CuGenDBv2

Gene ID	Carg14553
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	AWPM-19-like family protein
Genome location	Carg_Chr18:2644830..2647348
RNA-Seq Expression	Carg14553
Synteny	Carg14553
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008390 - AWPM-19-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]

1.3e-68

87.42

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MA++QMKSIAT+LLLLNFCMYVIILGIGGWAMN+AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFV FALLA VFGAAS ISGLNHIRSWS ES GAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        SSAAVFAWTLT+LAMGFA KEI LD RN+RLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHG ++T+
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

XP_022955000.1 uncharacterized protein LOC111457088 [Cucurbita moschata]

1.8e-78

100

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

XP_022994911.1 uncharacterized protein LOC111490495 [Cucurbita maxima]

4.9e-76

96.86

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MANSQMK IAT+LLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAAS ISGLNHIRSWSAESFGAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFF+ILSATQLVYIMAIHGAVTT+
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

XP_023542194.1 membrane protein PM19L-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.9e-76

97.48

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAAS ISGLNHIRSWSAESFGAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIM IHGAVT +
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]

4.4e-69

88.05

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MA++QMKS+AT+LLLLNFCMY IILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFVIFALLAAVFGAAS ISGLNHIRSWSAES GAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        S+AAVFAWTLT+LAMGFA KEI LD RN+RLVTMEAFFIILSATQLVYI+AIHGAV+T+
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LV01 AWPM19-like protein

2.2e-69

86.79

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MA++QMKS AT+LLLLNFCMYVIILGIGGWAMN+AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFV+FALLA VFGAAS ISGLNHIRSWS ES  AA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        SSAAVFAWTLT+LAMGFAWKEI LD RN+RLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHG ++T+
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC111010860

1.9e-65

84.52

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MAN+QMKSIAT+LLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGP  +LPAHFSPIYFP+GNAATGFFV FALLAAVFGAAS ISGLNHIRSWS +S GAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGA
        SSAAVFAWTLT+LAMGFA KEI+LD R++RL+TMEAFFIILS TQL+YIMAIHGA
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGA

A0A6J1GTY5 uncharacterized protein LOC111457088

8.7e-79

100

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

A0A6J1K0L0 uncharacterized protein LOC111490495

2.4e-76

96.86

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MANSQMK IAT+LLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAAS ISGLNHIRSWSAESFGAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFF+ILSATQLVYIMAIHGAVTT+
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

A5Y734 AWPM19-like protein

6.3e-69

87.42

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MA++QMKSIAT+LLLLNFCMYVIILGIGGWAMN+AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFV FALLA VFGAAS ISGLNHIRSWS ES GAA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK
        SSAAVFAWTLT+LAMGFA KEI LD RN+RLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHG ++T+
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q6L4D2 Membrane protein PM19L

2.7e-21

41.06

Show/hide

Query:  KSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAASSAAVF
        +++   LL+LN  MY+I++G   W +N  I +G    PG+             GN AT +F++FA+LA V GAAS ++G++H+RSW A S  A +++A+ 
Subjt:  KSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAASSAAVF

Query:  AWTLTLLAMGFAWKEIQL-DLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV
        AW +T LA G A KEI +   R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+  +HG +
Subjt:  AWTLTLLAMGFAWKEIQL-DLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein

1.8e-23

42.86

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MA +  ++IA  LL LN  MY+I+LG   W +N+ I+       G      F       GN AT FF+ F++LAAV G AS ++G NHIR W  +S  AA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQL-DLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIH-GAVTTK
         ++++ AW +T LAMG A K+I +   R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+M IH G++++K
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQL-DLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIH-GAVTTK

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein

1.2e-59

74.68

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MA  Q+K +A+ LL+LNFCMYVI+LGIGGWAMNRAIDHGF +GP L+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFVIFALLA V GAAS ISGL+HIRSW+  S  AA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHG
        ++AA  AWTLT+LAMGFAWKEI+L  RN++L TMEAF IILS TQL+YI A+HG
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHG

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein

4.1e-28

44.23

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        MA+   KS A +LL+LN  +Y +I  I  WA+N  I+        L LPA   PIYFP+GN ATGFFVIF L+A V G A+ ++G+ ++  W + +  +A
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV
        +++++ +W+LTLLAMG A KEI +    + L T+E   II+SATQL+   AIH  V
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein

1.8e-52

66.88

Show/hide

Query:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA
        M   QMK +A+ LL+LNFCMY I+LGIG W+MN+AI+HGF+IG    LPAHFSPI+FP+GNAATGFF++FAL+A V GAAS ISG++H++SW+  S  AA
Subjt:  MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAA

Query:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHG
         SAA  AW+LTLLAMGF  KEI+L +RN+RL TMEAF IILSATQL+YI AI+G
Subjt:  SSAAVFAWTLTLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTAATTCACAGATGAAATCCATTGCTACTGTGCTTCTGTTGCTTAACTTTTGCATGTATGTTATTATTTTGGGCATTGGAGGGTGGGCCATGAACAGAGCAATTGA
TCATGGCTTCATCATTGGTCCTGGGCTTAAACTTCCAGCACATTTTTCACCAATTTACTTCCCCATAGGGAATGCAGCCACCGGTTTCTTTGTGATATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCAGGAATCTCAGGACTTAACCATATTCGGTCATGGAGTGCTGAAAGCTTCGGTGCTGCATCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACTCTCCTTGCCATGGGCTTTGCTTGGAAAGAGATTCAACTTGATCTCAGAAACTCAAGACTGGTAACAATGGAAGCCTTCTTCATTATTCTCTCAGCTACACAGCTTGT
TTACATTATGGCCATCCATGGTGCTGTGACCACAAAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CTGAACCTTCCTTCTCATCCCCATTTATAAACCCATCTCTGCCTCCTTACTTCCACATTACATTACAAGTTTTGGGTCTTTTTGTTCTGTTTTTCCTCTTTCACTCAGCA
TTTTTCTTTCTGATTTCACTGCTCAAATGGCTAATTCACAGATGAAATCCATTGCTACTGTGCTTCTGTTGCTTAACTTTTGCATGTATGTTATTATTTTGGGCATTGGA
GGGTGGGCCATGAACAGAGCAATTGATCATGGCTTCATCATTGGTCCTGGGCTTAAACTTCCAGCACATTTTTCACCAATTTACTTCCCCATAGGGAATGCAGCCACCGG
TTTCTTTGTGATATTTGCTTTGTTGGCTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCAGGAATCTCAGGACTTAACCATATTCGGTCATGGAGTGCTGAAAGCTTCGGTGCTGCATCCT
CTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTCACTCTCCTTGCCATGGGCTTTGCTTGGAAAGAGATTCAACTTGATCTCAGAAACTCAAGACTGGTAACAATGGAAGCCTTCTTC
ATTATTCTCTCAGCTACACAGCTTGTTTACATTATGGCCATCCATGGTGCTGTGACCACAAAATGAGAGCTGAATGCTTTAACATTTGTATGATTCATTGCCCATTTTCA
ATTGTCTTTGGTGTTGTTTTCTTTTGTTGTAATTAACCATCTCTGCAAACCTTGCAAACGTGCAAGGAGCTTAGTTTAGAAGATTATTCTTTTTGTGGTCTGTTGTGGTG
ATTTTATTTGTATAAATGTTGACAATAAACTTGGTTTGATGTTTGATTTAAAGCTTCAGTCTCCCTCTCTCAAACTTTTCGTTTGTAGGATGGATAATTCAAAGAACACT
AGAAACCGATCAAAGGTTATGATAATCTAACAACATTTTCGGTGAAAATAGATTCTACCATCAAATGCCAACTTGAACATCGCTCTACTAGTTAAGACATAGCCTAAAAC
TAAAGGTTAAGGATTCAGATTTCGACCACCTAAAATGAAAGGTGTAATGTGGATATTCTTAAGGAGAATACAAAGCAGAATCAATTATTATCTTTATGAGGAAGAAGCTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MANSQMKSIATVLLLLNFCMYVIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLKLPAHFSPIYFPIGNAATGFFVIFALLAAVFGAASGISGLNHIRSWSAESFGAASSAAVFAWTL
TLLAMGFAWKEIQLDLRNSRLVTMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVTTK

Carg14553 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome