; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12812 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12812
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionInositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase 4 isoform 1
Genome locationCarg_Chr09:5252567..5253698
RNA-Seq ExpressionCarg12812
SyntenyCarg12812
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592035.1 hypothetical protein SDJN03_14381, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-11593.07Show/hide
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KAG7024911.1 hypothetical protein SDJN02_13731, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-142100Show/hide
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XP_022936433.1 uncharacterized protein LOC111443054 isoform X1 [Cucurbita moschata]3.4e-11693.51Show/hide
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XP_022976474.1 uncharacterized protein LOC111476862 isoform X3 [Cucurbita maxima]3.0e-11290.48Show/hide
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XP_023535434.1 uncharacterized protein LOC111796872 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-11190.48Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BZM8 uncharacterized protein LOC1034949423.6e-8771.43Show/hide
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A0A5A7TWN0 Inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase 4 isoform 13.6e-8771.43Show/hide
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        EM  TFK+R           ++I  G+FLAL
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A0A6J1FD86 uncharacterized protein LOC111443054 isoform X11.7e-11693.51Show/hide
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A0A6J1FDN3 uncharacterized protein LOC111443054 isoform X23.3e-9692.23Show/hide
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A0A6J1INK6 uncharacterized protein LOC111476862 isoform X31.5e-11290.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70160.1 unknown protein4.3e-5648.9Show/hide
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AT4G27020.1 unknown protein1.4e-6754.35Show/hide
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AT5G54870.1 unknown protein1.7e-6854.78Show/hide
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        +SSS     + IL + +V  L+    +++K PF PRD+LP LPR+VSW IL+S    A+LLP ++G  SS   SV W+GACF++NTAWLEFHNKSGSE+G
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        GGTLHIK   AHS TC D+Y+FATPYR TW  YF+SR+HT+EF +W+GK E+EYVK +GVSIFLM AG+L +L+AL+ V PLF+N+ WGE SN+ FLE  
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTTCTTCTTGTTTGATTCCCAGAACTGTAATTCTTCTTGTTTTCATTGTGGGTTTTCTTCTTCCATTGCAACTGCAGGCCCTGAAATTGCCATTTTCTCCTCG
CGACATGCTTCCATTACTACCAAGAAAGGTGTCATGGCGGATTCTGAGCTCTTTCGAAAACCCCGCCAATCTTCTTCCGGCATACGTCGGAGCTGTCTCCTCTCCTGAGA
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GGAAGGAAAGGAAGAATTTGAATATGTTAAAAGGGAAGGGGTTTCAATTTTCCTGATGCAAGCTGGAGTGTTGAAAAGCCTTGAAGCACTGTACAGTGTCCTCCCTTTGT
TTGCAAACTCTGAATGGGGCGAGCAATCCAATATTAAATTTCTTGAGAATGAAATGAGTACCACCTTCAAGGAACGCCTCCTCTCAATGGAAGTAACCACGTCAATGTTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTTCTTCTTGTTTGATTCCCAGAACTGTAATTCTTCTTGTTTTCATTGTGGGTTTTCTTCTTCCATTGCAACTGCAGGCCCTGAAATTGCCATTTTCTCCTCG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NEITLGNFLALWFPQCNCSYQPHWGLALGELL