; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12369 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12369
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionMitochondrial GTPase
Genome locationCarg_Chr01:3234992..3237949
RNA-Seq ExpressionCarg12369
SyntenyCarg12369
Gene Ontology termsGO:0042254 - ribosome biogenesis (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0000287 - magnesium ion binding (molecular function)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006169 - GTP1/OBG domain
IPR036726 - GTP1/OBG domain superfamily
IPR045086 - OBG-type GTPase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607242.1 putative GTP-binding protein OBGM, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-56100Show/hide
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KAG7036926.1 putative GTP-binding protein OBGM, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.4e-64100Show/hide
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XP_022948603.1 probable GTP-binding protein OBGM, mitochondrial [Cucurbita moschata]7.4e-5699.08Show/hide
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XP_022997993.1 probable GTP-binding protein OBGM, mitochondrial [Cucurbita maxima]4.5e-5396.33Show/hide
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XP_023522978.1 probable GTP-binding protein OBGM, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.2e-5598.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWW4 Uncharacterized protein4.0e-4783.93Show/hide
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A0A5D3CBS7 Putative GTP-binding protein OBGM3.7e-4581.25Show/hide
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        DFS+L HHI  S
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A0A6J1DCJ9 probable GTP-binding protein OBGM, mitochondrial2.1e-4885.71Show/hide
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A0A6J1G9R8 probable GTP-binding protein OBGM, mitochondrial3.6e-5699.08Show/hide
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A0A6J1KFJ2 probable GTP-binding protein OBGM, mitochondrial2.2e-5396.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B3EP74 GTPase Obg3.5e-0846.88Show/hide
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        + +D   +Y KGG+GGNGC S RR +    G PDGG+GGRGG+V L      + L DF   KH+
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F4HSD4 Probable GTP-binding protein OBGM, mitochondrial9.5e-3059.41Show/hide
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        V YL   +     PW+ + + +YSD   KK K+APLQE RM DRF +YA+GG+GG+GC S RRSR DR+G+PDGGNGGRGG+VILEC+ A+WDFS L+ H
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        I
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Q2GK25 GTPase Obg5.4e-0950.85Show/hide
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        ID   ++ KGG+GGNGC S RR +    G PDGGNGG GG+VILE S+A+      ++H
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Q2QZ37 Probable GTP-binding protein OBGM, mitochondrial3.7e-2666.67Show/hide
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        YY+  P  +K K APLQ R M+DRF + AKGGDGGNGC S RRSR DR G+PDGGNGGRGG+VILECS ++WDFS L+HH+  S
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Q2VZU2 GTPase Obg3.5e-0853.85Show/hide
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        + +D+  ++ K GDGG GC S RR +    G PDGG+GGRGG+VILEC A L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07615.1 GTP-binding protein Obg/CgtA6.8e-3159.41Show/hide
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        V YL   +     PW+ + + +YSD   KK K+APLQE RM DRF +YA+GG+GG+GC S RRSR DR+G+PDGGNGGRGG+VILEC+ A+WDFS L+ H
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        I
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AT5G18570.1 GTP1/OBG family protein2.0e-0646.15Show/hide
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        R  DR  +Y + GDGGNG  + RR +    G P GG+GGRGGNV +E   ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGTTTTTGTGCGTAAAACAAGTTCTATATTTGAGAGGCTTGAGAGAAACCTCAAGTTTTCCATGGCTTTTTTCTGCCATTTCCTATTACTCAGATACTCCCTCAAA
GAAGTCTAAACTTGCCCCTTTACAGGAGAGGAGAATGATAGACAGGTTTATGATGTATGCCAAAGGAGGTGATGGTGGAAATGGATGCCATAGCACTCGCCGTAGTAGGC
AGGATCGCCACGGCCAACCTGATGGTGGAAATGGTGGAAGGGGGGGCAATGTCATTCTTGAATGTTCCGCTGCTCTCTGGGACTTCAGCAGTTTGAAGCATCATATTGTA
TGTTCGACTCTTATACTCATGCTAGAAACAACTCGGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAATACAAAATTCTAATTTATTTTTATTAATTTAGGCTAAAAAAACCAAATTGTCACTCTTTTTCCTCCCTTGTACCCAGCCGCGCGCCAACCCCTTAGCGGTCGTAC
TCGTCCAGAAGCTACCCACTAGTCATCTTAGTAGACGGCGTCCTACCGGCCTGCTGCGACCACGAGCGGCGGGGAACGACGACCCTGCGCGTTTCCTCTTCCAGCGACTG
ATACTCCAAACGGAGACGCGAATCACCTGCGGTGCATCTGTCGGCGGCAGCGCTCCATTCTGAAATACCGGCACACTTCGCTTCTCTATCTCCGGTGATTCACGACGGTA
GCACCCACGGCGAATAGCTGCGTGATCTCCTCCTAGAGACAAAATTTGAGCTAGGAGATAGTGAGCCATAACCCGAACGACACCCTGGATAGAACACCCATAGCCTTTAG
GGTTCAAATCTACAAAATTGAACTCATTCGAACTCAATCCTGCAAAGACTCGAGCTTTACGATCTCTTTATTCTAGTTCAAACTTTACAACTTTCCAAAGCATGGATGAT
GTTTGAGGCGCGAGAGAAGGGAGAACGATGAGGTTTTTGTGCGTAAAACAAGTTCTATATTTGAGAGGCTTGAGAGAAACCTCAAGTTTTCCATGGCTTTTTTCTGCCAT
TTCCTATTACTCAGATACTCCCTCAAAGAAGTCTAAACTTGCCCCTTTACAGGAGAGGAGAATGATAGACAGGTTTATGATGTATGCCAAAGGAGGTGATGGTGGAAATG
GATGCCATAGCACTCGCCGTAGTAGGCAGGATCGCCACGGCCAACCTGATGGTGGAAATGGTGGAAGGGGGGGCAATGTCATTCTTGAATGTTCCGCTGCTCTCTGGGAC
TTCAGCAGTTTGAAGCATCATATTGTATGTTCGACTCTTATACTCATGCTAGAAACAACTCGGAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRFLCVKQVLYLRGLRETSSFPWLFSAISYYSDTPSKKSKLAPLQERRMIDRFMMYAKGGDGGNGCHSTRRSRQDRHGQPDGGNGGRGGNVILECSAALWDFSSLKHHIV
CSTLILMLETTRK