; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12397 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12397
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAdenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein
Genome locationCarg_Chr01:3375275..3377752
RNA-Seq ExpressionCarg12397
SyntenyCarg12397
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036954.1 hypothetical protein SDJN02_00574 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-179100Show/hide
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XP_022948629.1 uncharacterized protein LOC111452251 [Cucurbita moschata]1.1e-17899.7Show/hide
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XP_022998907.1 uncharacterized protein LOC111493430 [Cucurbita maxima]1.7e-17196.44Show/hide
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XP_023523141.1 uncharacterized protein LOC111787388 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-17598.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C665 uncharacterized protein LOC103497120 isoform X13.3e-12874.79Show/hide
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A0A5A7SMB3 Uncharacterized protein4.3e-12874.79Show/hide
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A0A5D3BEB2 Uncharacterized protein3.3e-12874.79Show/hide
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A0A6J1GAG3 uncharacterized protein LOC1114522515.4e-17999.7Show/hide
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A0A6J1K9A6 uncharacterized protein LOC1114934308.3e-17296.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G59050.1 unknown protein1.2e-1630.06Show/hide
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        P GPS+EPSPP TP           + + TK++          K   +    +SIQ   Q  +       +     L ++ R  +     Q+  + + A 
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           GS S+  SG       GTGVFLPR H     S          KK+G STV+IP RV++AL++H++++         I  F  AL      ++  +  
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          +   V+   P     +AE +  +   DLPQEWTY
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AT5G59050.2 unknown protein1.4e-0940.35Show/hide
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Query:  PEGPSKEPSPPTTP
        P GPS+EPSPP TP
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGTCGACCCAGAAGCCGGAGAGTTCAAGTTTTACACTCAGTTTCAGACAGAGCATGGAGATAATAAGCAGAGCCCCTTTGAAGGAGACAATTGGTCGAGCTATTT
CTCGCCGGTGGAGTCTGAGATTGGTTCCTTTGAAATTGAGAGCGATAAAGATGATGGTGACGGCGGCGACGAGGATTACACGGCGGAATTGAGTCGTCGGATGGCTCAAT
TCATGCTTCAAGATGATGATAACTCCTCAACTGCAAGATTTCAATCAGAGATTCAGAATAAGTCATGGGGTTTGTCTGGTTCGCCTATTTCAACGCTGTGGTCACCTTTA
GGCTCGAGCAATGGAAGCAGCTATGGCAGCCCAGAAGGGCCTTCGAAGGAGCCGTCGCCGCCAACCACACCGATGGTTGCAGAGCGGCGGGGGCTCGACATATCACAGAA
CGTTTTCACCAAATTAGAGAAGATGAAGAAGGTTAGCACAAATGGTAAATCAATCCAAACAAGGCCCCAAGATGAAGAAAATGGATCCTCTTCTTCTTCCAAAGACCAAA
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AGGCTCCTCCACTGTTCTCATACCCGTGAGAGTCTTACAAGCCTTACAACTTCACTACAACAGAATGGACGACGAGACAAGACAAAAAATCACAGGCTTCACAGCACTTA
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CCGCAAGAATGGACATATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATAATTATAATAATTAGGATTATGCTTACTATTATTGTCAGTTACACCATATTTATCTTAGTCAAATCTACACTTAATAATACACAAATTTCAATGAGATTATTTATTT
TGAACACTGACCGAAACGCCACGGCTGTGCTCCGGCGAACGGACCACCACTGTAACCGTAAAAATATTTCGTTGGAGTGTTTCATAAAATACTCTGATCTCTCTGTTTAT
TGGTCGGTCCCTCCACTTGTTCCTACTCTATAAAGTCCAGACTTACGGCGCATAAATTTCCAATTCTGTCGCTCTTTCTTATTGTCTCTGTATCAGCACCAAGGTGCGGC
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TGGGTC
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