; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg14140 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg14140
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionDUF4228 domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr04:3996178..3996834
RNA-Seq ExpressionCarg14140
SyntenyCarg14140
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025322 - Protein of unknown function DUF4228, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038902281.1 uncharacterized protein LOC120088913 [Benincasa hispida]2.0e-10489.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TPJ8 DUF4228 domain-containing protein9.4e-10086.28Show/hide
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A0A5D3D1S5 DUF4228 domain-containing protein9.4e-10086.28Show/hide
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A0A6J1FWN5 uncharacterized protein LOC1114476126.5e-117100Show/hide
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A0A6J1J5E2 uncharacterized protein LOC1114814638.5e-11799.54Show/hide
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A0A6J1JCF7 uncharacterized protein LOC1114832125.5e-10087.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G64700.1 unknown protein3.0e-3445.27Show/hide
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          +  A+ PYRMS DY    L+RS T+VFSR S                   G +WKV L+I+ + L++IL E+G T ELIE+VR VAK G TS+ TS+S
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        S
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AT3G61920.1 unknown protein2.2e-2437.98Show/hide
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               +++     PYRMSF         +T + +  S    GVWKV+LVISP++L EIL E+  T+ L+E+VRTVAKCG              S A S
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        DQ S++++
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AT5G03890.1 unknown protein1.5e-0431.53Show/hide
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        MGNCL   +       IK++  +G ++E   PI+V  I  +F G+ I  SH+     L  D +LL+G+ YYLLP                   EG+  ++
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        R  E    SNS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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