; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg14202 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg14202
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionSuccinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial
Genome locationCarg_Chr04:4329922..4330946
RNA-Seq ExpressionCarg14202
SyntenyCarg14202
Gene Ontology termsGO:0006099 - tricarboxylic acid cycle (biological process)
GO:0022904 - respiratory electron transport chain (biological process)
GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0045273 - respiratory chain complex II (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0051538 - 3 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0051537 - 2 iron, 2 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function)
GO:0008177 - succinate dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR036010 - 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily
IPR025192 - Succinate dehydogenase/fumarate reductase N-terminal
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR012675 - Beta-grasp domain superfamily
IPR009051 - Alpha-helical ferredoxin
IPR006058 - 2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site
IPR004489 - Succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulphur protein
IPR001041 - 2Fe-2S ferredoxin-type iron-sulfur binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600633.1 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.1e-17099.65Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRF VLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN

KAG7031269.1 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.5e-171100Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN

XP_022942066.1 succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Cucurbita moschata]3.4e-16897.92Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAY+KAVPKPAANQ+FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCG+MVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEF+KERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS+DNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN

XP_022982204.1 succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Cucurbita maxima]2.0e-16898.26Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAYNKAVPKPA NQ+FGVLDGHPAAQQHAQEA+EAHT FKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCG+MVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN

XP_023528748.1 succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.9e-16998.26Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAYNKA+PKP ANQ+FG+LDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCG+MVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BY85 Iron-sulfur subunit of complex II1.1e-14081.85Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEED
        ML++WFR+AYNK      + QRFGVL+ HP A+QHA+EAMEAH + KS     NQKEF++YRW+P++PNHKPFL SFF+DLSKCG MVLDALQ IKAE+D
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEED

Query:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE
        SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPID DTSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKSIEPWLKT+R  + GREFRQ+PAER+KLDGLYE
Subjt:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE

Query:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDN
        CILCACCSASCPPYWWNPEEF+GPAALLHA RWISDSRDEF+KERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPS AIH+MKAMHL+ + N
Subjt:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDN

A0A5A7TNF4 Iron-sulfur subunit of complex II1.1e-14081.85Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEED
        ML++WFR+AYNK      + QRFGVL+ HP A+QHA+EAMEAH + KS     NQKEF++YRW+P++PNHKPFL SFF+DLSKCG MVLDALQ IKAE+D
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEED

Query:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE
        SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPID DTSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKSIEPWLKT+R  + GREFRQ+PAER+KLDGLYE
Subjt:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE

Query:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDN
        CILCACCSASCPPYWWNPEEF+GPAALLHA RWISDSRDEF+KERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPS AIH+MKAMHL+ + N
Subjt:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDN

A0A6J1C7J5 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial6.5e-14182.19Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH----TKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDS
        ML++W R+ YNK      A  +FG L+GHPAAQQHA EAMEAH     K KS+QKEF++YRW+PE+PN KPFLQSFF+ LS CG MVLDALQKIKAEEDS
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH----TKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDS

Query:  SLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYEC
        SLSYRRSCREGICGSCAMNIDG NTVACLK ID DTSKPTIITPLPHMFVIKDL VDLTNFY QYKSIEPWLKTKRLP+DGREF+QSP +R+KLDGLYEC
Subjt:  SLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYEC

Query:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
        ILCACC+ SCPPYWWNPEEFLGPAALLHA RWISDSRD+FE+ERLQAIAEDKTKLYRCRTV+NCTANCPKSLDPSGAIH MKAMHL+SK NN
Subjt:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN

A0A6J1FMU7 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial1.6e-16897.92Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAY+KAVPKPAANQ+FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCG+MVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEF+KERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS+DNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN

A0A6J1J3X0 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial9.6e-16998.26Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAYNKAVPKPA NQ+FGVLDGHPAAQQHAQEA+EAHT FKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCG+MVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6H4G3 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 2, mitochondrial1.8e-10060.9Show/hide
Query:  ANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAME---------------------AHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSS
        A+  F  L GHPAA+ +A++A E                     A +   S  KEFRVYRWSP+ P+ +P LQS+ +DL+ CG MVLD LQKIKAE D++
Subjt:  ANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAME---------------------AHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSS

Query:  LSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPK-DGREFRQSPAERRKLDGLYEC
        L++RRSCREGICGSC+M IDG NTVACL+P+DTDTS  T +TPLPHM+V++DL VDLT+FYQQYKS+EPWLK K   K +  E  QSP ER++LDGLYEC
Subjt:  LSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPK-DGREFRQSPAERRKLDGLYEC

Query:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSK
        ILCACCSA+CP YWWN E FLGPAALLHA RW+SDSRDE+  ER+QA+AE   KLYRCR +++CTA CPKSLDP+ AI  MK +H L K
Subjt:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSK

Q8LB02 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 2, mitochondrial9.8e-8666.67Show/hide
Query:  KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDL
        K F++YRW+P++P  KP LQ + IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I++  SK T ITPLPHMFVIKDL
Subjt:  KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDL

Query:  AVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKT
         VD+TNFY QYKSIEPWLK K      G+E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +D+ 
Subjt:  AVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKT

Query:  KLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  KLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

Q8LBZ7 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 1, mitochondrial1.7e-8565.81Show/hide
Query:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F++YRW+P++P  KP LQ++ IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  + S+ T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAE
        KDL VD+TNFY QYKSIEPWLK K       +E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAE

Query:  DKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        D+ KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

Q9FJP9 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial7.7e-11571.75Show/hide
Query:  FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH--TKFKSNQ-----KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMN
        F +L+GH AAQ  +++ +++   TK K  Q     KEF++YRW+P+ PN KPFLQSFF+DLS CG MVLD LQKIKAE+D+SLSYRRSCREGICGSC+MN
Subjt:  FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH--TKFKSNQ-----KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMN

Query:  IDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE
        IDG NTVACLKPI+ +TSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKS+EPWLKT++ PKDGRE RQSP +R+KLDGLYECILCACC+ SCP YWWNPEE
Subjt:  IDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE

Query:  FLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS
        F GPAALL A RWISDSRDE+ +ERLQAI E +TK+YRCR ++NCTA CPK L+P+ AI  MK+ HLLS
Subjt:  FLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS

Q9S827 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 1, mitochondrial8.9e-8763.33Show/hide
Query:  TKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPH
        +K  +N K F +YRW P+ P+ KP L+ + +DLS CG MVLD L KIK E+D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I + +S  T I+PLPH
Subjt:  TKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPH

Query:  MFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRL-PKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQ
        MFVIKDL VD+TNFY QYKS+EPWLK K   P+ G+E  Q+ A+R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPEE+LGPAALLHA RWI DSRD+F KERL 
Subjt:  MFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRL-PKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQ

Query:  AIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHL
        +I  D+ KLYRC T++NCT  CPK L+P+  I  +K + L
Subjt:  AIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27380.1 succinate dehydrogenase 2-11.2e-8665.81Show/hide
Query:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F++YRW+P++P  KP LQ++ IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  + S+ T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAE
        KDL VD+TNFY QYKSIEPWLK K       +E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAE

Query:  DKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        D+ KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

AT3G27380.2 succinate dehydrogenase 2-11.2e-8665.81Show/hide
Query:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F++YRW+P++P  KP LQ++ IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  + S+ T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAE
        KDL VD+TNFY QYKSIEPWLK K       +E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAE

Query:  DKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        D+ KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

AT5G40650.1 succinate dehydrogenase 2-27.0e-8766.67Show/hide
Query:  KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDL
        K F++YRW+P++P  KP LQ + IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I++  SK T ITPLPHMFVIKDL
Subjt:  KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDL

Query:  AVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKT
         VD+TNFY QYKSIEPWLK K      G+E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +D+ 
Subjt:  AVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKT

Query:  KLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  KLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

AT5G65165.1 succinate dehydrogenase 2-35.5e-11671.75Show/hide
Query:  FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH--TKFKSNQ-----KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMN
        F +L+GH AAQ  +++ +++   TK K  Q     KEF++YRW+P+ PN KPFLQSFF+DLS CG MVLD LQKIKAE+D+SLSYRRSCREGICGSC+MN
Subjt:  FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH--TKFKSNQ-----KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMN

Query:  IDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE
        IDG NTVACLKPI+ +TSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKS+EPWLKT++ PKDGRE RQSP +R+KLDGLYECILCACC+ SCP YWWNPEE
Subjt:  IDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE

Query:  FLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS
        F GPAALL A RWISDSRDE+ +ERLQAI E +TK+YRCR ++NCTA CPK L+P+ AI  MK+ HLLS
Subjt:  FLGPAALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTACGAACCTGGTTCCGCAATGCCTACAACAAGGCCGTCCCTAAGCCGGCGGCAAACCAGAGGTTTGGAGTACTGGACGGCCATCCTGCGGCTCAGCAACATGCACA
AGAAGCCATGGAAGCCCATACCAAATTTAAATCCAATCAAAAGGAGTTCAGAGTGTATCGGTGGAGTCCTGAGCACCCCAACCACAAGCCTTTCCTTCAGTCTTTCTTCA
TCGATCTCTCTAAATGTGGCGCAATGGTATTGGATGCGTTACAGAAGATAAAAGCAGAGGAAGACTCGAGCTTGAGCTACAGAAGGTCTTGTAGGGAAGGTATATGCGGA
TCATGTGCTATGAACATCGATGGAGCCAACACTGTGGCTTGCCTCAAACCTATTGATACTGACACTTCCAAACCCACCATTATAACGCCCCTTCCCCATATGTTTGTCAT
CAAGGATCTTGCTGTTGATCTCACCAATTTCTATCAGCAATACAAGTCGATCGAGCCATGGTTGAAGACCAAAAGGTTGCCCAAGGATGGGCGAGAGTTCAGGCAATCAC
CAGCGGAGAGAAGGAAGCTGGATGGGTTGTATGAGTGTATTCTGTGCGCTTGTTGCAGTGCTTCATGCCCTCCATATTGGTGGAATCCAGAGGAGTTTCTTGGCCCTGCT
GCCTTGCTCCATGCCTGTCGATGGATCTCTGATAGTCGAGACGAGTTCGAGAAGGAACGATTGCAAGCAATAGCTGAAGACAAGACGAAGCTGTATAGATGTAGAACTGT
ACAGAATTGCACAGCCAACTGCCCCAAAAGCCTTGATCCTTCCGGTGCCATTCACCACATGAAGGCTATGCATTTGCTCTCAAAGGACAACAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTACGAACCTGGTTCCGCAATGCCTACAACAAGGCCGTCCCTAAGCCGGCGGCAAACCAGAGGTTTGGAGTACTGGACGGCCATCCTGCGGCTCAGCAACATGCACA
AGAAGCCATGGAAGCCCATACCAAATTTAAATCCAATCAAAAGGAGTTCAGAGTGTATCGGTGGAGTCCTGAGCACCCCAACCACAAGCCTTTCCTTCAGTCTTTCTTCA
TCGATCTCTCTAAATGTGGCGCAATGGTATTGGATGCGTTACAGAAGATAAAAGCAGAGGAAGACTCGAGCTTGAGCTACAGAAGGTCTTGTAGGGAAGGTATATGCGGA
TCATGTGCTATGAACATCGATGGAGCCAACACTGTGGCTTGCCTCAAACCTATTGATACTGACACTTCCAAACCCACCATTATAACGCCCCTTCCCCATATGTTTGTCAT
CAAGGATCTTGCTGTTGATCTCACCAATTTCTATCAGCAATACAAGTCGATCGAGCCATGGTTGAAGACCAAAAGGTTGCCCAAGGATGGGCGAGAGTTCAGGCAATCAC
CAGCGGAGAGAAGGAAGCTGGATGGGTTGTATGAGTGTATTCTGTGCGCTTGTTGCAGTGCTTCATGCCCTCCATATTGGTGGAATCCAGAGGAGTTTCTTGGCCCTGCT
GCCTTGCTCCATGCCTGTCGATGGATCTCTGATAGTCGAGACGAGTTCGAGAAGGAACGATTGCAAGCAATAGCTGAAGACAAGACGAAGCTGTATAGATGTAGAACTGT
ACAGAATTGCACAGCCAACTGCCCCAAAAGCCTTGATCCTTCCGGTGCCATTCACCACATGAAGGCTATGCATTTGCTCTCAAAGGACAACAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLRTWFRNAYNKAVPKPAANQRFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGAMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICG
SCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPA
ALLHACRWISDSRDEFEKERLQAIAEDKTKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSKDNN