; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12522 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12522
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionLegume-specific protein
Genome locationCarg_Chr14:496766..497035
RNA-Seq ExpressionCarg12522
SyntenyCarg12522
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044116.1 legume-specific protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-3085.71Show/hide
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KAE8650999.1 hypothetical protein Csa_002313 [Cucumis sativus]3.0e-3088.64Show/hide
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KAG6580521.1 hypothetical protein SDJN03_20523, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-3998.88Show/hide
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KAG6596392.1 hypothetical protein SDJN03_09572, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-2777.17Show/hide
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KAG7017269.1 hypothetical protein SDJN02_19132, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-39100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD26 Uncharacterized protein1.0e-3188.89Show/hide
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A0A0B2P904 Uncharacterized protein2.5e-1962.77Show/hide
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A0A5D3DNC7 Legume-specific protein8.4e-3185.71Show/hide
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C6SZB5 Uncharacterized protein5.7e-1962.77Show/hide
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K7MT87 Uncharacterized protein3.9e-2063.83Show/hide
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        MEG+IPFVYKAI+QYK +K    I SWLC+SPS SY+RLP+GDSGRFQ      S+SAASPSS +  SS+ TQI++S+GVQSP + LT RR+AA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37750.1 unknown protein1.1e-0641.86Show/hide
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        MEG+IP VYKA++Q  Y NE Q            S+ Y+RLP GDSGRF       + P S      S+S++TT   +  GVQSP+
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AT5G02090.1 unknown protein4.6e-0548Show/hide
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        MEG+IPF+YKAIV YK E    ++      SPS +  Y+RLP   S RF+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGGTATAATTCCCTTTGTCTACAAAGCGATTGTTCAATACAAGAACGAAAAACAAGTACCGGCGATTCGATCATGGCTCTGCGACTCCCCGTCCACGTCCTACAT
CAGACTTCCCAGCGGTGATTCCGGCCGATTTCAAGACGGTTCATATTCCGCCGCCTCACCTTCTTCCAAATCAGCCTCTTCCACTACCACCCAGATTCTGATTTCCACTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGGTATAATTCCCTTTGTCTACAAAGCGATTGTTCAATACAAGAACGAAAAACAAGTACCGGCGATTCGATCATGGCTCTGCGACTCCCCGTCCACGTCCTACAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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