTTA
TGCCAGATTTTGAAATTTCCAGTATGGGTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAATCAAATCGGAGATTGAGGAATCTTTGAGGAAACGTAAAAAGGTGTCAAATAGCAATGTAAAAGTTGCACAAGATGAATACTTAACTAACAAGGAAAAAGAAGA
TACTTCTGAAGCTCCAAAACATACATGCCAAAATTCAACTAGTTTAGCTGCTTGTGAGGATGATTCATACATTGAGAATCATCTGTCCAAATCATCTTTGACAGCTAATG
ATATCTCAAAAATTCTTGACTATAAGTCAGTTGGATTTGATGCAGTAAGAAAGCTGATTGATCTACGAAAGAGTCTCCATCATCTTTTGAAGCCTGAAATATCTCAGTTA
TGCCAGATTTTGAAATTTCCAGTATGGGTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQIKSEIEESLRKRKKVSNSNVKVAQDEYLTNKEKEDTSEAPKHTCQNSTSLAACEDDSYIENHLSKSSLTANDISKILDYKSVGFDAVRKLIDLRKSLHHLLKPEISQL
CQILKFPVWV