; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg13790 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg13790
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationCarg_Chr03:4663547..4665043
RNA-Seq ExpressionCarg13790
SyntenyCarg13790
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6603678.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-29299.6Show/hide
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KAG7033855.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.4e-293100Show/hide
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XP_022949636.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g42450, mitochondrial-like [Cucurbita moschata]1.8e-28998.8Show/hide
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XP_022977247.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g42450, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]2.8e-28798.19Show/hide
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XP_023544385.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g42450, mitochondrial-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-28697.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KX53 Uncharacterized protein2.8e-25687.53Show/hide
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A0A5A7U174 Pentatricopeptide repeat-containing protein1.3e-23783.4Show/hide
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A0A6J1CRE4 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g42450, mitochondrial1.2e-25186.21Show/hide
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A0A6J1GCJ3 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g42450, mitochondrial-like8.5e-29098.8Show/hide
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        AAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESEDFNFLSDS
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A0A6J1IHX7 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g42450, mitochondrial-like1.4e-28798.19Show/hide
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        +KLKADAHGAVVTPA QSKK PFPRGELDARQLFDKMPQLNVVSATAMIG CARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLH
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Query:  ACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVIEEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDM
        ACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVIEEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQ ALRVFD+MPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDM
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Query:  LREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIGRSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQ
        LREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIGRSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQ
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Query:  RMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVDEGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGEL
        RMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVDEGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQF+RAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGEL
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        AAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIE RSKVHVFVTGDK+HHQKDEICSTLKFFVEHLKESEDFNFLSDS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FIH2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g42450, mitochondrial5.3e-16459.62Show/hide
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        +A ++FD++P+L+V+SATA+IGR  ++ +H EA   F  +  L +RPNEFTFGTVI S+T   D+ +GKQLH  A+K+GL SNVFVGSA L+ YVKLS +
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         +A+R FDD + PNVVS T+LISGYLK  + ++AL +F  MPER++V+WNA+IGGFSQ G NE+AV+ F+DMLREG  +P +STFPCA+ A +NIAS G 
Subjt:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREG-FLPTQSTFPCALCAAANIASIGI

Query:  GRSFHACAIKFLGD-LDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKL-LDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRM-SFSGCKPNGVTLLSLLWACNHA
        G+S HACAIKFLG   +VFV NSLISFY+KCG+MEDSLL FNKL  ++RN VSWN+++ GYA NGRG+EA+  +++M   +  +PN VT+L +L+ACNHA
Subjt:  GRSFHACAIKFLGD-LDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKL-LDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRM-SFSGCKPNGVTLLSLLWACNHA

Query:  GLVDEGYSYFNQA--KLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNA
        GL+ EGY YFN+A    ++P+LL+ EHYACMVD+LSRSG+F+ AEE I  +P DPGIGFWKALLGGCQIHSN  L +LAA +IL LDP DVSSYVM+SNA
Subjt:  GLVDEGYSYFNQA--KLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNA

Query:  HSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESE
        +SA   W +VS++RR+MKE G+KR  GCSWIE+R ++ VFV  DKN+  KDE+   L    +HL+E+E
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Q9FWA6 Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g02330, mitochondrial3.2e-9237.39Show/hide
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        +A ++FD+M + + VS  A+I    +  +  E L LF +M    + P+EFTFG+++ + T  G +  G ++H+  +K G+ SN  VG + +D+Y K  +I
Subjt:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI

Query:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG
        EEA++          VS T           +++  ++ ++  +   VSWN++I G+  K  +EDA  LF  M+  G  P + T+   L   AN+AS G+G
Subjt:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG

Query:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD
        +  HA  IK     DV++ ++L+  Y+KCG + DS L+F K L +R+ V+WNA++CGYA +G+G+EAI  ++RM     KPN VT +S+L AC H GL+D
Subjt:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD

Query:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIH-SNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAG
        +G  YF   K +     +  HY+ MVD+L +SG+ +RA E I ++PF+     W+ LLG C IH +N+E+ E A   +L LDP D S+Y ++SN ++ AG
Subjt:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIH-SNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAG

Query:  KWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESEDFNFL
         W  VS LRR M+   +K+ PGCSW+E++ ++HVF+ GDK H + +EI   L      +K  +D +F+
Subjt:  KWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESEDFNFL

Q9LIQ7 Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g24000, mitochondrial3.0e-9037.45Show/hide
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        +AR++F+KMPQ + V+ T +I   ++  +  +AL  F+ M      PNEFT  +VI +A A      G QLH   +K G  SNV VGSA LDLY +  ++
Subjt:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI

Query:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG
        ++AQ                                VFD +  RN VSWNA+I G +++   E A+ LF  MLR+GF P+  ++     A ++   +  G
Subjt:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG

Query:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD
        +  HA  IK    L  F  N+L+  YAK GS+ D+  +F++L  KR+ VSWN++L  YAQ+G GKEA+ +++ M   G +PN ++ LS+L AC+H+GL+D
Subjt:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD

Query:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPE--HYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAA
        EG+ Y+   K +    + PE  HY  +VDLL R+G   RA  FI ++P +P    WKALL  C++H N ELG  AA+ +  LDP D   +V++ N +++ 
Subjt:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPE--HYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAA

Query:  GKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKE
        G+W+  + +R++MKE G+K+ P CSW+EI + +H+FV  D+ H Q++EI    +  +  +KE
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Q9SI53 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g03880, mitochondrial1.3e-9337.12Show/hide
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        DA QLFD+MPQ NV+S T MI   ++   H++AL L   M   N+RPN +T+ +V+ S   + D+   + LH   IK GL S+VFV SA +D++ KL   
Subjt:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI

Query:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG
                                     + +DAL VFDEM   + + WN++IGGF+Q   ++ A+ LF  M R GF+  Q+T    L A   +A + +G
Subjt:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG

Query:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD
           H   +K+  D D+ ++N+L+  Y KCGS+ED+L VFN+ + +R+ ++W+ ++ G AQNG  +EA+  ++RM  SG KPN +T++ +L+AC+HAGL++
Subjt:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD

Query:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAGK
        +G+ YF   K         EHY CM+DLL ++G+   A + ++++  +P    W+ LLG C++  NM L E AA++++ALDP D  +Y ++SN ++ + K
Subjt:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAGK

Query:  WHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHL
        W SV  +R  M+++G+K+ PGCSWIE+  ++H F+ GD +H Q  E+   L   +  L
Subjt:  WHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHL

Q9SIT7 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g136003.0e-9837.87Show/hide
Query:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIG-LHSNVFVGSAALDLYVKLSV
        DA+++FD+M   NVVS  ++I    +     EAL +F  M    + P+E T  +VI +  +L  I +G+++H   +K   L +++ + +A +D+Y K S 
Subjt:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIG-LHSNVFVGSAALDLYVKLSV

Query:  IEEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGI
        I+EA+  FD + + NV++ TS+ISGY      + A  +F +M ERN+VSWNA+I G++Q G NE+A+ LF  + RE   PT  +F   L A A++A + +
Subjt:  IEEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGI

Query:  GRSFHACAIKF------LGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWAC
        G   H   +K         + D+FV NSLI  Y KCG +E+  LVF K+++ R+ VSWNA++ G+AQNG G EA++ ++ M  SG KP+ +T++ +L AC
Subjt:  GRSFHACAIKF------LGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWAC

Query:  NHAGLVDEGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSN
         HAG V+EG  YF+    +       +HY CMVDLL R+G    A+  I ++P  P    W +LL  C++H N+ LG+  A+++L ++PS+   YV++SN
Subjt:  NHAGLVDEGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSN

Query:  AHSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESED
         ++  GKW  V  +R+ M+++G+ + PGCSWI+I+   HVF+  DK+H +K +I S L   +  ++  +D
Subjt:  AHSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESED

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G03880.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein9.2e-9537.12Show/hide
Query:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI
        DA QLFD+MPQ NV+S T MI   ++   H++AL L   M   N+RPN +T+ +V+ S   + D+   + LH   IK GL S+VFV SA +D++ KL   
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Query:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG
                                     + +DAL VFDEM   + + WN++IGGF+Q   ++ A+ LF  M R GF+  Q+T    L A   +A + +G
Subjt:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG

Query:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD
           H   +K+  D D+ ++N+L+  Y KCGS+ED+L VFN+ + +R+ ++W+ ++ G AQNG  +EA+  ++RM  SG KPN +T++ +L+AC+HAGL++
Subjt:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD

Query:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAGK
        +G+ YF   K         EHY CM+DLL ++G+   A + ++++  +P    W+ LLG C++  NM L E AA++++ALDP D  +Y ++SN ++ + K
Subjt:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAGK

Query:  WHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHL
        W SV  +R  M+++G+K+ PGCSWIE+  ++H F+ GD +H Q  E+   L   +  L
Subjt:  WHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHL

AT2G13600.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.1e-9937.87Show/hide
Query:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIG-LHSNVFVGSAALDLYVKLSV
        DA+++FD+M   NVVS  ++I    +     EAL +F  M    + P+E T  +VI +  +L  I +G+++H   +K   L +++ + +A +D+Y K S 
Subjt:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIG-LHSNVFVGSAALDLYVKLSV

Query:  IEEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGI
        I+EA+  FD + + NV++ TS+ISGY      + A  +F +M ERN+VSWNA+I G++Q G NE+A+ LF  + RE   PT  +F   L A A++A + +
Subjt:  IEEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGI

Query:  GRSFHACAIKF------LGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWAC
        G   H   +K         + D+FV NSLI  Y KCG +E+  LVF K+++ R+ VSWNA++ G+AQNG G EA++ ++ M  SG KP+ +T++ +L AC
Subjt:  GRSFHACAIKF------LGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWAC

Query:  NHAGLVDEGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSN
         HAG V+EG  YF+    +       +HY CMVDLL R+G    A+  I ++P  P    W +LL  C++H N+ LG+  A+++L ++PS+   YV++SN
Subjt:  NHAGLVDEGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSN

Query:  AHSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESED
         ++  GKW  V  +R+ M+++G+ + PGCSWI+I+   HVF+  DK+H +K +I S L   +  ++  +D
Subjt:  AHSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESED

AT3G02330.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.3e-9337.39Show/hide
Query:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI
        +A ++FD+M + + VS  A+I    +  +  E L LF +M    + P+EFTFG+++ + T  G +  G ++H+  +K G+ SN  VG + +D+Y K  +I
Subjt:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI

Query:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG
        EEA++          VS T           +++  ++ ++  +   VSWN++I G+  K  +EDA  LF  M+  G  P + T+   L   AN+AS G+G
Subjt:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG

Query:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD
        +  HA  IK     DV++ ++L+  Y+KCG + DS L+F K L +R+ V+WNA++CGYA +G+G+EAI  ++RM     KPN VT +S+L AC H GL+D
Subjt:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD

Query:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIH-SNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAG
        +G  YF   K +     +  HY+ MVD+L +SG+ +RA E I ++PF+     W+ LLG C IH +N+E+ E A   +L LDP D S+Y ++SN ++ AG
Subjt:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIH-SNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAG

Query:  KWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESEDFNFL
         W  VS LRR M+   +K+ PGCSW+E++ ++HVF+ GDK H + +EI   L      +K  +D +F+
Subjt:  KWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESEDFNFL

AT3G24000.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein2.1e-9137.45Show/hide
Query:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI
        +AR++F+KMPQ + V+ T +I   ++  +  +AL  F+ M      PNEFT  +VI +A A      G QLH   +K G  SNV VGSA LDLY +  ++
Subjt:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI

Query:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG
        ++AQ                                VFD +  RN VSWNA+I G +++   E A+ LF  MLR+GF P+  ++     A ++   +  G
Subjt:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAANIASIGIG

Query:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD
        +  HA  IK    L  F  N+L+  YAK GS+ D+  +F++L  KR+ VSWN++L  YAQ+G GKEA+ +++ M   G +PN ++ LS+L AC+H+GL+D
Subjt:  RSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVD

Query:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPE--HYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAA
        EG+ Y+   K +    + PE  HY  +VDLL R+G   RA  FI ++P +P    WKALL  C++H N ELG  AA+ +  LDP D   +V++ N +++ 
Subjt:  EGYSYFNQAKLENPSLLKPE--HYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAA

Query:  GKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKE
        G+W+  + +R++MKE G+K+ P CSW+EI + +H+FV  D+ H Q++EI    +  +  +KE
Subjt:  GKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKE

AT5G42450.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein3.8e-16559.62Show/hide
Query:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI
        +A ++FD++P+L+V+SATA+IGR  ++ +H EA   F  +  L +RPNEFTFGTVI S+T   D+ +GKQLH  A+K+GL SNVFVGSA L+ YVKLS +
Subjt:  DARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHSNVFVGSAALDLYVKLSVI

Query:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREG-FLPTQSTFPCALCAAANIASIGI
         +A+R FDD + PNVVS T+LISGYLK  + ++AL +F  MPER++V+WNA+IGGFSQ G NE+AV+ F+DMLREG  +P +STFPCA+ A +NIAS G 
Subjt:  EEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREG-FLPTQSTFPCALCAAANIASIGI

