; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12297 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12297
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationCarg_Chr01:2770660..2773431
RNA-Seq ExpressionCarg12297
SyntenyCarg12297
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022948420.1 uncharacterized protein LOC111452109 [Cucurbita moschata]1.1e-83100Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_022998903.1 uncharacterized protein LOC111493423 [Cucurbita maxima]1.5e-8096.95Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+EIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023522036.1 uncharacterized protein LOC111785907, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.2e-7397.97Show/hide
Query:  IRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSD
        IRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSD
Subjt:  IRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSD

Query:  ENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        ENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  ENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023522425.1 uncharacterized protein LOC111786358, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-7396.67Show/hide
Query:  KIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKL
        ++IRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKL
Subjt:  KIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKL

Query:  SDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        SDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  SDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023525360.1 uncharacterized protein LOC111788983 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.2e-8298.17Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVE3 Uncharacterized protein9.0e-7187.2Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLF S  KI+R+ K  N+GL LLD+NP+SAD+KLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNK+SEA E+PL  CEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGG+GT NS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A1S3CIP4 uncharacterized protein LOC103501412 isoform X25.8e-7086.59Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLF S  KI+R  K  NHGL LL++ P+SAD+KLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA E+PL  CEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGG+GT +S
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A6J1DHB6 uncharacterized protein LOC1110204491.1e-6885.37Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTP   S  KIIR PK IN GL  LD+NP+ AD+KLQGG+RTL +ASSLPETAASVAIAATVVGAAAT LSRRNK SEA+EIPLR CEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSC+TCGG+GT NS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A6J1G9T1 uncharacterized protein LOC1114521095.4e-84100Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A6J1KI37 uncharacterized protein LOC1114934237.4e-8196.95Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+EIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G45050.1 unknown protein6.0e-2754.33Show/hide
Query:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEG
        F SS   ++D + +N  L+             Q  +R+  +  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E  ++ CE C GSG+C ECKGEG
Subjt:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEG

Query:  FVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTA
        FVLKKLSD NAE+ARLAAKNMATR+TA
Subjt:  FVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTA

AT3G45050.2 unknown protein1.8e-3957.89Show/hide
Query:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEG
        F SS   ++D + +N  L+             Q  +R+  +  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E  ++ CE C GSG+C ECKGEG
Subjt:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEG

Query:  FVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        FVLKKLSD NAE+ARLAAKNMATR+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  FVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG

AT3G45050.3 unknown protein1.8e-3957.89Show/hide
Query:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEG
        F SS   ++D + +N  L+             Q  +R+  +  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E  ++ CE C GSG+C ECKGEG
Subjt:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEG

Query:  FVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        FVLKKLSD NAE+ARLAAKNMATR+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  FVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG

AT3G45050.4 unknown protein1.8e-3957.89Show/hide
Query:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEG
        F SS   ++D + +N  L+             Q  +R+  +  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E  ++ CE C GSG+C ECKGEG
Subjt:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEG

Query:  FVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        FVLKKLSD NAE+ARLAAKNMATR+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  FVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTGACTCTGCCTACACCCTTGTTTGCCTCCTCCTCCAAGATAATTAGGGATCCTAAGCTAATCAACCATGGACTTCGGTTGTTGGACACCAATCCTATTTCAGC
CGATTTGAAGCTACAAGGAGGGAGAAGAACACTGCCTATAGCTTCTTCCCTACCTGAAACAGCTGCTTCTGTGGCCATTGCTGCTACAGTTGTAGGTGCAGCAGCCACCT
TCCTTTCCAGAAGAAACAAAGATTCTGAGGCGAAGGAGATTCCTTTGAGACCATGTGAAGACTGTGGAGGTTCAGGCCTGTGTTCTGAATGCAAAGGTGAAGGGTTTGTG
CTGAAGAAACTGTCGGATGAAAATGCAGAGCGGGCACGGTTGGCTGCGAAGAACATGGCCACTCGGTTCACCGCAGCGCTTCCTAAAAAATGGAGCTACTGTTCCAAGTG
TTCTTCTGCTCGTTCTTGTAGTACTTGTGGTGGCACGGGGACGTTCAACTCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGAATAGCGGAACAAGAAGCAGGTAGAGAATTTTCTTTGTTCTGCGCGAAAGAACTCACAATTCCTTCTCAATGGAGCTGACTCTGCCTACACCCTTGTTTGCCTCCTC
CTCCAAGATAATTAGGGATCCTAAGCTAATCAACCATGGACTTCGGTTGTTGGACACCAATCCTATTTCAGCCGATTTGAAGCTACAAGGAGGGAGAAGAACACTGCCTA
TAGCTTCTTCCCTACCTGAAACAGCTGCTTCTGTGGCCATTGCTGCTACAGTTGTAGGTGCAGCAGCCACCTTCCTTTCCAGAAGAAACAAAGATTCTGAGGCGAAGGAG
ATTCCTTTGAGACCATGTGAAGACTGTGGAGGTTCAGGCCTGTGTTCTGAATGCAAAGGTGAAGGGTTTGTGCTGAAGAAACTGTCGGATGAAAATGCAGAGCGGGCACG
GTTGGCTGCGAAGAACATGGCCACTCGGTTCACCGCAGCGCTTCCTAAAAAATGGAGCTACTGTTCCAAGTGTTCTTCTGCTCGTTCTTGTAGTACTTGTGGTGGCACGG
GGACGTTCAACTCTTAGTCTTACAACCCGACAAACTCCTTATATCTCCGCATATTTTTCTGTCTCGTAAATTTCTCTCATTAGGAGTGTTCAAAGAATTCGATGACTCAC
AAAATTTAATCAACCCAATCTAATTCGTATGACTCGGATGGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFV
LKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS