; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13081 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13081
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionLin-54-like
Genome locationCarg_Chr04:3592169..3594544
RNA-Seq ExpressionCarg13081
SyntenyCarg13081
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600508.1 hypothetical protein SDJN03_05741, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.0e-8298.21Show/hide
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KAG7031146.1 hypothetical protein SDJN02_05185 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-90100Show/hide
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XP_023527861.1 uncharacterized protein LOC111790947 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.9e-7895.73Show/hide
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A0A0A0KUY4 Uncharacterized protein3.1e-6178.74Show/hide
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A0A6J1C7J9 uncharacterized protein LOC1110081426.1e-6580.95Show/hide
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A0A6J1J0C4 uncharacterized protein LOC111481538 isoform X21.9e-7491.46Show/hide
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A0A6J1J5I4 uncharacterized protein LOC111481538 isoform X16.5e-7590.96Show/hide
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No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G42070.1 unknown protein1.5e-2847.88Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCTCTGCGCTTCTCTCAGTTCCTGCGCCTCAGCGAGCTCCATTCTTCCACTCCTCCTATGCAACCACTCCGAGATTGTCTCATGGACCCAGAACTTCACTCAGATT
TTCATCATCTAGGGGCGTCAGCTTCCTCTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCTGTTGTAGATGAAGAAACAAATTCTTCTCCTCCCGACGACCTCTCTCTTC
AGTCTGAATCAGACCCTGATGCTTCTTCGTTCAGAGGATGCAAAGCCTGTGGAAAGGAAGAAATTGAGAGGGGATGCAATGGTGAGGGAAGGATACAAGGTGGCATTGCA
ACAGTCCCAGGTTTTGGTTGGTGGCCTATAAAGGCATACAGGCCTTGTCCTGAATTTGTAGCATCCGGTGGCAGATATAAGCGTCGTGGACAAAGCATGGACGAGGTTAC
ATCTGGAGGAGCAAGGACAGAAGCCTCTGCTGCTGGTGGCAAAAAGGACTCGTTGAGGTACAAGCCATATATCCCTTTCCTTATGAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAACGCAAATTGAAAACAAGCTAGAAATTATTAATTTGAAGATGGAAATTTCCAATCGACCTGGAATTCTGTGAGCCTCTAATTCCCCACCGGAGCAAAGAATATCCGTG
CCCCTGTTGTCTCGTGCCCACCACGCACAGATGGGCTCTGCGCTTCTCTCAGTTCCTGCGCCTCAGCGAGCTCCATTCTTCCACTCCTCCTATGCAACCACTCCGAGATT
GTCTCATGGACCCAGAACTTCACTCAGATTTTCATCATCTAGGGGCGTCAGCTTCCTCTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCTGTTGTAGATGAAGAAACAA
ATTCTTCTCCTCCCGACGACCTCTCTCTTCAGTCTGAATCAGACCCTGATGCTTCTTCGTTCAGAGGATGCAAAGCCTGTGGAAAGGAAGAAATTGAGAGGGGATGCAAT
GGTGAGGGAAGGATACAAGGTGGCATTGCAACAGTCCCAGGTTTTGGTTGGTGGCCTATAAAGGCATACAGGCCTTGTCCTGAATTTGTAGCATCCGGTGGCAGATATAA
GCGTCGTGGACAAAGCATGGACGAGGTTACATCTGGAGGAGCAAGGACAGAAGCCTCTGCTGCTGGTGGCAAAAAGGACTCGTTGAGGTACAAGCCATATATCCCTTTCC
TTATGAAGTAAATTCATATGTTTATATACTTTCAGAACTTGTAATGCTGCAATCTAACATGCTGCTCTTGTATACTGACTTGTAAAATGACCAAACCGAATGCTTGATAC
CAATTTTGTGAACTTGCTCACACCATAGGGATAAGAATAGCTGGAAGTTTGGCGAAAATAGCTTCTTCCATTTTTCTTTGGCTGGGAGAAATGAAAGTATTATCTCATTA
TCCGAGTACTGTAGGAGAGGAAGGCCATCTCGAAATGGCATGGTTGCTTTCATAACTGGTTTCTGGGTTGTCAGTAAAATTCTCTTGTTAGCTTCATTTTGTTCTCATTG
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TGAATTTCCTTCATGTTTTACTTCGAGTTTCTAACTTTTTAACGATACCGATTCATTCACTTTTCATTACGTCGTTTCGTCCAGCAAGAAAAAGTCGGCAAAGGGGTAAT
ATAGGCAGGCTTACCATCCACAAGTTGATACACAAACAGGGAGGGAATGAAGGATGGATGATGTAGAATTGGTTTCATGGAAATACTACATGTGAATGGGTGAAAACTGA
ACAACAAAATCTCATTGGGATTTTTCTGTATTGAAATTTGGCTAGATTCTCACTTCTTTTAGGCTTCTGTAACATCAGAATGCTGCATTTAAAGCACAGAAAATTTTCCA
ATCCATGGTTTGTTTGAAGCGTATCAAGATTCATTCTTTGCAGGATATTTTCTTTTCCAGTTCCTAACGGATGCCTTGTTCGTTCTCTCATGCCTAATTCTCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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