; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12772 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12772
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr09:4968983..4970048
RNA-Seq ExpressionCarg12772
SyntenyCarg12772
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR040411 - Uncharacterized protein At5g23160-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591997.1 hypothetical protein SDJN03_14343, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.6e-13799.6Show/hide
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KAG7024872.1 hypothetical protein SDJN02_13691 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-137100Show/hide
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XP_023535127.1 uncharacterized protein LOC111796643 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-12995.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SZR0 Uncharacterized protein2.5e-6461.51Show/hide
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A0A6J1F8B9 uncharacterized protein LOC1114430633.0e-13498.02Show/hide
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A0A6J1IG36 uncharacterized protein LOC1114769241.3e-12492.09Show/hide
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A0A6J1IWY5 uncharacterized protein LOC111480657 isoform X19.0e-6257.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTTTCCATTCATGACGGTGAGAGACAATGTGCTGCCGGTGGATCGAGGCGATGAAGATTCCAGTCGCTGGAAAAAGAAAGGCGGTCGCGGTGCTTGGTCGCGGGCGGTTA
GGGCTGTCATATTCGGAACTTCATTGGCAAAGAAGATTGCGAAAAGGAAAGCGAAACATTATCAAAATTCGAAGGAGTCTCAAAGGCATCTAGCTCCGTCCTGGTTTAGC
AGCAGATCAAGAAGTGGTTCAGATCTAAATTACCGCAACTATTCTACCCGTAGTTCTGAGCCATTTTCATCCTCCTCGTTCTACAGTTCGTCTCCTTCCTCCACGGAAAA
AAGCGACTCATCATTTCGACTCTATCCAACTGCATCGAATCGACTATACACACAGATTAATTTCAGAAAAATCTTCAGCGGTTGGTTTGTGCTACTGGTATGTCTTCTAA
GCTTGGTTTTATGGGGGAAAACCGGAGCTATTATCTGCACTTCGGTTTGGCTTCTCTGTTGGTACCGCTGGAGGTTCGGATTCAGGTCACCGGACGACAAGGCCAGTACG
GTGGCGATGAGTTCCGGCGAATACAACGACATAGAGATCATGGAAGAATTTCTGAAGCGAGACCGTTTAGCTGCTCGGAATTCAACCTTACGCATTGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACGCCATCCACTCGTCTCCTCCATGAACCCAACACCAACTGTTCTTCAAGTTCAGATTCTCATTCTCAAATTCCATTACACTTTCTAGCCTCCAAAATGCCTCGCTAAA
TCCTCGAAAACTGCTCAGAGATTCGAGTTTTGAGTTTTATGTCAAATGGAGTCCATCGTTGTAACCAAATCCAAGAAGAGGAACAAATTGTTTCCGTGTTTCCGAGCGGC
GGCCTCCGGTAGCCCTGTCGGCCATGGCGCTCCAGAGAAGCAGGTTTTTCCATTCATGACGGTGAGAGACAATGTGCTGCCGGTGGATCGAGGCGATGAAGATTCCAGTC
GCTGGAAAAAGAAAGGCGGTCGCGGTGCTTGGTCGCGGGCGGTTAGGGCTGTCATATTCGGAACTTCATTGGCAAAGAAGATTGCGAAAAGGAAAGCGAAACATTATCAA
AATTCGAAGGAGTCTCAAAGGCATCTAGCTCCGTCCTGGTTTAGCAGCAGATCAAGAAGTGGTTCAGATCTAAATTACCGCAACTATTCTACCCGTAGTTCTGAGCCATT
TTCATCCTCCTCGTTCTACAGTTCGTCTCCTTCCTCCACGGAAAAAAGCGACTCATCATTTCGACTCTATCCAACTGCATCGAATCGACTATACACACAGATTAATTTCA
GAAAAATCTTCAGCGGTTGGTTTGTGCTACTGGTATGTCTTCTAAGCTTGGTTTTATGGGGGAAAACCGGAGCTATTATCTGCACTTCGGTTTGGCTTCTCTGTTGGTAC
CGCTGGAGGTTCGGATTCAGGTCACCGGACGACAAGGCCAGTACGGTGGCGATGAGTTCCGGCGAATACAACGACATAGAGATCATGGAAGAATTTCTGAAGCGAGACCG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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