; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13169 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13169
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUBP1-associated protein 2C-like
Genome locationCarg_Chr04:3026306..3033501
RNA-Seq ExpressionCarg13169
SyntenyCarg13169
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031060.1 UBP1-associated protein 2C [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.0e-238100Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

XP_004137219.1 UBP1-associated protein 2C [Cucumis sativus]2.6e-22093.56Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MD TKKRRM+ENGVDSSE+SF +IT +DARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH DVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGA+LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAAD+SLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGG DG QT GAGQGN+HGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSG+QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
         QPL HHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGP  SIYGGMGSVGGGLGGS GGLGG GG SSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPN  HQ A TSPAPRVPPGGMYP+VPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

XP_022941883.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita moschata]1.2e-23699.54Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        GQ LGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYR+PQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

XP_022980930.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita maxima]5.7e-23699.31Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGP S+IYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGT GPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

XP_023538334.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.8e-23799.77Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGY DSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYY6 Uncharacterized protein1.3e-22093.56Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MD TKKRRM+ENGVDSSE+SF +IT +DARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH DVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGA+LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAAD+SLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGG DG QT GAGQGN+HGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSG+QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
         QPL HHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGP  SIYGGMGSVGGGLGGS GGLGG GG SSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPN  HQ A TSPAPRVPPGGMYP+VPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

A0A1S3BT99 UBP1-associated protein 2C2.4e-21993.1Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MD TKKRRM+ENGVDSSENSF +IT +DARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH DVL+AVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGA+LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAAD+SLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGG DG QT GAGQGN+HGDGMPMAPPSAMPGSG QYGGPGGMGSY GFSSG+QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
         QPL HHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGP  SIYGGMGSVGGGLGGS GGLGG GG SSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPN  HQ A TSPAPRVPPGGMYP+VPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

A0A6J1CND4 UBP1-associated protein 2C1.4e-21992.66Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MD TKKRRM+ENGVDS  +   +IT +DARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH DVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSA+GELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAAD+SLRKIYVANVP+DMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGVQ
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQ P AGQGN+HGDGM MAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY GGFSSG+Q
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGVQ

Query:  GGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYS
        GGQPLGHHP+NSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGP SS+YGGMGSVGGGLGGS GGLGG GG SSLYRLPQSSVGMPSGGYPD GHYS
Subjt:  GGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYS

Query:  MSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        MSS+SGHPN LHQQA TSPAPRVPPGGMYP+VPPYY
Subjt:  MSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

A0A6J1FPR2 UBP1-associated protein 2C-like5.6e-23799.54Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        GQ LGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYR+PQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

A0A6J1J0Q9 UBP1-associated protein 2C-like2.8e-23699.31Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQG

Query:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGP S+IYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGT GPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  GQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
Subjt:  SSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80678 UBP1-associated protein 2B2.0e-4238.4Show/hide
Query:  IIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEP
        +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  ALK+P
Subjt:  IIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEP

Query:  SKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDP
         K I  R+T  QLA++G           Q+ N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ AL +P
Subjt:  SKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDP

Query:  IKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGVQG-----GQPLGHHPLNSSMGPGL
         KT +G  L C  ANDG              P   + + H                  YG PGG G +  G +  VQ      GQ L     +   G GL
Subjt:  IKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGVQG-----GQPLGHHPLNSSMGPGL

Query:  SSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPAS---SIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGG
        +   GQA   LG+ G    G  GG   GYG  A+    +Y G G+  G  GG      G GG
Subjt:  SSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPAS---SIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGG

Q8BG05 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A31.2e-2334.1Show/hide
Query:  RKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANV
        RKLFI GLS +T+ + LR  F  +G L + VV+ D  T +S+G+GFVT+  V+    A+      +DGRV V    AV         A ++++KI+V  +
Subjt:  RKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANV

Query:  PMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPM
          D     L  +F  YG+IE   +  D+Q+GK RG+A   +   +     +V    TI+G     K A   ++ +  G Q G    G G GN  G G   
Subjt:  PMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPM

Query:  APPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQGGQPLGHHPL-----NSSMGPGLSS---VGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGL
               G GG +GG GG G  GG S G  GG   G++       N   GPG SS    GG  P      GGYGGG  GGGY G     Y   G+ GGG 
Subjt:  APPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQGGQPLGHHPL-----NSSMGPGLSS---VGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGL

Query:  GGSAGGLGGTGGPSSLYR-----LPQSSVGMPSGGYPDSGHYSMSSASG
         G  G     G  S   +     +   S G  S G P  G Y     SG
Subjt:  GGSAGGLGGTGGPSSLYR-----LPQSSVGMPSGGYPDSGHYSMSSASG

Q9LES2 UBP1-associated protein 2A7.2e-4037.02Show/hide
Query:  DATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDD--ARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEA
        D T   R+E      S N   +   DD   + +++ F+ +Q++ +L++A  +H DV + +R +AD D   RK+F+ GL  DT TE L   F  YGE+E+ 
Subjt:  DATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDD--ARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEA

Query:  VVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLY
          + DK +GKSKGYGF+ +K   GA  ALK+P K I  R+T  QL              AAV    Q+SN ++ + +KIYV+NV  ++   KLL  FS +
Subjt:  VVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLY

Query:  GEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLH--GDGMPMAPPSAMPGSGG-QY
        GEIEEGPLG DK TG+ +G+ LFVYK  E A+ AL +P KT +G  L C+ A DG   KPG  Q     P A     +   D     PP    G G    
Subjt:  GEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLH--GDGMPMAPPSAMPGSGG-QY

Query:  GGPGGMGSYGGFSSGVQGGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQ
        G P GMG           GQ L    L +S G GL+       + LGS G   G   G G G P    YG      G + G     G  GG    Y+ PQ
Subjt:  GGPGGMGSYGGFSSGVQGGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQ

Query:  SSVGMPSGGYPDSGHY
           G  S G    G Y
Subjt:  SSVGMPSGGYPDSGHY

Q9LJ04 RNA-binding protein P2.6e-4539.18Show/hide
Query:  GVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKG
        G    E    +  +D  + +++ F  DQL+++L  A   H DVL AV   AD D + RK+F+ GL  D + E L   FSAYGE+E+  V+ D+ATGK KG
Subjt:  GVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKG

Query:  YGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG---ISGQNSNAA----------------DMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPL
        YGF+ F    GA  AL+EP K I  R T  QLA+VG     G  +N A                + + RKI+V+NV  D+   KLL  FS YGEIEEGPL
Subjt:  YGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG---ISGQNSNAA----------------DMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPL

Query:  GFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSG-GQYGGPGGMGSYG
        G DK TGK +G+ALFVYK  + A+ AL +P K  +G  L C+ A DG K   GGG  G+   G   G   G G   A   ++PG+  G +  P  + S  
Subjt:  GFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSG-GQYGGPGGMGSYG

Query:  GFSSGVQGGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVG----GGLGGSAGGLGGTGGPSS
            GV GG       +N ++G  L+++       LG +   G G  G G   P +S   G+GS G     G GG  GG GG GG  S
Subjt:  GFSSGVQGGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVG----GGLGGSAGGLGGTGGPSS

Q9LKA4 UBP1-associated protein 2C9.2e-12059.59Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSF-----LKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE
        MD  KKR+++ENG   + N        +++  DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFS+YG+
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSF-----LKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE

Query:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DK TGKSKGYGFVTF HVDGA+LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKK-GKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGF
        DK TGK RG+ALFVYK  EGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKK GKPG  Q   Q  G+G G++HG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKK-GKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGF

Query:  SSGVQGGQPLGH-HPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMP-SGGY
        S    GG P  H +  +SSMG G              S GYGG  + GGYGGP     GG G V GGLG   GG GG G  S  YR+P SS  MP  GGY
Subjt:  SSGVQGGQPLGH-HPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMP-SGGY

Query:  PDSGHYSMSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        P+SGHY +SS++G+P   HQ   TSP PRVP GGMYP+ PP Y
Subjt:  PDSGHYSMSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41060.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.4e-4338.4Show/hide
Query:  IIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEP
        +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  ALK+P
Subjt:  IIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEP

Query:  SKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDP
         K I  R+T  QLA++G           Q+ N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ AL +P
Subjt:  SKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDP

Query:  IKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGVQG-----GQPLGHHPLNSSMGPGL
         KT +G  L C  ANDG              P   + + H                  YG PGG G +  G +  VQ      GQ L     +   G GL
Subjt:  IKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGVQG-----GQPLGHHPLNSSMGPGL

Query:  SSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPAS---SIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGG
        +   GQA   LG+ G    G  GG   GYG  A+    +Y G G+  G  GG      G GG
Subjt:  SSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPAS---SIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGG

AT2G41060.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.4e-4338.4Show/hide
Query:  IIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEP
        +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  ALK+P
Subjt:  IIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEP

Query:  SKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDP
         K I  R+T  QLA++G           Q+ N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ AL +P
Subjt:  SKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDP

Query:  IKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGVQG-----GQPLGHHPLNSSMGPGL
         KT +G  L C  ANDG              P   + + H                  YG PGG G +  G +  VQ      GQ L     +   G GL
Subjt:  IKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGVQG-----GQPLGHHPLNSSMGPGL

Query:  SSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPAS---SIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGG
        +   GQA   LG+ G    G  GG   GYG  A+    +Y G G+  G  GG      G GG
Subjt:  SSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPAS---SIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGG

AT3G15010.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein6.5e-12159.59Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSF-----LKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE
        MD  KKR+++ENG   + N        +++  DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFS+YG+
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSF-----LKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE

Query:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DK TGKSKGYGFVTF HVDGA+LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKK-GKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGF
        DK TGK RG+ALFVYK  EGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKK GKPG  Q   Q  G+G G++HG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKK-GKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGF

Query:  SSGVQGGQPLGH-HPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMP-SGGY
        S    GG P  H +  +SSMG G              S GYGG  + GGYGGP     GG G V GGLG   GG GG G  S  YR+P SS  MP  GGY
Subjt:  SSGVQGGQPLGH-HPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMP-SGGY

Query:  PDSGHYSMSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        P+SGHY +SS++G+P   HQ   TSP PRVP GGMYP+ PP Y
Subjt:  PDSGHYSMSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

AT3G15010.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein6.5e-12159.59Show/hide
Query:  MDATKKRRMEENGVDSSENSF-----LKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE
        MD  KKR+++ENG   + N        +++  DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFS+YG+
Subjt:  MDATKKRRMEENGVDSSENSF-----LKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE

Query:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DK TGKSKGYGFVTF HVDGA+LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKK-GKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGF
        DK TGK RG+ALFVYK  EGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKK GKPG  Q   Q  G+G G++HG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKK-GKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGF

Query:  SSGVQGGQPLGH-HPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMP-SGGY
        S    GG P  H +  +SSMG G              S GYGG  + GGYGGP     GG G V GGLG   GG GG G  S  YR+P SS  MP  GGY
Subjt:  SSGVQGGQPLGH-HPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMP-SGGY

Query:  PDSGHYSMSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY
        P+SGHY +SS++G+P   HQ   TSP PRVP GGMYP+ PP Y
Subjt:  PDSGHYSMSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY

AT3G56860.3 UBP1-associated protein 2A5.1e-4137.02Show/hide
Query:  DATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDD--ARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEA
        D T   R+E      S N   +   DD   + +++ F+ +Q++ +L++A  +H DV + +R +AD D   RK+F+ GL  DT TE L   F  YGE+E+ 
Subjt:  DATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDD--ARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEA

Query:  VVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLY
          + DK +GKSKGYGF+ +K   GA  ALK+P K I  R+T  QL              AAV    Q+SN ++ + +KIYV+NV  ++   KLL  FS +
Subjt:  VVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLY

Query:  GEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLH--GDGMPMAPPSAMPGSGG-QY
        GEIEEGPLG DK TG+ +G+ LFVYK  E A+ AL +P KT +G  L C+ A DG   KPG  Q     P A     +   D     PP    G G    
Subjt:  GEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLH--GDGMPMAPPSAMPGSGG-QY

Query:  GGPGGMGSYGGFSSGVQGGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQ
        G P GMG           GQ L    L +S G GL+       + LGS G   G   G G G P    YG      G + G     G  GG    Y+ PQ
Subjt:  GGPGGMGSYGGFSSGVQGGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQ

Query:  SSVGMPSGGYPDSGHY
           G  S G    G Y
Subjt:  SSVGMPSGGYPDSGHY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGCCACCAAGAAGCGGAGGATGGAAGAAAATGGCGTCGACTCCTCTGAAAATTCTTTCTTAAAAATTACCTCCGATGATGCTCGTAAAATCATTGATCGTTTCAC
TCCGGACCAGCTTATCGATATTCTCCAAGATGCTGTTTCGCGTCACACGGATGTCCTTGATGCGGTTCGATCTATTGCTGACCGAGACGTCTCCCAGCGGAAGCTGTTTA
TTCGGGGTCTTAGTTGCGATACAAGTACAGAAGGTTTGCGCTCTCTCTTTTCCGCGTATGGGGAGCTTGAAGAAGCGGTTGTTATAATTGACAAGGCGACCGGGAAATCG
AAAGGGTATGGCTTTGTGACTTTCAAGCATGTTGATGGGGCTATACTGGCTTTGAAGGAACCGAGCAAGACGATTGATGGCCGTGTTACAGTAACGCAATTGGCTGCAGT
GGGAATTTCCGGGCAGAATTCGAACGCTGCGGACATGTCGTTGAGGAAAATTTATGTGGCGAATGTTCCGATGGATATGCCGGCCGATAAATTGTTGGCACACTTTTCGC
TGTATGGAGAAATTGAGGAGGGACCGCTAGGATTTGATAAGCAGACGGGTAAGTGCAGAGGTTATGCTTTATTTGTGTACAAGAAGCCAGAAGGGGCACAGGCAGCTCTG
GTGGATCCAATCAAGACGATTGATGGAAGGCAGTTGAGTTGTAAATTCGCTAACGATGGGAAGAAAGGGAAACCTGGTGGTGGGCAGGATGGAATTCAAACGCCGGGGGC
CGGTCAAGGGAATTTGCATGGAGATGGCATGCCTATGGCTCCTCCTTCGGCAATGCCTGGTTCAGGCGGACAATATGGTGGGCCGGGAGGCATGGGGTCGTATGGAGGCT
TTTCTAGTGGCGTTCAAGGGGGACAGCCACTGGGTCATCATCCGCTAAACTCCTCAATGGGGCCGGGTCTATCTTCTGTCGGTGGTCAGGCTCCATCTTCGTTGGGAAGC
TCTGGCGGATATGGCGGCGGTCCATATGGTGGTGGATACGGCGGTCCCGCGTCCTCAATTTATGGTGGTATGGGTAGTGTAGGTGGTGGTTTGGGTGGTTCTGCTGGTGG
ATTGGGCGGAACCGGGGGGCCATCATCTCTGTATAGGTTGCCACAGAGTTCGGTGGGAATGCCTTCTGGTGGTTATCCGGATAGTGGGCATTATAGCATGTCATCAGCAT
CTGGGCACCCAAATCCGCTCCATCAACAGGCGGTAACATCACCGGCGCCACGTGTTCCGCCTGGAGGAATGTATCCCAGTGTGCCACCTTATTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCCTCTTCGTCTTGGTCATCGTTCCTAGACTCGGATTAGGGTTTAGCTTCACCTTCTTGTTCTTCTTCTTCTTCTACTTCCACTCTACACTTCCAGGGACCTCCTTCTT
CGTCTCATCTCCGCCATGGACGCCACCAAGAAGCGGAGGATGGAAGAAAATGGCGTCGACTCCTCTGAAAATTCTTTCTTAAAAATTACCTCCGATGATGCTCGTAAAAT
CATTGATCGTTTCACTCCGGACCAGCTTATCGATATTCTCCAAGATGCTGTTTCGCGTCACACGGATGTCCTTGATGCGGTTCGATCTATTGCTGACCGAGACGTCTCCC
AGCGGAAGCTGTTTATTCGGGGTCTTAGTTGCGATACAAGTACAGAAGGTTTGCGCTCTCTCTTTTCCGCGTATGGGGAGCTTGAAGAAGCGGTTGTTATAATTGACAAG
GCGACCGGGAAATCGAAAGGGTATGGCTTTGTGACTTTCAAGCATGTTGATGGGGCTATACTGGCTTTGAAGGAACCGAGCAAGACGATTGATGGCCGTGTTACAGTAAC
GCAATTGGCTGCAGTGGGAATTTCCGGGCAGAATTCGAACGCTGCGGACATGTCGTTGAGGAAAATTTATGTGGCGAATGTTCCGATGGATATGCCGGCCGATAAATTGT
TGGCACACTTTTCGCTGTATGGAGAAATTGAGGAGGGACCGCTAGGATTTGATAAGCAGACGGGTAAGTGCAGAGGTTATGCTTTATTTGTGTACAAGAAGCCAGAAGGG
GCACAGGCAGCTCTGGTGGATCCAATCAAGACGATTGATGGAAGGCAGTTGAGTTGTAAATTCGCTAACGATGGGAAGAAAGGGAAACCTGGTGGTGGGCAGGATGGAAT
TCAAACGCCGGGGGCCGGTCAAGGGAATTTGCATGGAGATGGCATGCCTATGGCTCCTCCTTCGGCAATGCCTGGTTCAGGCGGACAATATGGTGGGCCGGGAGGCATGG
GGTCGTATGGAGGCTTTTCTAGTGGCGTTCAAGGGGGACAGCCACTGGGTCATCATCCGCTAAACTCCTCAATGGGGCCGGGTCTATCTTCTGTCGGTGGTCAGGCTCCA
TCTTCGTTGGGAAGCTCTGGCGGATATGGCGGCGGTCCATATGGTGGTGGATACGGCGGTCCCGCGTCCTCAATTTATGGTGGTATGGGTAGTGTAGGTGGTGGTTTGGG
TGGTTCTGCTGGTGGATTGGGCGGAACCGGGGGGCCATCATCTCTGTATAGGTTGCCACAGAGTTCGGTGGGAATGCCTTCTGGTGGTTATCCGGATAGTGGGCATTATA
GCATGTCATCAGCATCTGGGCACCCAAATCCGCTCCATCAACAGGCGGTAACATCACCGGCGCCACGTGTTCCGCCTGGAGGAATGTATCCCAGTGTGCCACCTTATTAC
TGAGTTATGATGTTTGTTGGGCGCAGATGCTTTATGTGCTCTGGTGATTGCGTTGATTGCAGACTGTAACTCTGGTTTGATGAATGCATTAGCTTTGCTTGTGGCCTCTG
CTGTTTAACTGCACCTTTGAGTTGTTCATTGAGAATTATTGGTAGTCAAAGAGACAGAGTTAGAAAGTTAGATAATTTTTGTACTCTACCCAATGACTTAATTGTGCTAT
TTGACTTTTCTACTAGTAGTAAATTTAGTATTATATGAGTACTATTCGCTCTAGTTACTGTAGTTTTTCTGCTTTCTGTTGCTTTCAAATTATGTGGACAATCTTTTCCC
TCCCGACTACTCATTACGTGGCTCTGCCATCTTGATTTGAGTATGTCAACCTGCTTGAAAGACCTTGTATTTTCTCTGTCATTGCTTTTCTGCGAGGAACTTTTGAATCC
TTTGCAGTTGTTGGTATCAAGTGCTTTCTACTTCACTTCTCTGCCATGCCTTTGAATTGATTTCCTTTTATCGCTACTCTCTGTTCTTTGTGAATGGTCGATGAAAGTTG
GAAAAAATCCATGGTGATTCTGTTATTTTGTCTGTCCATGCTGTATGGATCCACTTCTATTGCTGCTCTGCTGTGTGCATCTGTTTTGTCGAAGGTTGTTGGAAGCACAA
GCTTTGTCAATCTTGGATTTGAATGGTACTTGAAGCTCTTTTTGTATCTCATCTTTAATGGTTTAAGGGTTTTTGATTTATGGATTGTAGAGATGATATTCTCGTCTTTG
AGCTGTGACTTTCGTTGTATCTCATCGATGATGATTTACTGCATAATGTGCTGGATGCTTCAACCAAATACATGTGTGCACGGTGATGGATTGAGTTCTTTTTCTGTACA
ACCAATTGCTTGCTTAATTTTCTGTTTGAGCTGTGACTTTCGTTGGCTTGTTTGAATGGTGAGTGCGTGTTCCACGGAGCCAATTGCTTGCTTAATCTTCCTCGAGTTCA
TGTAATTTTCATTAACTTTTGAAGCAAGGAATGGGGTTGTGAGATGAAATTGAATCTTGTTTTGTTTCCCTTCCTTTTGTGAGTTGTGTTTTGTGGGGGATGAACTTGTT
ATATAGTTCATATTTAGCTGCTTTTGTTTTAGTTGTTAAAGATGTGTTTGGTTCACAAATTTGGGAAGTTCATTACTTGTAAATTGGCTTGGTTTGTGTTATAATGGATT
CGTAAGAGCTTGTTTATAGAAATTTTTGTCTTGTTTGCAACTTGTTAGATGGATTTTAGTAACTAGCGGAGGTGGTGTTCTCAATGTTCTCAACTTGTAAGAGAGATTAG
CTGTGTGTTTTGTCCTATAAATAAATCTGAATATCTGGCTTCTAAATCTTTATCAGCTTCTGTCTCTCACACACACAATATTTGGCCTTTTTTTTTTGTTTTTTCTTTTT
TTGGTGTGTGTATGGTGGTATATGAAATGGCAAATGGGCATCAAAACCATCCCACTGAGCCCCTGCTTGGAGGACTTAAAATCGGTCACGAAGACTTGAGGTACAACCAA
TTGAACTATTGAAGCCCTTTTAACTTCGAAATTATGTAAGTTTATATCCATTTTGATTCTTGTACTTCGACAATTATTCGTCTCCCTAATGACTCGGCTTCGAATGTTTA
ATATTCAAGTTCGAAATCAGTAGTAATATTTTTGCAATTTATTATAATGAAAAAGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDATKKRRMEENGVDSSENSFLKITSDDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHTDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKATGKS
KGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADMSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAAL
VDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGQDGIQTPGAGQGNLHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGVQGGQPLGHHPLNSSMGPGLSSVGGQAPSSLGS
SGGYGGGPYGGGYGGPASSIYGGMGSVGGGLGGSAGGLGGTGGPSSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSMSSASGHPNPLHQQAVTSPAPRVPPGGMYPSVPPYY