; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13240 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13240
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptioncopper ion transmembrane transporters
Genome locationCarg_Chr07:5715611..5716861
RNA-Seq ExpressionCarg13240
SyntenyCarg13240
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595352.1 putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-20391.59Show/hide
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KAG7027360.1 putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-227100Show/hide
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XP_022966589.1 uncharacterized protein LOC111466226 [Cucurbita maxima]3.7e-21695.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BKN8 uncharacterized protein LOC1034906411.9e-12563.42Show/hide
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A0A5A7TP38 Putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 331.9e-12563.42Show/hide
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        LRSGSVSEGEANSDYSDT++YY KSSMVPSSSNNGRKF  R+NGR+LESSKRELNSGQIGLDRRQRVPSPQMHNGNRQYGKGKDSRRSKGSYSEVYDMSL
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Query:  EQDGSYRFKPMKTQSN
        EQDGSYRFKPMKT+SN
Subjt:  EQDGSYRFKPMKTQSN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80792 Putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 337.0e-1645Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +       E   K       +   E +K LADRF + G  DLW + DGP
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Q6K7R9 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 481.0e-1139.81Show/hide
Query:  MGGGPRTYPGGVSKWQWKRMQAKKAKQLLKARLCRERQIYEMRKRAELKAAVSELERPWEVVEKAPNLFSVGADE---------QVKVLADRFQRPGGFD
        MGGGPRT+PGG+SKWQ KRM  K A+   +  L  E+Q+Y  R R+E++A+            + P   +   D+          ++ LADRF  PG  D
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Query:  LWTEKDGP
        LW E DGP
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Q9C8S9 Probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 485.3e-1645Show/hide
Query:  MGGGPRTYPGGVSKWQWKRMQAKKAKQLLKARLCRERQIYEMRKRAELKAAVSELERPWEVVEKAPNLFS-VGADEQVKVLADRFQRPGGFDLWTEKDGP
        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +       E   K+      +   E +K LADRF + G  D W E DGP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G63250.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein3.8e-1745Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +       E   K+      +   E +K LADRF + G  D W E DGP
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AT2G07750.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein4.9e-1745Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +       E   K       +   E +K LADRF + G  DLW + DGP
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AT2G37920.1 copper ion transmembrane transporters4.1e-6469.95Show/hide
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        +TVIRMGGGPRT+PGGVSKWQWKRMQAKK KQLLKARLCRERQIYEMRKRAELKAAV+ELERPWE + K PNLFSV ADEQVKVLADRFQ+PGGFDLWT+
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Query:  KDGPQLFETVDELPSARFFPKGVVHSVKPYRSITGSEGSSSLDSEDGNEIGTSFQEDDLKTPRRSSNRKSRIGSVSEEEANSN
        +DGPQLFE+VD+LPSARFFPKGVVHSVKPY  +     SSS   +DG+E     +E   K   R   ++   G     E   N
Subjt:  KDGPQLFETVDELPSARFFPKGVVHSVKPYRSITGSEGSSSLDSEDGNEIGTSFQEDDLKTPRRSSNRKSRIGSVSEEEANSN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAATTTTCCCAATCTCACTCGCAATTTCAAACCCTCCTCGACCACCGCCGTTATTCTCTTTCTCTCAGTCCATAACTGGTTCAAACCGCCTTTTGTACCTTTCCAA
TGGGATAAGGAACGCTACGAAGATCACGACGGTTATTCGAATGGGTGGAGGTCCAAGAACTTATCCAGGCGGAGTGTCGAAGTGGCAGTGGAAGCGGATGCAGGCTAAGA
AAGCTAAGCAGTTGCTCAAGGCCCGGTTGTGTCGCGAACGCCAGATATATGAGATGCGTAAGCGGGCTGAACTTAAGGCGGCTGTGTCCGAGCTGGAGAGGCCGTGGGAG
GTTGTGGAGAAGGCTCCCAATTTGTTCTCTGTTGGCGCCGATGAACAGGTGAAGGTTTTGGCGGATAGGTTTCAGAGGCCCGGTGGATTCGATTTGTGGACGGAAAAAGA
TGGGCCTCAATTGTTTGAGACGGTTGATGAACTGCCTTCCGCAAGGTTTTTCCCGAAAGGGGTGGTTCACAGTGTAAAGCCGTACAGAAGTATAACAGGGTCGGAGGGTT
CTTCGAGTTTGGATTCCGAAGATGGAAATGAAATTGGAACTAGTTTTCAAGAAGATGATTTAAAGACTCCTCGGAGGTCTTCTAACCGGAAATCAAGAATTGGGTCAGTG
AGTGAAGAAGAAGCTAATTCAAATTACTCTGATTATTATCCGAGGAGTTCCTCGGTTCCATCAAGTAGCAATGGTCAAAAAGGAAAGACATACGAGGGTAAATTCCGGAA
TCGGGAAAAGGGAAGAAACCTCCAGTCTTCTAAGAGATCTCCGAGCTTGGGCTCAGAAGCTGGAAATGGAATTGAAACTAGTTTTCAAGTAGATGATTTTAATTCTCACC
GGAGGTCTTCTAACCGGAAATTGAGAAGTGGGTCAGTGAGTGAAGGAGAAGCTAATTCAGATTACTCGGATACAGATAATTATTATCAGAAGAGTTCTATGGTACCATCA
AGTAGTAATAATGGTCGTAAATTCAGATATCGGGATAATGGAAGAAGCCTCGAGTCTTCTAAGAGGGAGTTGAATTCAGGACAAATTGGATTGGATAGAAGACAAAGGGT
TCCTAGTCCTCAGATGCATAATGGTAATAGACAGTATGGAAAAGGCAAGGATTCGAGGCGATCCAAGGGTTCATATTCTGAAGTTTATGATATGAGTTTGGAGCAGGATG
GGAGTTACAGATTCAAACCGATGAAAACTCAGTCGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCAATTTTCCCAATCTCACTCGCAATTTCAAACCCTCCTCGACCACCGCCGTTATTCTCTTTCTCTCAGTCCATAACTGGTTCAAACCGCCTTTTGTACCTTTCCAA
TGGGATAAGGAACGCTACGAAGATCACGACGGTTATTCGAATGGGTGGAGGTCCAAGAACTTATCCAGGCGGAGTGTCGAAGTGGCAGTGGAAGCGGATGCAGGCTAAGA
AAGCTAAGCAGTTGCTCAAGGCCCGGTTGTGTCGCGAACGCCAGATATATGAGATGCGTAAGCGGGCTGAACTTAAGGCGGCTGTGTCCGAGCTGGAGAGGCCGTGGGAG
GTTGTGGAGAAGGCTCCCAATTTGTTCTCTGTTGGCGCCGATGAACAGGTGAAGGTTTTGGCGGATAGGTTTCAGAGGCCCGGTGGATTCGATTTGTGGACGGAAAAAGA
TGGGCCTCAATTGTTTGAGACGGTTGATGAACTGCCTTCCGCAAGGTTTTTCCCGAAAGGGGTGGTTCACAGTGTAAAGCCGTACAGAAGTATAACAGGGTCGGAGGGTT
CTTCGAGTTTGGATTCCGAAGATGGAAATGAAATTGGAACTAGTTTTCAAGAAGATGATTTAAAGACTCCTCGGAGGTCTTCTAACCGGAAATCAAGAATTGGGTCAGTG
AGTGAAGAAGAAGCTAATTCAAATTACTCTGATTATTATCCGAGGAGTTCCTCGGTTCCATCAAGTAGCAATGGTCAAAAAGGAAAGACATACGAGGGTAAATTCCGGAA
TCGGGAAAAGGGAAGAAACCTCCAGTCTTCTAAGAGATCTCCGAGCTTGGGCTCAGAAGCTGGAAATGGAATTGAAACTAGTTTTCAAGTAGATGATTTTAATTCTCACC
GGAGGTCTTCTAACCGGAAATTGAGAAGTGGGTCAGTGAGTGAAGGAGAAGCTAATTCAGATTACTCGGATACAGATAATTATTATCAGAAGAGTTCTATGGTACCATCA
AGTAGTAATAATGGTCGTAAATTCAGATATCGGGATAATGGAAGAAGCCTCGAGTCTTCTAAGAGGGAGTTGAATTCAGGACAAATTGGATTGGATAGAAGACAAAGGGT
TCCTAGTCCTCAGATGCATAATGGTAATAGACAGTATGGAAAAGGCAAGGATTCGAGGCGATCCAAGGGTTCATATTCTGAAGTTTATGATATGAGTTTGGAGCAGGATG
GGAGTTACAGATTCAAACCGATGAAAACTCAGTCGAACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPIFPISLAISNPPRPPPLFSFSQSITGSNRLLYLSNGIRNATKITTVIRMGGGPRTYPGGVSKWQWKRMQAKKAKQLLKARLCRERQIYEMRKRAELKAAVSELERPWE
VVEKAPNLFSVGADEQVKVLADRFQRPGGFDLWTEKDGPQLFETVDELPSARFFPKGVVHSVKPYRSITGSEGSSSLDSEDGNEIGTSFQEDDLKTPRRSSNRKSRIGSV
SEEEANSNYSDYYPRSSSVPSSSNGQKGKTYEGKFRNREKGRNLQSSKRSPSLGSEAGNGIETSFQVDDFNSHRRSSNRKLRSGSVSEGEANSDYSDTDNYYQKSSMVPS
SSNNGRKFRYRDNGRSLESSKRELNSGQIGLDRRQRVPSPQMHNGNRQYGKGKDSRRSKGSYSEVYDMSLEQDGSYRFKPMKTQSN