; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13032 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13032
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionLeucine-rich repeat family protein / extensin family protein
Genome locationCarg_Chr10:3120508..3121737
RNA-Seq ExpressionCarg13032
SyntenyCarg13032
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001611 - Leucine-rich repeat
IPR013210 - Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR032675 - Leucine-rich repeat domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589963.1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.6e-234100Show/hide
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XP_022960570.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita moschata]1.5e-23098.53Show/hide
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XP_022987724.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita maxima]1.2e-23099.02Show/hide
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XP_023515395.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-22998.78Show/hide
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XP_038878651.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Benincasa hispida]5.8e-19885.51Show/hide
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        LA+  D+D SSS P
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3CI93 Leucine-rich repeat extensin-like protein 48.8e-19281.29Show/hide
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        FP +T L+FF+LTN+P T+SF V +NGGIG+GVTIGGGGGG G  VWIGGNNG  TPRLNRAYTALQ+WKSAITSDPLGIL +WVGPNVCSY+GVFCAQV
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        +DE+TSS VDI+AGIDLNHANL GTLV ELSFLTEITLFHLN+NRFSGTVPESF+E+SSLQELDLSNN+FSGPFPI  LYIPNL+YLDLRFNDFHGPIPE
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        CGTL    ++D SSS P
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A0A6J1EUL1 leucine-rich repeat extensin-like protein 42.1e-19381.13Show/hide
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            PLVCGTLA++ D+D  SSSP
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A0A6J1H9G2 leucine-rich repeat extensin-like protein 67.4e-23198.53Show/hide
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A0A6J1JJN8 leucine-rich repeat extensin-like protein 65.6e-23199.02Show/hide
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        PDTDPSSSSP
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A0A6J1KT44 leucine-rich repeat extensin-like protein 42.0e-19180.9Show/hide
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        NFPI+T L+FFLLTN  ATE+FGV       +NGGIG+G+TIG GGG G   VWIGGN G       TPRLNRAY ALQAWKSAITSDPLGIL SWVGPN
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48809 Leucine-rich repeat extensin-like protein 22.5e-8749.09Show/hide
Query:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF
        + P L +AY ALQ+WK AI SDP     +W G +VCSY G+FCA      +S    ++AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LFHLNSNRF G VP +F
Subjt:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF

Query:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST
        K M  L ELDLSNN F G FP   L +P+L +LDLR+N+F G IP  LF+K+LDAIFLN+N F   +P+N+GNSP S + LA+N L G +P    L+G T
Subjt:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST

Query:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGF
        L EI+L N+ LTGC+P   G    + V D+SFN L G LP ++  +  ++ +N+ +NR +GV+P  IC L NL N T S NFF+G +  C     +N+  
Subjt:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGF

Query:  DFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC
        + S NCI G++ QR   ECS  PAS S++C
Subjt:  DFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC

Q9LHF1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 41.9e-8748.12Show/hide
Query:  GGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLF
        G  G +V +  +   + PRL  AY ALQAWK AI SDP  I  +W+G NVC+Y GVFC++  D   +  +  +AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LF
Subjt:  GGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLF

Query:  HLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNK
        H+NSNRF GTVP  FK++  L ELDLSNN F+G FP   L++P+L +LDLRFN+F G +P++LF+K LDAIF+N+N F  ELP+N G+SP SVI LANN 
Subjt:  HLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNK

Query:  LSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSG
          G +PT    +   L EI+ +NN L  C+P   G    + V DVSFN L+G LP+++  + E++ +N+ HN LSG +P  IC L  L N T S+NFF+G
Subjt:  LSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSG

Query:  LSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC
         +  C R S     FD   NC+PGR  QR   +CS   +  S++C
Subjt:  LSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC

Q9LJ64 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 12.9e-8347.15Show/hide
Query:  RLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEM
        RL RAY ALQAWK A  SDP     +WVGP+VCSYKGVFCA   D+ +   V ++AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LFH+NSNRF G +P+S  ++
Subjt:  RLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEM

Query:  SSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLRE
        + + E D+SNN F GPFP   L  P+L +LD+R+NDF G +P ++F+K LDAIFLNNN FE  +P+ +G S ASV+  A+NK SG +P     +   L E
Subjt:  SSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLRE

Query:  ILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFDFS
        I+ + N L+GC+P   G  + + V D S N  +G LP TLS L  ++ M+  +N+ +G + D IC L  L N T S+NFF+G +Q C   S +   FD +
Subjt:  ILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFDFS

Query:  GNCIPGRDMQRPRPEC
         NC+  R  Q+   EC
Subjt:  GNCIPGRDMQRPRPEC

Q9LUI1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 61.3e-8846.88Show/hide
Query:  PRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKE
        PRL +A+TALQAWK  ITSDP G   +W GPNVC+Y GVFCA   D   +  V  +AGIDLNHAN+AG L  EL  LT++ LFH+NSNRF G +P++ K 
Subjt:  PRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKE

Query:  MSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN-LPTGFSLLGSTL
        +  L ELD+SNN  SG FP     +P+L +LD+RFN+F G +P  LF+  LDA+F+N+N F+  LP+N+GNSP SV+ LANN L G+ +P  F  +G TL
Subjt:  MSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN-LPTGFSLLGSTL

Query:  REILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFD
         EI++ N+QLTGC+    GL +++ V DVS+N+L+G LP+T+  +  ++ +N+ HN+ SG +P+ IC L  L N T S+NFFSG    C R       FD
Subjt:  REILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFD

Query:  FSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP
           NC+P R MQR   EC    +         P+ C +   SP + P    P
Subjt:  FSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 31.2e-8447.27Show/hide
Query:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF
        + PRL  AY ALQAWK AI SDP     +W+G NVC+Y GVFC+   D   +  +  +AGIDLNHA++AG L  EL  L+++ LFH+NSNRF GTVP  F
Subjt:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF

Query:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST
          +  L ELDLSNN F+G FP   L +P+L +LDLRFN+F G +P++LF+K LDAIF+N+N F  ELP+N G+SP SVI LANN+  G +P+    +   
Subjt:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST

Query:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGF
        L EI+ +NN L  C+P   G    + V DVSFN L+G LP+++  +  ++ +N+ HN LSG +P  IC L  L N T S+NFF+G +  C R       F
Subjt:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGF

Query:  DFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC
        D   NC+PGR  QR   +C    +   +NC
Subjt:  DFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G62440.1 leucine-rich repeat/extensin 21.8e-8849.09Show/hide
Query:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF
        + P L +AY ALQ+WK AI SDP     +W G +VCSY G+FCA      +S    ++AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LFHLNSNRF G VP +F
Subjt:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF

Query:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST
        K M  L ELDLSNN F G FP   L +P+L +LDLR+N+F G IP  LF+K+LDAIFLN+N F   +P+N+GNSP S + LA+N L G +P    L+G T
Subjt:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST

Query:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGF
        L EI+L N+ LTGC+P   G    + V D+SFN L G LP ++  +  ++ +N+ +NR +GV+P  IC L NL N T S NFF+G +  C     +N+  
Subjt:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGF

Query:  DFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC
        + S NCI G++ QR   ECS  PAS S++C
Subjt:  DFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC

AT2G19780.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.8e-13363.49Show/hide
Query:  IGIGVTIGGGGGGGGASVWIGGNNGPQTP--------RLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHA
        IG+GV IGGG G  G  VWIGG N    P          N AY ALQ+WKSAIT DP G+L++WVG +VCSY+GVFC      S SS    I  IDLN A
Subjt:  IGIGVTIGGGGGGGGASVWIGGNNGPQTP--------RLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHA

Query:  NLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGE
        NL GT+V +LS L+++T+ HLNSNRFSG +P+SFK + SLQELDLSNN FSG FP  TLYIPNLVYLDLRFN+F G IPE+LFNK+LDAI LNNN F GE
Subjt:  NLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGE

Query:  LPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDL
        +P NLG S ASVINLANNKLSG +PT F + GS L+E+L LNNQLTGCIPE  GLFS+++V DVSFNSLMGH+PDT+SCL+EI+++NLGHN+ SG LPDL
Subjt:  LPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDL

Query:  ICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRI---PLVCGTLA
        +C+L+NL+NLTVSFNFFSG S +CS  S   +GFDF+GNCIPG+  QRP+P+CS +P  G L+C RI   PL C  ++
Subjt:  ICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRI---PLVCGTLA

AT3G22800.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein9.6e-9046.88Show/hide
Query:  PRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKE
        PRL +A+TALQAWK  ITSDP G   +W GPNVC+Y GVFCA   D   +  V  +AGIDLNHAN+AG L  EL  LT++ LFH+NSNRF G +P++ K 
Subjt:  PRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKE

Query:  MSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN-LPTGFSLLGSTL
        +  L ELD+SNN  SG FP     +P+L +LD+RFN+F G +P  LF+  LDA+F+N+N F+  LP+N+GNSP SV+ LANN L G+ +P  F  +G TL
Subjt:  MSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN-LPTGFSLLGSTL

Query:  REILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFD
         EI++ N+QLTGC+    GL +++ V DVS+N+L+G LP+T+  +  ++ +N+ HN+ SG +P+ IC L  L N T S+NFFSG    C R       FD
Subjt:  REILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFD

Query:  FSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP
           NC+P R MQR   EC    +         P+ C +   SP + P    P
Subjt:  FSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP

AT3G24480.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.4e-8848.12Show/hide
Query:  GGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLF
        G  G +V +  +   + PRL  AY ALQAWK AI SDP  I  +W+G NVC+Y GVFC++  D   +  +  +AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LF
Subjt:  GGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLF

Query:  HLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNK
        H+NSNRF GTVP  FK++  L ELDLSNN F+G FP   L++P+L +LDLRFN+F G +P++LF+K LDAIF+N+N F  ELP+N G+SP SVI LANN 
Subjt:  HLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNK

Query:  LSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSG
          G +PT    +   L EI+ +NN L  C+P   G    + V DVSFN L+G LP+++  + E++ +N+ HN LSG +P  IC L  L N T S+NFF+G
Subjt:  LSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSG

Query:  LSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC
         +  C R S     FD   NC+PGR  QR   +CS   +  S++C
Subjt:  LSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNC

AT4G29240.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein9.8e-13560.05Show/hide
Query:  NFPIVTCLVFFLLTNTPATESFGVDINGGIGIGVTIGGGGGGGGASVWIGG--NNG------PQTPRLNR-AYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVC
        NF ++ C   FL        SFGV    G G+GV IGGGGGGGG  VW+GG  NNG      P +   NR AY ALQ WKSA+  DP  +L++WVG +VC
Subjt:  NFPIVTCLVFFLLTNTPATESFGVDINGGIGIGVTIGGGGGGGGASVWIGG--NNG------PQTPRLNR-AYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVC

Query:  SYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLR
        SYKGVFC+             I  IDLNHANL GTLV +L+ L+++ + HLNSNRFSG +P+SFK ++SLQELDLSNN  SGPFP+ TLYIPNLVYLDLR
Subjt:  SYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLR

Query:  FNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLM
        FN   G IPE+LFNK+LDAI LNNN F GE+P+NLGNSPASVINLANN+ SG +PT F L GS ++E+LLLNNQLTGCIPE  G+FSE++V DVS+N+LM
Subjt:  FNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLM

Query:  GHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRI---
        GH+PDT+SCL+ I+I+NL HN+ SG +PDL+CSL+NL+NLTV+FNFFSG S ECS  S  + GFDF GNCIPGR+ QRP+P+CS   + G+++C RI   
Subjt:  GHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRI---

