; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg14042 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg14042
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein timeless homolog isoform X1
Genome locationCarg_Chr02:6404590..6405790
RNA-Seq ExpressionCarg14042
SyntenyCarg14042
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605759.1 Protein timeless-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.5e-0481.82Show/hide
Query:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE
        DDELADSEGEMD+NV YRA+ATTGRKFR+V +E
Subjt:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE

KAG7022464.1 hypothetical protein SDJN02_16195 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.5e-0481.82Show/hide
Query:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE
        DDELADSEGEMD+NV YRA+ATTGRKFR+V +E
Subjt:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE

KAG7035724.1 hypothetical protein SDJN02_02522, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.9e-30100Show/hide
Query:  MEGYSFFEVSQSSETRRDWVSSLYKKLKVRMLKDDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIEMRISN
        MEGYSFFEVSQSSETRRDWVSSLYKKLKVRMLKDDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIEMRISN
Subjt:  MEGYSFFEVSQSSETRRDWVSSLYKKLKVRMLKDDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIEMRISN

XP_022957784.1 protein timeless homolog isoform X1 [Cucurbita moschata]3.1e-0686.49Show/hide
Query:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIEMRIS
        DDELADSEGE DSNV YRATATTGRKFRMVVIEM ++
Subjt:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIEMRIS

XP_023533520.1 protein timeless homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.5e-0481.82Show/hide
Query:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE
        DDELADSEGEMD+NV YRA+ATTGRKFR+V +E
Subjt:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1H072 protein timeless homolog isoform X25.4e-0481.82Show/hide
Query:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE
        DDELADSEGEMDSNV +RA+ATTGRKFR+V +E
Subjt:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE

A0A6J1H2Z9 protein timeless homolog isoform X11.5e-0686.49Show/hide
Query:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIEMRIS
        DDELADSEGE DSNV YRATATTGRKFRMVVIEM ++
Subjt:  DDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIEMRIS

A0A6J1K533 protein timeless homolog3.1e-0469.05Show/hide
Query:  KKLKVRMLKDDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE
        K  +V +  DDELADSEGEMDSNV +RA+ATTGRKFR+V +E
Subjt:  KKLKVRMLKDDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGGCTATTCCTTCTTCGAAGTCAGCCAATCCAGTGAGACAAGGAGAGATTGGGTGTCTAGTTTATACAAGAAGTTGAAGGTAAGGATGCTGAAGGATGATGAGCT
TGCAGATTCGGAAGGTGAAATGGATTCTAATGTGTTGTATCGTGCAACTGCTACAACTGGAAGAAAGTTTAGGATGGTTGTGATTGAGATGAGAATCTCAAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGGCTATTCCTTCTTCGAAGTCAGCCAATCCAGTGAGACAAGGAGAGATTGGGTGTCTAGTTTATACAAGAAGTTGAAGGTAAGGATGCTGAAGGATGATGAGCT
TGCAGATTCGGAAGGTGAAATGGATTCTAATGTGTTGTATCGTGCAACTGCTACAACTGGAAGAAAGTTTAGGATGGTTGTGATTGAGATGAGAATCTCAAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGYSFFEVSQSSETRRDWVSSLYKKLKVRMLKDDELADSEGEMDSNVLYRATATTGRKFRMVVIEMRISN