; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13597 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13597
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionmultiprotein-bridging factor 1b-like
Genome locationCarg_Chr02:485485..486806
RNA-Seq ExpressionCarg13597
SyntenyCarg13597
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604778.1 Multiprotein-bridging factor 1b, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.0e-6499.3Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVN ARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022943574.1 multiprotein-bridging factor 1b [Cucurbita moschata]8.0e-6295.77Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI PL+QDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022947947.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita moschata]1.7e-64100Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_023533868.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-6499.3Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_038902723.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Benincasa hispida]2.1e-6297.18Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI PLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM ARMEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V8Z5 Multiprotein-bridging factor 1b5.1e-6296.48Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI PLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM AR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1D976 multiprotein-bridging factor 1b-like3.9e-6296.48Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI PLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1FUR1 multiprotein-bridging factor 1b3.9e-6295.77Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI PL+QDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1G7T9 multiprotein-bridging factor 1b-like8.4e-65100Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1JEZ7 multiprotein-bridging factor 1b3.9e-6295.77Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI PL+QDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3T0V7 Endothelial differentiation-related factor 14.2e-2958.65Show/hide
Query:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V VLRKK P AA  K ++A+ AA+R G ++ET KK AAG NK    S + NT KLD ETE L HDRV  E+ K I Q R  K LTQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q5ZMC0 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog3.2e-2958.65Show/hide
Query:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V VLRKK P+AA  K ++AV AA+R G ++ET KK AAG NK      + NT KLD ETE L HDRVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LV58 Multiprotein-bridging factor 1c1.4e-2952.55Show/hide
Query:  LSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQL
        ++QDWEPVVL K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE    DRV  E++  I +AR+EKK++Q+ LA+ 
Subjt:  LSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQL

Query:  INEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        INE+ QV+QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  INEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b1.6e-5783.8Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI P++QDWEPVV+RK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AGSNK+ASS TSLNT+KLD++TENL+HDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a1.5e-5580.99Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI P++QDWEPVV+RKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AG+NK+ASS TSLNT+ LD++TENLTH+RVPTELKKAIMQAR +KKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A1.1e-5680.99Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI P++QDWEPVV+RKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AG+NK+ASS TSLNT+ LD++TENLTH+RVPTELKKAIMQAR +KKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C1.0e-3052.55Show/hide
Query:  LSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQL
        ++QDWEPVVL K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE    DRV  E++  I +AR+EKK++Q+ LA+ 
Subjt:  LSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQL

Query:  INEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        INE+ QV+QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  INEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C1.2e-1045.98Show/hide
Query:  LSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQAR
        ++QDWEPVVL K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE    DRV  E++  + + R
Subjt:  LSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQAR

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B1.2e-5883.8Show/hide
Query:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ
        MAGI P++QDWEPVV+RK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AGSNK+ASS TSLNT+KLD++TENL+HDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGAATCGTACCACTTTCACAGGATTGGGAACCGGTGGTCCTCAGGAAGAAGGCACCGAACGCGGCGGCCAAGAAGGATGAGAAAGCCGTCAATGCTGCTAGGCG
AGCCGGGGCGGAGATTGAAACCATAAAGAAATCTGCTGCTGGCTCAAACAAATCTGCTTCTAGCAGTACTAGTTTGAACACCAGGAAACTCGACGAAGAAACTGAGAATC
TTACTCATGACCGAGTACCAACCGAGCTGAAGAAAGCAATTATGCAAGCTCGAATGGAGAAGAAGCTTACTCAGTCTCAGCTTGCTCAACTTATTAATGAGAAGCCTCAA
GTTATCCAGGAGTATGAATCTGGAAAAGCTATTCCAAATCAACAAATAATAACCAAACTTGAGAGAGCTCTTGGAGCAAAACTGCGTGGGAAGAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGCTATCCAGACATTTTAATATGGCCGACTAGAAGTCGCTAAGCCAGATTCTGCGTACTATCGAGCGAGGACCTCTTGGAAAGGAGAAAAGGAGACTAGAAATGGCTGG
AATCGTACCACTTTCACAGGATTGGGAACCGGTGGTCCTCAGGAAGAAGGCACCGAACGCGGCGGCCAAGAAGGATGAGAAAGCCGTCAATGCTGCTAGGCGAGCCGGGG
CGGAGATTGAAACCATAAAGAAATCTGCTGCTGGCTCAAACAAATCTGCTTCTAGCAGTACTAGTTTGAACACCAGGAAACTCGACGAAGAAACTGAGAATCTTACTCAT
GACCGAGTACCAACCGAGCTGAAGAAAGCAATTATGCAAGCTCGAATGGAGAAGAAGCTTACTCAGTCTCAGCTTGCTCAACTTATTAATGAGAAGCCTCAAGTTATCCA
GGAGTATGAATCTGGAAAAGCTATTCCAAATCAACAAATAATAACCAAACTTGAGAGAGCTCTTGGAGCAAAACTGCGTGGGAAGAAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGIVPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARMEKKLTQSQLAQLINEKPQ
VIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK