; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13137 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13137
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionVQ motif-containing protein 22-like
Genome locationCarg_Chr04:3222211..3222870
RNA-Seq ExpressionCarg13137
SyntenyCarg13137
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039609 - VQ motif-containing protein 15/22


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600438.1 VQ motif-containing protein 22, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-117100Show/hide
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XP_023529552.1 VQ motif-containing protein 22-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-11498.17Show/hide
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XP_038900813.1 VQ motif-containing protein 22 [Benincasa hispida]3.7e-8277.83Show/hide
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A0A5A7TQ26 VQ motif-containing protein 22-like6.2e-7574.77Show/hide
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A0A5D3CX65 VQ motif-containing protein 22-like1.8e-7474.31Show/hide
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A0A6J1C3V2 VQ motif-containing protein 22-like1.0e-7773.93Show/hide
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        GFLMESAVSSQIP+ G SADSSN++N GNGG LF
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A0A6J1FXJ7 VQ motif-containing protein 22-like6.1e-11598.63Show/hide
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A0A6J1J579 VQ motif-containing protein 22-like5.9e-11096.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LIE6 VQ motif-containing protein 227.4e-1735.94Show/hide
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        Q+TGGP          TS+F+ + S +   G        +   P+A + PP    +P  F  +N  P +    ++  +    +S      DG  G G   
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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        Q+TGGP          TS+F+ + S +   G        +   P+A + PP    +P  F  +N  P +    ++  +    +S      DG  G G   
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         SA SS+  T   S+ S
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AT4G15120.1 VQ motif-containing protein4.2e-1537.95Show/hide
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        +S  DW QFY +Q   TTA                      +T   TT+ A    ++ ++ L+P+  RV KP RRRSRASRRTPTTL NTDT NFRAMVQ
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        QFTGGP++ +F SS S  F L            P   V S P  Y     Q  H+      +P+MF +       +  +S     N  VA DGF+
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AT4G39720.1 VQ motif-containing protein2.7e-0628.09Show/hide
Query:  FYHQNLSTTAAPPPPS--------DLPTSSAMIFAERVSDATAVPTT------SAAIIGSSAGNTGLNPEGRVG--KPIRRRSRASRRTPTTLLNTDTTN
        F H N   ++ P P          D   ++++I     ++ T +P        S   + +S+  + L P   +G  K  ++RSRASRR PTT+L TDT+N
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Query:  FRAMVQQFTGGP------TSSFASSISPNFPLGFRGICQSNFGTPPYAVISPPSDYLQP--PQFYHSNPQPFMFPAAAHGGDFTQRI---SVARPANDGV
        FRAMVQ+FTG P       +S  ++   N  LG      + + T    ++ P +  L P  P    S  Q +  P         Q +    ++ P ++  
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Query:  AGDGFLMESAVSSQIPTTGASADSSNKTNHGNGGS
           G  M    S+  PTT A+A+ +   N G+ GS
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AT5G65170.1 VQ motif-containing protein2.0e-0936.77Show/hide
Query:  STTAAPPP----PSDLPTSSAMIFAER--VSDATAVPTTSAAIIGSSAGNTGLNPEGRVGKPIRRRSRASRRTPTTLLNTDTTNFRAMVQQFTGGPTSSF
        STTA  P     P   P SS  +F       +   VP T+      S      N       P ++RSR SRR PTT+L TDT+NFRAMVQ+FTG P++ F
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Query:  A--SSISPNFPLGFRGICQSNFGTP----PYAVISPPS---DYLQPPQFYHSNPQ
           SS  P       G   S+   P    P+ +ISP +    YL P   YH + Q
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCAGCCCCGGCGATTGGCTTCAATTTTACCATCAAAATCTTTCTACCACGGCGGCGCCACCACCACCTTCCGATTTACCCACCTCCTCTGCAATGATCTTTGCAGA
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GCCGGTCCAGAGCGTCACGGCGGACTCCGACGACGTTGCTCAACACGGATACGACGAATTTCAGAGCGATGGTTCAGCAATTCACTGGAGGTCCGACTTCTTCTTTCGCC
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GAGATGGATTTCTGATGGAAAGTGCGGTTTCTTCTCAAATTCCTACCACCGGAGCTTCTGCAGATTCCTCCAACAAGACCAATCACGGTAATGGTGGCTCACTGTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCAGCCCCGGCGATTGGCTTCAATTTTACCATCAAAATCTTTCTACCACGGCGGCGCCACCACCACCTTCCGATTTACCCACCTCCTCTGCAATGATCTTTGCAGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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