; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13243 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13243
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionEncodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).
Genome locationCarg_Chr07:5756349..5758985
RNA-Seq ExpressionCarg13243
SyntenyCarg13243
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595356.1 hypothetical protein SDJN03_11909, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.8e-7498.03Show/hide
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KAG7027363.1 hypothetical protein SDJN02_11375 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-75100Show/hide
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XP_022931917.1 uncharacterized protein LOC111438192 [Cucurbita moschata]9.8e-7498.03Show/hide
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XP_022966597.1 uncharacterized protein LOC111466230 [Cucurbita maxima]1.8e-7296.71Show/hide
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XP_023517047.1 uncharacterized protein LOC111780922 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.1e-7296.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BK03 uncharacterized protein LOC103490707 isoform X28.4e-5576.77Show/hide
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        M+G  HV    SSSSLTTDLFGS  TS SST+GIFGSIF+PSSKVLG +SLLS+TKE ER SVN+PW PNA+ QDD AN  QKES+EMKNKD SSIYQDQ
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         AQPC  +SSIYYGGQDVY HPQNS+NSG NS +KK+GGEDDSGSASRGNWWQGT
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A0A5D3DIY4 Uncharacterized protein2.4e-5476.13Show/hide
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         AQPC  +SSIYYGGQDVY HPQNS+NSG NS +KK+GGEDDSGSASRGNWWQG+
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A0A6J1DDV5 uncharacterized protein LOC1110194801.7e-5577.63Show/hide
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        M+G   + SSSSLT DLFGSK TS SST+GIFGSIF+PSSKVLGG+SLLS+ KE ER SVN+PWIPN + +DD AN RQKES+EMKNKD SSIYQ+QRAQ
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        PC  +SSIYYGGQDVY+  QNSHNSGVNS FKKDGGEDDSGSASRGNWWQG+
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A0A6J1EV60 uncharacterized protein LOC1114381924.7e-7498.03Show/hide
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A0A6J1HNF5 uncharacterized protein LOC1114662308.9e-7396.71Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39855.2 unknown protein7.9e-1341.78Show/hide
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        SSSS    +FG +   + SSST+G+F SIF P S V  G +L SR      A+  QP         +T N+R + S   KNK+  S   ++   PC  +S
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        SIYYGGQD Y+    + ++     +KKDG E DS SASRGNWW+G+
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AT3G55646.1 unknown protein3.3e-1137.16Show/hide
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        SSSSL++   +FG + +SSSS+S  G+F SIF P S     D L  +     +    +   PNA  + + +N+++K+          S Y ++   PC  
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        +SS+YYGGQ+ Y    +S  +  + T+KKDG E DS  ASRGNWW+G+
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AT5G02020.1 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).2.1e-2653.1Show/hide
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        SSSSLT++LFGS+   SS S+SGI GSIF P SKVLG +S+  R + +     N+       + D         +RE +    S   QDQR QPC  +SS
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        IYYGG DVY  PQNS +   NST KKDGGEDDSGSASRGNWWQG+
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AT5G02020.2 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).1.1e-1446.96Show/hide
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        IYYGG DVY  PQNS
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AT5G59080.1 unknown protein5.3e-0934.57Show/hide
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        M+G   V S    SSS T +LFGSK  S  SS+SGIF ++F   SK                         +A D  ++ +  Q + RE  N       Q
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        + R +PC  +SS+YYGGQDVYA    +         ++  GEDD+        SRGNWWQG+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGGAAACAACCATGTGCGTTCCTCTTCTTCTCTCACCACTGACCTCTTTGGCTCTAAACGCACTTCCTCTTCTTCTACCTCTGGGATTTTTGGCTCTATTTTCTC
CCCTTCTTCCAAGGTGTTAGGGGGAGACTCACTGCTCTCTCGAACCAAAGAGATTGAAAGGGCTTCTGTAAATCAGCCTTGGATCCCCAACGCTGATGATCAAGATGATA
CTGCCAATCAAAGACAAAAGGAGAGTCGGGAGATGAAGAATAAAGATTCAAGTTCCATCTATCAGGATCAAAGAGCCCAACCATGTCAGTTTACCTCATCAATCTATTAT
GGTGGCCAAGATGTTTATGCTCATCCTCAGAATTCTCACAATTCTGGGGTGAACTCGACGTTCAAGAAGGACGGGGGAGAAGACGATTCTGGAAGTGCTTCAAGAGGAAA
TTGGTGGCAAGGTACATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACCCCCCCTTTCTCTTTCTCTCTCTCTTTCTCTGCTCCCTCTGTTCTTCCGCCATTAAAGCTCCTTCATCCACTACCACCTGACGCCCTACTCTGTTTTTCACTGTTTT
GGATCAAAATGGACGGAAACAACCATGTGCGTTCCTCTTCTTCTCTCACCACTGACCTCTTTGGCTCTAAACGCACTTCCTCTTCTTCTACCTCTGGGATTTTTGGCTCT
ATTTTCTCCCCTTCTTCCAAGGTGTTAGGGGGAGACTCACTGCTCTCTCGAACCAAAGAGATTGAAAGGGCTTCTGTAAATCAGCCTTGGATCCCCAACGCTGATGATCA
AGATGATACTGCCAATCAAAGACAAAAGGAGAGTCGGGAGATGAAGAATAAAGATTCAAGTTCCATCTATCAGGATCAAAGAGCCCAACCATGTCAGTTTACCTCATCAA
TCTATTATGGTGGCCAAGATGTTTATGCTCATCCTCAGAATTCTCACAATTCTGGGGTGAACTCGACGTTCAAGAAGGACGGGGGAGAAGACGATTCTGGAAGTGCTTCA
AGAGGAAATTGGTGGCAAGGTACATAGGATCATAGATCGACCTCTTATTTTATGAAGCTAGACGATAGCGAGATCGTTGTGAACAACAAAGCTGGTTGATCCATTTTCCA
GCCGAACACAACAGAATCTCTTTTAGTTAATAGAATAGATATAAGCATCTTTCTAAATTTTACTGTAAAGAATGCTGTTGCTGCTACTGCTTTTGTTTGCTGGTTTGTTT
GAACCTTGGTGTTTTTAAGCATAAATGAAATCTGCTGTGCTGTTTGCTAATTAGTATCGTAGGAACGTACGTATATCTTAGAATGATTAAGATACTCTTGTTCTCATGTC
AATTTGATCCTAACTCAACTTGCTTAGCTCCCAAACGCTGAACATGACACTGTAAGTGTCATTTTCGGATCCTTACCTGAAGTTAAGGATATGTCGACAGAGTTGCAGGC
CAAAACCAGTCATTTTCTGTGGAGGTTTATGACTCTTGCTTTTCCATGGTCGTTATGTTTGGCCGTTGGGAAAAGAAATAATTGAAAAGATTGATGGGATAGGGACAGAG
ATTCTGCAGCCACAATTCTTGGCAATGTTTGATCTTCATTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATGTTACTTTCGGTTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDGNNHVRSSSSLTTDLFGSKRTSSSSTSGIFGSIFSPSSKVLGGDSLLSRTKEIERASVNQPWIPNADDQDDTANQRQKESREMKNKDSSSIYQDQRAQPCQFTSSIYY
GGQDVYAHPQNSHNSGVNSTFKKDGGEDDSGSASRGNWWQGT