; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg12923 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg12923
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1-like
Genome locationCarg_Chr10:3758835..3762660
RNA-Seq ExpressionCarg12923
SyntenyCarg12923
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590067.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.9e-16799.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein2.1e-15895.75Show/hide
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A0A6J1EUL9 transcription factor Pur-alpha 1-like1.9e-15995.75Show/hide
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A0A6J1H823 transcription factor Pur-alpha 1-like4.3e-16799.67Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like2.3e-16096.09Show/hide
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A0A6J1JGC7 transcription factor Pur-alpha 1-like5.8e-16498.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha3.0e-1629.23Show/hide
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          L DD G                           +++   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha3.9e-1629.12Show/hide
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                    D+P   + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +          +   LP+Q   E  + 
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Q6PAC9 Transcriptional activator protein Pur-beta-A4.3e-1528.97Show/hide
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         L DD G     G     A                   G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Q8AVS4 Transcriptional activator protein Pur-beta-B5.7e-1529.05Show/hide
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        G   GG SGG  G   +        EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  +    F D    +I          PE    
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              G  DD G G  SG S   A    +              G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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GGCGGCGTGGCGGCAGGAGGAGTATCGGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGAGGGAACGACGTGGAGCTGATGTGCAAAACGCTGCAGGTGGAACACAAGCTTTTCTACTTCGA
TCTGAAGGAGAATCCCAGAGGCCGATATTTGAAGATATCAGAGAAAACATCGGCTACAAGGTCAACGATCATTGTTCCCTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCT
TCAATTACTATATCAATTCCGATGATCCAGAGGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTCGACACAAAGGTGTTTTATTTCGACATCGGCGAGAATCGGAGGGGTCGTTTCTTG
AAGGTATCTGAAGCTTCTGTTAGTCGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCTGGAAGCAACCGGGACGAGGGATGGTCTGCATTTAGGAACATTTTGGCAGAAATCAA
TGAAGCATCTAGGCTTTTCATGCTGCCCAGTCAGGAAAATTCTGAACATTCAGAACATCTTGTCGGACTTTCAGACGATGTCGGTGCAGGCTTCATATCAGGTCATAGTA
GTCAACCTGCTCCAACCTCTGACTTGAATGTAGATAGACAAGTAGACTTGTCAGCTCAAGATGACATGGGCAATCTGGGTGTTTCAAAAGTTATCCGAGCTGATCAGAAA
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