Query:  PLVCGTLA
        PL C  ++
Subjt:  PLVCGTLA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACTTCCCAATCGTCACTTGTCTCGTCTTCTTCCTCCTCACAAACACCCCTGCAACTGAAAGCTTCGGAGTAGACATCAATGGCGGAATCGGAATCGGCGTCACCAT
CGGCGGCGGTGGCGGAGGAGGAGGAGCAAGCGTTTGGATTGGGGGAAACAATGGACCCCAGACGCCGAGACTGAACAGAGCTTACACCGCACTCCAAGCATGGAAATCTG
CCATTACAAGCGATCCATTAGGGATTTTACGAAGTTGGGTCGGCCCCAATGTGTGTTCTTACAAAGGGGTTTTTTGTGCACAAGTTGAAGACGAATCAACGTCGTCCCTC
GTCGACATTATCGCCGGAATCGACCTGAATCATGCTAATCTCGCAGGTACTCTAGTGACAGAGCTCTCGTTTCTCACCGAAATCACTCTGTTTCATCTCAACAGCAACCG
ATTTTCCGGCACTGTGCCGGAATCCTTTAAAGAAATGTCATCACTTCAAGAATTGGACCTCAGCAACAACATGTTTTCAGGTCCATTTCCGATTGCCACATTATACATTC
CAAATCTGGTGTATTTAGACCTGAGATTCAACGATTTCCACGGCCCAATTCCTGAAGATCTCTTCAACAAAAAACTAGATGCAATTTTCCTCAATAACAACCATTTCGAA
GGCGAACTCCCTCAAAACCTGGGAAATTCCCCTGCTTCTGTGATTAATCTAGCTAACAACAAGCTAAGTGGCAATCTCCCAACTGGGTTTAGCCTCTTGGGTTCGACACT
GAGAGAAATCTTGCTTTTAAACAACCAATTAACAGGGTGTATTCCAGAAGGATTCGGGCTTTTCTCTGAAATGCAAGTGTTGGATGTGAGCTTCAATTCGTTAATGGGTC
ATTTGCCGGACACTCTGTCTTGTTTAAACGAAATCCAGATCATGAATTTGGGACACAACAGGCTTTCTGGTGTTCTTCCGGATTTAATCTGTTCGTTGAAAAACTTGGTG
AATCTGACGGTTTCTTTCAATTTCTTTTCTGGGTTGAGCCAAGAATGTTCGCGCCAATCTCTTGAGAATCTGGGCTTTGATTTCTCTGGAAATTGCATTCCTGGACGGGA
CATGCAGAGGCCTCGCCCTGAATGCTCTGTTCTTCCTGCTTCTGGGAGCTTGAATTGCCTTAGAATACCTCTTGTTTGTGGGACACTGGCTGATAGCCCAGACACTGATC
CCAGTTCTTCATCGCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACTTCCCAATCGTCACTTGTCTCGTCTTCTTCCTCCTCACAAACACCCCTGCAACTGAAAGCTTCGGAGTAGACATCAATGGCGGAATCGGAATCGGCGTCACCAT
CGGCGGCGGTGGCGGAGGAGGAGGAGCAAGCGTTTGGATTGGGGGAAACAATGGACCCCAGACGCCGAGACTGAACAGAGCTTACACCGCACTCCAAGCATGGAAATCTG
CCATTACAAGCGATCCATTAGGGATTTTACGAAGTTGGGTCGGCCCCAATGTGTGTTCTTACAAAGGGGTTTTTTGTGCACAAGTTGAAGACGAATCAACGTCGTCCCTC
GTCGACATTATCGCCGGAATCGACCTGAATCATGCTAATCTCGCAGGTACTCTAGTGACAGAGCTCTCGTTTCTCACCGAAATCACTCTGTTTCATCTCAACAGCAACCG
ATTTTCCGGCACTGTGCCGGAATCCTTTAAAGAAATGTCATCACTTCAAGAATTGGACCTCAGCAACAACATGTTTTCAGGTCCATTTCCGATTGCCACATTATACATTC
CAAATCTGGTGTATTTAGACCTGAGATTCAACGATTTCCACGGCCCAATTCCTGAAGATCTCTTCAACAAAAAACTAGATGCAATTTTCCTCAATAACAACCATTTCGAA
GGCGAACTCCCTCAAAACCTGGGAAATTCCCCTGCTTCTGTGATTAATCTAGCTAACAACAAGCTAAGTGGCAATCTCCCAACTGGGTTTAGCCTCTTGGGTTCGACACT
GAGAGAAATCTTGCTTTTAAACAACCAATTAACAGGGTGTATTCCAGAAGGATTCGGGCTTTTCTCTGAAATGCAAGTGTTGGATGTGAGCTTCAATTCGTTAATGGGTC
ATTTGCCGGACACTCTGTCTTGTTTAAACGAAATCCAGATCATGAATTTGGGACACAACAGGCTTTCTGGTGTTCTTCCGGATTTAATCTGTTCGTTGAAAAACTTGGTG
AATCTGACGGTTTCTTTCAATTTCTTTTCTGGGTTGAGCCAAGAATGTTCGCGCCAATCTCTTGAGAATCTGGGCTTTGATTTCTCTGGAAATTGCATTCCTGGACGGGA
CATGCAGAGGCCTCGCCCTGAATGCTCTGTTCTTCCTGCTTCTGGGAGCTTGAATTGCCTTAGAATACCTCTTGTTTGTGGGACACTGGCTGATAGCCCAGACACTGATC
CCAGTTCTTCATCGCCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNFPIVTCLVFFLLTNTPATESFGVDINGGIGIGVTIGGGGGGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSL
VDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFE
GELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLV
NLTVSFNFFSGLSQECSRQSLENLGFDFSGNCIPGRDMQRPRPECSVLPASGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP