CuGenDBv2

Gene ID	Carg12338
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	40S ribosomal protein S15a
Genome location	Carg_Chr01:3021470..3023275
RNA-Seq Expression	Carg12338
Synteny	Carg12338
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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KAB1217918.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Morella rubra]

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XP_013457334.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Medicago truncatula]

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XP_022134546.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Momordica charantia]

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XP_022949003.1 40S ribosomal protein S15a-1-like [Cucurbita moschata]

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A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6J1FJB0 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6J1GAW0 40S ribosomal protein S15a-1-like

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A0A6J1I5M1 40S ribosomal protein S15a-1-like

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I3SJY8 Putative ribosomal protein S8

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O80646 40S ribosomal protein S15a-3

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P42798 40S ribosomal protein S15a-1

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Q00332 40S ribosomal protein S15a

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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a

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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-4

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AT1G07770.1 ribosomal protein S15A

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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A

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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein

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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D

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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein

9.2e-71

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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TCTTATGGTTATGCAGAAGCACGGATATATTGGGGAATTTGAGTATGTCGACGATCATAGATCTGGAAAAATTGTTGTTGAACTCAACGGTAGGCTGAACAAGTGTGGGG
TTATTAGTCCTCGTTTTGATGTGGGTGTCAAGGAAATCGAAGGCTGGACTGCTAGGCTGCTCCCTTCCAGACAGTTTGGATTCATTGTGCTGACAACATCTGCGGGAATT
ATGGATCATGAAGAGGCTAGAAGGAAGAACGTTGGAGGGAAAGTCCTTGGTTTCTTCTATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TTTGTTCATAGTTGAAGCTGACGGACGCCTCCTTCTGTGATCCAGGTACTCCTCTCATCTCTTCAACTCCTCTCAGATCGACCTCTGTTCTACAGTTTTGAACTTGTGCG
TCTCTTTTAGCATTGATTGAACTATTAAATGGTTATTGTAATCACTGGTTCGTCGATGGGGACTCCATTTCGTTGTCGAATGCGGATTATAAATGCAATTACGTTTGGAT
TTTTGGTAGTGACTGTAGTATTTTAGCAACGGATTTTCAATGTGTTGGAGTTTTTGCTTTTGGTTTGCTTGTTTTCGTAGACATGTTTTGGATGCGATGATCAAGGATAG
ATTTTAACGTTTTTGTGGTTTTTTTTTCCTCTCTTTCTCTGCTTCATCTGGAAATCATATGAAGCTTTTAATTTGGAAGGATGGTGAGAATTAGTGTCTTGAACGACGCT
CTTAAGAGCATGTACAATGCAGAGAAGAGGGGGAAACGACAGGTCATGATCAGGCCTTCCTCTAAAGTGATCATCAAGTTTCTTATGGTTATGCAGAAGCACGGATATAT
TGGGGAATTTGAGTATGTCGACGATCATAGATCTGGAAAAATTGTTGTTGAACTCAACGGTAGGCTGAACAAGTGTGGGGTTATTAGTCCTCGTTTTGATGTGGGTGTCA
AGGAAATCGAAGGCTGGACTGCTAGGCTGCTCCCTTCCAGACAGTTTGGATTCATTGTGCTGACAACATCTGCGGGAATTATGGATCATGAAGAGGCTAGAAGGAAGAAC
GTTGGAGGGAAAGTCCTTGGTTTCTTCTATTGAACATGGTTTTGAGCCACACCCATTATGGAATTTTGACATAGCTTTCGCATAGTACTATATTTTCTCGGTAAAGAAAG
ATCTTATCCTGTAATAACTAGATTTTGTGTTGCCAGTAATTTAATTCCAAGATAATTTGATTGTTTTGGTCAAGACATTTTGGTTTTTTTAAATTATATTGGAAGAGAAC
CATTGCTTTTTGAATCCCTCAAGTGTCTTTCTATTGGCACCCAACACTTTGTTCTCTGTTACATTTAAGTTCTGAAGTAATATCAAATTTTGTTTGAGCAGGCCGATTTA
AAAGCTGTGGCTTTTATTTTATTCTTTGTTTCCGATGTGAATGACCGATAGTGGTTATCTAATTAAAATGCCTATTGAGCATTTTAGTATTAATGTCTGGTGTTTTTTTG
GTAGGTTGAGATTAGTGTCGAATCTAGAAAAGTTTTGGGAGTAATTATAATTCAATCCCAAACCCAGATCAATTTGGAATGAGATTTTGAGATAAAGAACAAGTTATGCT
TCAATCTGTATCAAAATTGGACAACAAACTCATATTTTGATCAAATTCACACAAATTATCACGTTTACTTCAGAAAATGTTCGTATGTAACAAGAGACAAGATCAAGACT
CAAGACTGGTAGACCATTAAGATTGATTGAAGCTCCAT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVRISVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIIKFLMVMQKHGYIGEFEYVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDVGVKEIEGWTARLLPSRQFGFIVLTTSAGI
MDHEEARRKNVGGKVLGFFY

Carg12338 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome