; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13462 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13462
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description60S ribosomal protein L6
Genome locationCarg_Chr08:2946477..2948094
RNA-Seq ExpressionCarg13462
SyntenyCarg13462
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0002181 - cytoplasmic translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000915 - 60S ribosomal protein L6E
IPR005568 - Ribosomal protein L6, N-terminal
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2
IPR041997 - Ribosomal Protein L6, KOW domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_011659463.1 60S ribosomal protein L6-1 [Cucumis sativus]4.6e-11594.37Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKA A  EKPPKFYPADDVKKPLVNKRKA+LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKV+ISGVN+EKFDDKYFSKE QKKKKK EGEFFEAEKEEKSALPA+KKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIE VPELKAYL ARFSLK+GMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

XP_022959727.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita moschata]1.5e-121100Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

XP_022991926.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita maxima]4.1e-11695.24Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PKADA  EK PKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSY IATSTKV+ISGVN EKFDDKYFSKEVQKKKKK EGEFFEAEKEEKSALPAD+KDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIEGVPELKAYLAARFSLK+GMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

XP_023004644.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita maxima]1.2e-12099.13Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVE SGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

XP_038896966.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Benincasa hispida]4.6e-11593.94Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PKADA  EKPPKFYPADDVKKPLVNKRK +LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKV+ISGVN+EKFDDKYFSKEVQKKKKK EGEFFEAEKEEKS LPADKKDDQ+AVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIE VPELKAYL ARFSLK+GMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9V0 60S ribosomal protein L62.2e-11594.37Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKA A  EKPPKFYPADDVKKPLVNKRKA+LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKV+ISGVN+EKFDDKYFSKE QKKKKK EGEFFEAEKEEKSALPA+KKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIE VPELKAYL ARFSLK+GMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

A0A6J1GSP4 60S ribosomal protein L6-3-like6.4e-11594.37Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+ KADA  EK PKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSY IATSTKV+ISGVN EKFDDKYFSKEVQKKKKK EGEFFEAEKEEKSALPAD+KDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSI+GVPELKAYLAARFSLK+GMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

A0A6J1H5C5 60S ribosomal protein L67.1e-122100Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

A0A6J1JS55 60S ribosomal protein L6-1-like2.0e-11695.24Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PKADA  EK PKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSY IATSTKV+ISGVN EKFDDKYFSKEVQKKKKK EGEFFEAEKEEKSALPAD+KDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIEGVPELKAYLAARFSLK+GMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

A0A6J1KWW3 60S ribosomal protein L66.0e-12199.13Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVE SGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P34091 60S ribosomal protein L61.9e-10080.7Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        + P V+RNP+L+RG+GKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFP+H  +     AVEKPPKFYPADDVKKPL+NKRK + TKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVIATSTKV+ISGVN EKFDDKYF K+ +KK KK EGEFFEAEK+E + LP +KKDDQKAVD  L+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IEGVPELKAYL ARFSLK+GMKPHEL F
Subjt:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

Q2YGT9 60S ribosomal protein L68.5e-4845.56Show/hide
Query:  PRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKP-----------------PKFYPADDVKKPLVNKRK----ARLTKLR
        P  +RNP L+RG+G+YSRS MY ++ L+  K            + +  A V KP                 P++YP +DV + L++  K      + KLR
Subjt:  PRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKP-----------------PKFYPADDVKKPLVNKRK----ARLTKLR

Query:  ASITPGTVLIILAGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVN-TEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKS
        ASITPGT+LIIL GR +GKRV+FLKQL SGLLLVTGP  +N VPLRR +Q +VIATSTK++ISGV   E   D YF K+  +K +  EGE F+ EK EK 
Subjt:  ASITPGTVLIILAGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVN-TEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKS

Query:  ALPADKKDDQKAVDTPLIKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
         +   +K DQKAVD+ +++ I+ VP+L+ YL + F+L +G+ PH+L F
Subjt:  ALPADKKDDQKAVDTPLIKSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

Q9C9C5 60S ribosomal protein L6-31.7e-10182.89Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        +TP+V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+ K DA VEKPPKFYPA+DVKKPL N+R A+ TKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTKV+ISGV  +KFDDKYF K  +KKKKK+EGEFFEAEKEEK  +P  KKDDQKAVD  LIK+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IE VPELK YL ARFSLK GMKPHEL F
Subjt:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

Q9C9C6 60S ribosomal protein L6-23.3e-10082.02Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        +T +V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+ K DA VEKPPKFYPA+DVKKPL N+R A+  KLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTKV+ISGV  +KFDDKYF K  +KKKKK+EGEFFEAEKEEK  +P  KKDDQKAVD  LIK+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IE VPELK YL ARFSLK GMKPHEL F
Subjt:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

Q9FZ76 60S ribosomal protein L6-18.4e-10483.04Show/hide
Query:  APKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFK
        A +TP+V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPK DA VEKP KFYPA+DVKKPLVN+RK + TKL+ASITPGTVLIILAGRFK
Subjt:  APKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLI
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTK++ISGVNTEKFDDKYF K  +KKKKK+EGEFFEAEKEEK  +P +KK+DQK VD  LI
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLI

Query:  KSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        KSIE VPELK YL ARFSL  GMKPHEL F
Subjt:  KSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18540.1 Ribosomal protein L6 family protein6.0e-10583.04Show/hide
Query:  APKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFK
        A +TP+V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPK DA VEKP KFYPA+DVKKPLVN+RK + TKL+ASITPGTVLIILAGRFK
Subjt:  APKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLI
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTK++ISGVNTEKFDDKYF K  +KKKKK+EGEFFEAEKEEK  +P +KK+DQK VD  LI
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLI

Query:  KSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        KSIE VPELK YL ARFSL  GMKPHEL F
Subjt:  KSIEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

AT1G74050.1 Ribosomal protein L6 family protein1.2e-10282.89Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        +TP+V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+ K DA VEKPPKFYPA+DVKKPL N+R A+ TKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTKV+ISGV  +KFDDKYF K  +KKKKK+EGEFFEAEKEEK  +P  KKDDQKAVD  LIK+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IE VPELK YL ARFSLK GMKPHEL F
Subjt:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF

AT1G74060.1 Ribosomal protein L6 family protein2.3e-10182.02Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        +T +V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+ K DA VEKPPKFYPA+DVKKPL N+R A+  KLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTKV+ISGV  +KFDDKYF K  +KKKKK+EGEFFEAEKEEK  +P  KKDDQKAVD  LIK+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF
        IE VPELK YL ARFSLK GMKPHEL F
Subjt:  IEGVPELKAYLAARFSLKSGMKPHELAF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCCCAAAACCCCTAGAGTTACCAGAAACCCGGATCTAATCCGAGGCGTCGGTAAGTACTCGAGGTCTAAGATGTATCACAAGCGAGGTCTTTGGGCCATCAAGGC
CAAAAACGGCGGAGTGTTCCCTCGTCATGATGCCCAGCCAAAAGCTGATGCCGCAGTCGAGAAGCCGCCGAAGTTTTATCCTGCCGATGATGTGAAGAAGCCCCTTGTTA
ACAAGCGCAAGGCCAGACTCACGAAGCTAAGAGCCAGCATTACTCCCGGTACCGTGTTGATTATCCTTGCTGGGAGATTCAAGGGGAAGAGAGTTGTGTTTTTGAAACAG
CTTCCATCTGGGTTGCTTCTGGTCACTGGGCCTTTCAAGATTAATGGTGTTCCTCTAAGACGGGTGAACCAATCATACGTCATTGCAACGTCCACCAAAGTTGAAATCTC
TGGAGTTAACACCGAGAAGTTCGACGACAAGTATTTCTCCAAGGAAGTTCAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTGAAGGCGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAAAGTG
CCCTCCCAGCTGACAAGAAGGATGACCAGAAAGCTGTGGATACACCATTGATAAAGTCGATCGAGGGTGTTCCGGAGTTGAAGGCGTACTTGGCAGCAAGATTTTCTCTC
AAGTCTGGAATGAAACCTCATGAGCTTGCCTTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGGCGGTAGTTTCTTTCTCGTTGAAGAAGAGCAGCAGATTCTCGCAGGGATACGATAATGGCGCCCAAAACCCCTAGAGTTACCAGAAACCCGGATCTAATCCGAGGCGT
CGGTAAGTACTCGAGGTCTAAGATGTATCACAAGCGAGGTCTTTGGGCCATCAAGGCCAAAAACGGCGGAGTGTTCCCTCGTCATGATGCCCAGCCAAAAGCTGATGCCG
CAGTCGAGAAGCCGCCGAAGTTTTATCCTGCCGATGATGTGAAGAAGCCCCTTGTTAACAAGCGCAAGGCCAGACTCACGAAGCTAAGAGCCAGCATTACTCCCGGTACC
GTGTTGATTATCCTTGCTGGGAGATTCAAGGGGAAGAGAGTTGTGTTTTTGAAACAGCTTCCATCTGGGTTGCTTCTGGTCACTGGGCCTTTCAAGATTAATGGTGTTCC
TCTAAGACGGGTGAACCAATCATACGTCATTGCAACGTCCACCAAAGTTGAAATCTCTGGAGTTAACACCGAGAAGTTCGACGACAAGTATTTCTCCAAGGAAGTTCAGA
AGAAGAAGAAGAAGAGTGAAGGCGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAAAGTGCCCTCCCAGCTGACAAGAAGGATGACCAGAAAGCTGTGGATACACCATTGATA
AAGTCGATCGAGGGTGTTCCGGAGTTGAAGGCGTACTTGGCAGCAAGATTTTCTCTCAAGTCTGGAATGAAACCTCATGAGCTTGCCTTTTAGATAAGGGATTTGTTTGT
TTTTTGTTCATCTCAACTTGTTCACGACTTGTTACAATAGTTACCTGTCCCAATTTTTTATTCGAAATGGAGATTCCATGGTTCACAATTTCTCTTTCTTTTTGGAATAC
ATATATATATACATATGTATGTATGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAQPKADAAVEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKARLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGKRVVFLKQ
LPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVEISGVNTEKFDDKYFSKEVQKKKKKSEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKSIEGVPELKAYLAARFSL
KSGMKPHELAF