; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13125 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13125
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAquaporin NIP3-1
Genome locationCarg_Chr04:3309905..3311080
RNA-Seq ExpressionCarg13125
SyntenyCarg13125
Gene Ontology termsGO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0015267 - channel activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000425 - Major intrinsic protein
IPR022357 - Major intrinsic protein, conserved site
IPR023271 - Aquaporin-like
IPR034294 - Aquaporin transporter


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600453.1 putative aquaporin NIP5-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-14499.64Show/hide
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KAG7031102.1 putative aquaporin NIP5-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-170100Show/hide
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XP_022941934.1 probable aquaporin NIP5-1 isoform X1 [Cucurbita moschata]7.9e-15898.03Show/hide
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XP_022981954.1 probable aquaporin NIP5-1 [Cucurbita maxima]5.8e-15395.39Show/hide
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XP_023526319.1 probable aquaporin NIP5-1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-15797.7Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5N5GD74 Aquaporin NIP5-16.6e-7869.47Show/hide
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        PT GA+AGAA YTAVKL  +   + A
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A0A6J1FPW3 probable aquaporin NIP5-1 isoform X13.8e-15898.03Show/hide
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A0A6J1FV77 probable aquaporin NIP5-1 isoform X22.3e-13999.62Show/hide
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A0A6J1J391 probable aquaporin NIP5-12.8e-15395.39Show/hide
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A0A6P5S6G2 probable aquaporin NIP5-18.7e-7867.25Show/hide
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        + K+K+P     + ++GAEF+GT+I++FSA A PI+N+KY  AE  L+ +A C+GLAV+AVI S GHISGAHLNPSVT+AFAA RHFPW  VPLYITAQ+
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        S SISA+F+LK VF PFMSGG TVPSV  GQA A+EFIVTF LMF I AVATDTRAVGE+AG+AIG  V++N+LVAG  TGGSMNP RT+GPA+A  N++
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        GLWIY+VAPT GA+AGAA YT VKL  +T
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0IWF3 Aquaporin NIP3-11.2e-7164.81Show/hide
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        ++GAEF+GT+I++F A AAPI+N+KY  A +    +A CAGLAV  +ILS GHISGAHLNPS+T+AFAALRHFPWL VP Y+  Q+ GSI A F+LK VF
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         PF+SGG TV  P++ T QA   EFI+TF L+FV+ AVATDTRAVGELAGIA+G  V LNIL+AG  TGGSMNP RT+GPA+A  N++ LWIY++APT G
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        AVAGA  YTAVKLR +
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Q84S07 Aquaporin NIP3-31.1e-5047.58Show/hide
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        +L L+  IP    +  +V AEF GT+I++F+  +  I++E++++ E  L+  A  AGLAV  ++LS+ HISG HLNP++++A A   H P  H+  YI++
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Query:  QISGSISAAFSLKIVFRPFMSGGATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATEN
        QI G+++A+F++K ++ P   G  TVP+VGT +A  +EFI+TFFL+F+I A+ATD  AV EL  +A+G  VM+NILVAG +TG SMNPARTIG AIAT  
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Query:  FKGLWIYIVAPTAGAVAGAAGYTAVKL
        +  +W+Y+VA   GA+AG   Y A+KL
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Q9ATN1 Aquaporin NIP3-11.4e-6964.35Show/hide
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        ++GAEF+GT+I++F A AAPI+N+KY  A +    +A CAGLAV  VILS GHISGAHLNPS+T+AFAALRHFPWL VP Y+  Q   S+ AAF+LK VF
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         PF+SGG TVP  +V T QA   EFI++F L+FV+ AVATDTRAVGELAGIA+G  V LNILVAG  TGGSMNP RT+GPA+A  N++ LWIY++APT G
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Query:  AVAGAAGYTAVKLRQD
        A+AGA+ Y AVKLR +
Subjt:  AVAGAAGYTAVKLRQD

Q9SAI4 Aquaporin NIP6-15.8e-7160.61Show/hide
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        P + ++  ++GAEF+GT I++F+  A  I+N+K   AE  L+  A  AGLAVM VILS GHISGAHLNP+VT+AFAAL+HFPW HVP+YI AQ+  S+SA
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Query:  AFSLKIVFRPFMSGGATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYI
        AF+LK VF P MSGG TVP+VG  QA A+EFI++F LMFV+ AVATDTRAVGELAGIA+G  VMLNIL+AG AT  SMNP RT+GPAIA  N++ +W+Y+
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         AP  GA+ GA  YT VKL ++  A   RR+
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Q9SV84 Probable aquaporin NIP5-11.3e-7869.19Show/hide
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        ++GAEF+GT+I++F+A A PI+N+KY  AE  L+ +A CAGLAVM +ILS GHISGAHLNPS+T+AFAALRHFPW HVP YI AQ+S SI A+F+LK VF
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         PFMSGG T+PSV  GQA A+EFI+TF L+FV+ AVATDTRAVGELAGIA+G  VMLNILVAG +TGGSMNP RT+GPA+A+ N++ LW+Y+VAPT GA+
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Query:  AGAAGYTAVKL
        +GAA YT VKL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G80760.1 NOD26-like intrinsic protein 6;14.1e-7260.61Show/hide
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        P + ++  ++GAEF+GT I++F+  A  I+N+K   AE  L+  A  AGLAVM VILS GHISGAHLNP+VT+AFAAL+HFPW HVP+YI AQ+  S+SA
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Query:  AFSLKIVFRPFMSGGATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYI
        AF+LK VF P MSGG TVP+VG  QA A+EFI++F LMFV+ AVATDTRAVGELAGIA+G  VMLNIL+AG AT  SMNP RT+GPAIA  N++ +W+Y+
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Query:  VAPTAGAVAGAAGYTAVKLRQDTAAESARRN
         AP  GA+ GA  YT VKL ++  A   RR+
Subjt:  VAPTAGAVAGAAGYTAVKLRQDTAAESARRN

AT4G10380.1 NOD26-like intrinsic protein 5;19.2e-8069.19Show/hide
Query:  QVGAEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMTSAICAGLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSISAAFSLKIVF
        ++GAEF+GT+I++F+A A PI+N+KY  AE  L+ +A CAGLAVM +ILS GHISGAHLNPS+T+AFAALRHFPW HVP YI AQ+S SI A+F+LK VF
Subjt:  QVGAEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMTSAICAGLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSISAAFSLKIVF

Query:  RPFMSGGATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAPTAGAV
         PFMSGG T+PSV  GQA A+EFI+TF L+FV+ AVATDTRAVGELAGIA+G  VMLNILVAG +TGGSMNP RT+GPA+A+ N++ LW+Y+VAPT GA+
Subjt:  RPFMSGGATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAPTAGAV

Query:  AGAAGYTAVKL
        +GAA YT VKL
Subjt:  AGAAGYTAVKL

AT4G18910.1 NOD26-like intrinsic protein 1;21.3e-4647.91Show/hide
Query:  AEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMTSAICAGLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSISAAFSLKIVF---
        AE +GTY ++F+  AA  +N ++  A   L   AI  GL VM ++ S+GHISGAH NP+VT+AFA+   FP   VP Y+ +Q+ GS  AA +L+++F   
Subjt:  AEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMTSAICAGLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSISAAFSLKIVF---

Query:  RPFMSGG-----ATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAP
        +   SG       T+PS    Q+  IEFI+TF+LMFVI  VATD RA+GELAG+A+G  V+LN+++AG  +G SMNP R++GPA+    ++GLWIYIV+P
Subjt:  RPFMSGG-----ATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAP

Query:  TAGAVAGAAGYTAVK
          GAV+GA  Y  V+
Subjt:  TAGAVAGAAGYTAVK

AT4G19030.1 NOD26-like major intrinsic protein 15.6e-4547.44Show/hide
Query:  AEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMTSAICAGLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSISAAFSLKIVF---
        AEF+GTY ++F+  A+ ++N +       L   AI  GL +M +I S+GHISGAH+NP+VT+AFA+   FP   VP Y+ +Q+ GS  AA +L+++F   
Subjt:  AEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMTSAICAGLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSISAAFSLKIVF---

Query:  RPFMSGGATV-----PSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAP
            SG   V     P     QA  +EFIVTF+LMF+I  VATD RA+GELAG+AIG  V+LN+L+A   +  SMNP R++GPA+    +KG+WIY+VAP
Subjt:  RPFMSGGATV-----PSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAP

Query:  TAGAVAGAAGYTAVK
        T GA+AGA  Y  V+
Subjt:  TAGAVAGAAGYTAVK

AT5G37820.1 NOD26-like intrinsic protein 4;21.3e-4646.12Show/hide
Query:  AEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMT-SAICA--GLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSISAAFSLKIVF
        AE IGTY ++FS     ++N  Y     G +T   IC   GL VM +I S GHISGAH NP+VTV FA  R FPW  VPLYI AQ++GS+ A+ +L+++F
Subjt:  AEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMT-SAICA--GLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSISAAFSLKIVF

Query:  RPFMSG-GATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAPTAGA
                 T P+  +GQAL  E I++F LMFVI  VATD+RA GELAGIA+G  ++LN+ VAG  +G SMNPAR++GPAI    +KG+W+YIV P  G 
Subjt:  RPFMSG-GATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAPTAGA

Query:  VAGAAGYTAVKLRQDTAAESARRNEGSLSRLGESSQAVVPSRSSG
         AG   Y  ++       E  +    S S L   +Q    S+S G
Subjt:  VAGAAGYTAVKLRQDTAAESARRNEGSLSRLGESSQAVVPSRSSG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GAATATAAAAGTAATTTAATCTTAAAATTCAAAATTCCGGTGCATTTTAATATTGAGATTCAGGTAGGGGCGGAGTTCATTGGAACATACATAATGCTATTCTCCGCAGC
GGCGGCGCCCATTCTGAACGAGAAATATCAGGCGGCGGAGAACGGCCTGATGACGAGTGCGATATGCGCAGGACTCGCGGTGATGGCCGTAATCCTCTCCATCGGTCACA
TCTCCGGCGCTCACTTGAATCCCTCTGTCACTGTAGCCTTCGCCGCTCTCCGTCACTTTCCATGGCTTCACGTCCCTCTCTACATCACCGCTCAGATTTCCGGATCTATT
TCCGCCGCTTTCAGCCTCAAGATCGTCTTCCGTCCGTTCATGTCCGGCGGCGCCACCGTGCCCTCCGTCGGCACCGGTCAGGCCCTCGCGATCGAGTTCATCGTCACATT
CTTCCTCATGTTCGTCATTGTTGCTGTCGCCACTGATACCAGAGCGGTCGGGGAATTGGCCGGAATTGCAATCGGAGGCATGGTAATGCTCAACATTCTCGTCGCCGGGC
GCGCCACCGGCGGTTCGATGAACCCGGCGAGGACCATAGGCCCAGCCATCGCAACAGAAAATTTCAAAGGTCTATGGATATACATAGTAGCACCCACAGCCGGAGCAGTG
GCTGGTGCAGCCGGCTACACAGCCGTGAAGCTCCGTCAAGACACGGCAGCGGAATCAGCGCGGCGAAATGAAGGAAGCCTCAGCCGATTGGGAGAAAGCTCGCAAGCGGT
GGTCCCGTCGAGATCCAGTGGAAACTCGGCATGGAAGCTGGACGGCGGTTCGTGGCTGTGTTTAGCCGGAGAGTGCAGGAAGGAGTGCTCGGAATTGGAGCATTTGAATG
TGATTCTGTGTTACAAGGAAGCTAATCAGATCGCAGAATTTCTGGGCAAGAACGAAGCAGGCGACGAGGGTTTGGTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAATATAAAAGTAATTTAATCTTAAAATTCAAAATTCCGGTGCATTTTAATATTGAGATTCAGGTAGGGGCGGAGTTCATTGGAACATACATAATGCTATTCTCCGCAGC
GGCGGCGCCCATTCTGAACGAGAAATATCAGGCGGCGGAGAACGGCCTGATGACGAGTGCGATATGCGCAGGACTCGCGGTGATGGCCGTAATCCTCTCCATCGGTCACA
TCTCCGGCGCTCACTTGAATCCCTCTGTCACTGTAGCCTTCGCCGCTCTCCGTCACTTTCCATGGCTTCACGTCCCTCTCTACATCACCGCTCAGATTTCCGGATCTATT
TCCGCCGCTTTCAGCCTCAAGATCGTCTTCCGTCCGTTCATGTCCGGCGGCGCCACCGTGCCCTCCGTCGGCACCGGTCAGGCCCTCGCGATCGAGTTCATCGTCACATT
CTTCCTCATGTTCGTCATTGTTGCTGTCGCCACTGATACCAGAGCGGTCGGGGAATTGGCCGGAATTGCAATCGGAGGCATGGTAATGCTCAACATTCTCGTCGCCGGGC
GCGCCACCGGCGGTTCGATGAACCCGGCGAGGACCATAGGCCCAGCCATCGCAACAGAAAATTTCAAAGGTCTATGGATATACATAGTAGCACCCACAGCCGGAGCAGTG
GCTGGTGCAGCCGGCTACACAGCCGTGAAGCTCCGTCAAGACACGGCAGCGGAATCAGCGCGGCGAAATGAAGGAAGCCTCAGCCGATTGGGAGAAAGCTCGCAAGCGGT
GGTCCCGTCGAGATCCAGTGGAAACTCGGCATGGAAGCTGGACGGCGGTTCGTGGCTGTGTTTAGCCGGAGAGTGCAGGAAGGAGTGCTCGGAATTGGAGCATTTGAATG
TGATTCTGTGTTACAAGGAAGCTAATCAGATCGCAGAATTTCTGGGCAAGAACGAAGCAGGCGACGAGGGTTTGGTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
EYKSNLILKFKIPVHFNIEIQVGAEFIGTYIMLFSAAAAPILNEKYQAAENGLMTSAICAGLAVMAVILSIGHISGAHLNPSVTVAFAALRHFPWLHVPLYITAQISGSI
SAAFSLKIVFRPFMSGGATVPSVGTGQALAIEFIVTFFLMFVIVAVATDTRAVGELAGIAIGGMVMLNILVAGRATGGSMNPARTIGPAIATENFKGLWIYIVAPTAGAV
AGAAGYTAVKLRQDTAAESARRNEGSLSRLGESSQAVVPSRSSGNSAWKLDGGSWLCLAGECRKECSELEHLNVILCYKEANQIAEFLGKNEAGDEGLV