Query:  GRSFHACAIKFLGD-LDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKL-LDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRM-SFSGCKPNGVTLLSLLWACNHA
        G+S HACAIKFLG   +VFV NSLISFY+KCG+MEDSLL FNKL  ++RN VSWN+++ GYA NGRG+EA+  +++M   +  +PN VT+L +L+ACNHA
Subjt:  GRSFHACAIKFLGD-LDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKL-LDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRM-SFSGCKPNGVTLLSLLWACNHA

Query:  GLVDEGYSYFNQA--KLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNA
        GL+ EGY YFN+A    ++P+LL+ EHYACMVD+LSRSG+F+ AEE I  +P DPGIGFWKALLGGCQIHSN  L +LAA +IL LDP DVSSYVM+SNA
Subjt:  GLVDEGYSYFNQA--KLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNA

Query:  HSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESE
        +SA   W +VS++RR+MKE G+KR  GCSWIE+R ++ VFV  DKN+  KDE+   L    +HL+E+E
Subjt:  HSAAGKWHSVSILRREMKEKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACTCAAAGCGGATGCCCATGGCGCCGTTGTTACTCCGGCTGAACAATCCAAGAAAGCCCCATTTCCTCGCGGTGAATTGGATGCCCGCCAACTGTTCGACAAAAT
GCCTCAATTAAACGTGGTTTCTGCAACCGCTATGATTGGGCGCTGCGCAAGGCAGCATCAGCACGAAGAGGCATTGTGTCTATTTTCTGCAATGTTTGTGTTAAATTTAA
GGCCCAATGAGTTCACTTTTGGCACTGTGATTCACTCTGCAACGGCACTCGGAGACATTGATATTGGCAAGCAACTTCATGCTTGTGCCATAAAAATAGGCCTTCACTCT
AATGTGTTTGTTGGTAGTGCGGCTTTGGATTTGTATGTCAAGTTGAGTGTCATTGAGGAAGCTCAAAGGGCTTTTGATGATATCAAGATGCCTAATGTGGTTTCTTACAC
TAGTTTGATTTCTGGGTACTTGAAAACAGAGAAGATTCAAGATGCGCTCCGGGTGTTCGATGAAATGCCCGAGCGAAACATCGTGTCCTGGAATGCTATGATTGGCGGGT
TTAGCCAAAAGGGACACAATGAAGATGCTGTACATCTCTTCATTGATATGCTCAGAGAAGGGTTTTTGCCCACTCAATCTACTTTTCCTTGTGCTTTATGTGCTGCTGCT
AATATAGCTTCCATTGGAATAGGGAGGAGTTTTCATGCTTGTGCTATCAAGTTCTTGGGCGATCTCGACGTGTTCGTGAGCAATTCGCTTATTAGTTTTTATGCAAAATG
TGGAAGTATGGAAGATAGTTTGTTGGTTTTCAATAAATTGCTTGACAAAAGAAATACAGTTTCATGGAACGCTGTCCTTTGTGGTTATGCTCAAAATGGTAGGGGAAAGG
AAGCCATAGATTTCTACCAGAGGATGAGTTTTTCAGGCTGCAAACCCAATGGAGTGACACTTCTTAGCTTGTTATGGGCTTGTAATCATGCTGGCCTAGTTGATGAAGGT
TATTCATATTTCAATCAGGCGAAACTCGAGAACCCCAGCTTGTTAAAACCCGAGCATTATGCTTGTATGGTCGATTTGCTCTCACGTTCAGGTCAGTTTAGACGAGCAGA
GGAGTTTATACACGACCTACCCTTCGATCCAGGGATTGGGTTTTGGAAAGCATTGCTTGGGGGCTGCCAAATTCACTCGAATATGGAACTTGGGGAGCTTGCAGCTCAAA
GAATCCTGGCCTTGGATCCAAGTGATGTCTCGTCGTATGTAATGATGTCGAACGCGCATTCAGCAGCCGGGAAATGGCATAGCGTGTCGATATTAAGAAGGGAAATGAAG
GAGAAGGGGATGAAGAGAATTCCGGGTTGCAGTTGGATTGAAATTAGAAGCAAAGTTCATGTCTTTGTAACTGGTGACAAAAATCACCACCAAAAGGATGAAATTTGTTC
TACCTTGAAATTTTTTGTTGAACACTTGAAAGAGAGTGAAGATTTCAACTTTCTTTCAGATTCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAACTCAAAGCGGATGCCCATGGCGCCGTTGTTACTCCGGCTGAACAATCCAAGAAAGCCCCATTTCCTCGCGGTGAATTGGATGCCCGCCAACTGTTCGACAAAAT
GCCTCAATTAAACGTGGTTTCTGCAACCGCTATGATTGGGCGCTGCGCAAGGCAGCATCAGCACGAAGAGGCATTGTGTCTATTTTCTGCAATGTTTGTGTTAAATTTAA
GGCCCAATGAGTTCACTTTTGGCACTGTGATTCACTCTGCAACGGCACTCGGAGACATTGATATTGGCAAGCAACTTCATGCTTGTGCCATAAAAATAGGCCTTCACTCT
AATGTGTTTGTTGGTAGTGCGGCTTTGGATTTGTATGTCAAGTTGAGTGTCATTGAGGAAGCTCAAAGGGCTTTTGATGATATCAAGATGCCTAATGTGGTTTCTTACAC
TAGTTTGATTTCTGGGTACTTGAAAACAGAGAAGATTCAAGATGCGCTCCGGGTGTTCGATGAAATGCCCGAGCGAAACATCGTGTCCTGGAATGCTATGATTGGCGGGT
TTAGCCAAAAGGGACACAATGAAGATGCTGTACATCTCTTCATTGATATGCTCAGAGAAGGGTTTTTGCCCACTCAATCTACTTTTCCTTGTGCTTTATGTGCTGCTGCT
AATATAGCTTCCATTGGAATAGGGAGGAGTTTTCATGCTTGTGCTATCAAGTTCTTGGGCGATCTCGACGTGTTCGTGAGCAATTCGCTTATTAGTTTTTATGCAAAATG
TGGAAGTATGGAAGATAGTTTGTTGGTTTTCAATAAATTGCTTGACAAAAGAAATACAGTTTCATGGAACGCTGTCCTTTGTGGTTATGCTCAAAATGGTAGGGGAAAGG
AAGCCATAGATTTCTACCAGAGGATGAGTTTTTCAGGCTGCAAACCCAATGGAGTGACACTTCTTAGCTTGTTATGGGCTTGTAATCATGCTGGCCTAGTTGATGAAGGT
TATTCATATTTCAATCAGGCGAAACTCGAGAACCCCAGCTTGTTAAAACCCGAGCATTATGCTTGTATGGTCGATTTGCTCTCACGTTCAGGTCAGTTTAGACGAGCAGA
GGAGTTTATACACGACCTACCCTTCGATCCAGGGATTGGGTTTTGGAAAGCATTGCTTGGGGGCTGCCAAATTCACTCGAATATGGAACTTGGGGAGCTTGCAGCTCAAA
GAATCCTGGCCTTGGATCCAAGTGATGTCTCGTCGTATGTAATGATGTCGAACGCGCATTCAGCAGCCGGGAAATGGCATAGCGTGTCGATATTAAGAAGGGAAATGAAG
GAGAAGGGGATGAAGAGAATTCCGGGTTGCAGTTGGATTGAAATTAGAAGCAAAGTTCATGTCTTTGTAACTGGTGACAAAAATCACCACCAAAAGGATGAAATTTGTTC
TACCTTGAAATTTTTTGTTGAACACTTGAAAGAGAGTGAAGATTTCAACTTTCTTTCAGATTCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKLKADAHGAVVTPAEQSKKAPFPRGELDARQLFDKMPQLNVVSATAMIGRCARQHQHEEALCLFSAMFVLNLRPNEFTFGTVIHSATALGDIDIGKQLHACAIKIGLHS
NVFVGSAALDLYVKLSVIEEAQRAFDDIKMPNVVSYTSLISGYLKTEKIQDALRVFDEMPERNIVSWNAMIGGFSQKGHNEDAVHLFIDMLREGFLPTQSTFPCALCAAA
NIASIGIGRSFHACAIKFLGDLDVFVSNSLISFYAKCGSMEDSLLVFNKLLDKRNTVSWNAVLCGYAQNGRGKEAIDFYQRMSFSGCKPNGVTLLSLLWACNHAGLVDEG
YSYFNQAKLENPSLLKPEHYACMVDLLSRSGQFRRAEEFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQIHSNMELGELAAQRILALDPSDVSSYVMMSNAHSAAGKWHSVSILRREMK
EKGMKRIPGCSWIEIRSKVHVFVTGDKNHHQKDEICSTLKFFVEHLKESEDFNFLSDS