; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg14569 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg14569
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionDUF1685 domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr18:2499573..2500226
RNA-Seq ExpressionCarg14569
SyntenyCarg14569
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012881 - Protein of unknown function DUF1685


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573322.1 hypothetical protein SDJN03_27209, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-11297.27Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPP---EEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPE
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPP   EEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPE
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPP---EEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPE

Query:  NSQRGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGN
        NSQRGNE RPETELRMKWSES+SLSELEFEELKGFMDMGFVFT EDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGN
Subjt:  NSQRGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGN

Query:  ETDMKDNLKWWAHAVASTVR
        ETDMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  ETDMKDNLKWWAHAVASTVR

KAG7012491.1 hypothetical protein SDJN02_25243, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.7e-117100Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ

Query:  RGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNETD
        RGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNETD
Subjt:  RGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNETD

Query:  MKDNLKWWAHAVASTVR
        MKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  MKDNLKWWAHAVASTVR

XP_022954447.1 uncharacterized protein LOC111456711 [Cucurbita moschata]3.0e-11699.08Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ

Query:  RGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNETD
        RGNERRPETELRMKWSES+SLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELR PLMKKWRFPGNETD
Subjt:  RGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNETD

Query:  MKDNLKWWAHAVASTVR
        MKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  MKDNLKWWAHAVASTVR

XP_023542166.1 uncharacterized protein LOC111802131 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.4e-11195.43Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNP--PPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPEN
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLK P  PPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYL SKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPEN
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNP--PPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPEN

Query:  SQRGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNE
        SQRGNERR +TELRM+WSES+SLSELEFEELKGFMDMGFVF EEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNE
Subjt:  SQRGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNE

Query:  TDMKDNLKWWAHAVASTVR
        TDMKDNLKWWAHAVAS VR
Subjt:  TDMKDNLKWWAHAVASTVR

XP_038895996.1 uncharacterized protein LOC120084174 [Benincasa hispida]3.2e-7066.94Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPF-VRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGN
        MD EQLLNLF+S WFE EIFN HPF SNPQNPQPEN   + P      +EPF V ++RTRSISE L+SKLSFMSNSNSP+SVLFSPKLQT      +AG 
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPF-VRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGN

Query:  ESPENSQR-GNERRPETE-------LRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRK--------EGEEEMGGEILRPYLSE
        ESPENS++ G ERRP+TE        RM+ SESRSLSELEFEELKGFMD+GFVF+EEDK SSLA IVP LNR  K        E E ++GGEI RPYLSE
Subjt:  ESPENSQR-GNERRPETE-------LRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRK--------EGEEEMGGEILRPYLSE

Query:  AWEAM-----ELRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
        AWEAM     EL+ PL  KW+FP N+ DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  AWEAM-----ELRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV26 Uncharacterized protein6.3e-6460.39Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGNE
        MD + LLNLF+S WF+R++ NNHPF SNPQ  QP+    +P P    +E   + ++RTRSISE L+SKLSFMSNSNSP+SVL SPKLQT      +AG E
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGNE

Query:  SPENSQRGN-ERRPETELRMKW-------SESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR-------GRKEGEEE---------MGGEI
        SPE S +   ERRP+TE R +        SESRSLSELEFEELKGFMD+GFVF+EEDK SSLA IVP LNR       G KEGEEE         +GGEI
Subjt:  SPENSQRGN-ERRPETELRMKW-------SESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR-------GRKEGEEE---------MGGEI

Query:  LRPYLSEAWEAME--------LRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
         RPYLSEAWEA+         L++PLM KWRFP N+ DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  LRPYLSEAWEAME--------LRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

A0A5A7UPL7 DUF1685 domain-containing protein2.0e-6260.87Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGNE
        MD EQLLNLF+S WFER +FN HPF SN Q PQ ++P   P      +E   + ++ TRSISE L+SKLSFMS+SNSP+SVLFSPKLQT      +AG E
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGNE

Query:  SPENSQRGN-ERRPETELRMKW-------SESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR-GRKEGEE-------------EMGGEILR
        SPE S++   ERRP+TE R ++       SESRSLSELEFEELKGFMD+GFVF+EEDK SSLA IVP LNR G+KE +E             ++GGEI R
Subjt:  SPENSQRGN-ERRPETELRMKW-------SESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR-GRKEGEE-------------EMGGEILR

Query:  PYLSEAWEAME--------LRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
        PYLSEAWEAME         +KPLM KWRFP N+ DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  PYLSEAWEAME--------LRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

A0A6J1EH41 uncharacterized protein LOC1114340585.5e-6864.85Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPEN----PLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------M
        MD+EQ+L+LF+S+WFEREIFN HPF +NPQNP+PEN    PLKN PP     EEPFV +I  RSISE L+SKL+FMS+S+SP+SVLFSPKLQT      +
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPEN----PLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------M

Query:  AGNESPENSQRGNERRPETELR------MKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR--GRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAM
        AG E PE S+R   R+   + R      ++ SESRSLSELEFEE+KGFMD+GFVF+E DK SSLAWIVP LNR   R E EEE+GG I RPYLSEAW AM
Subjt:  AGNESPENSQRGNERRPETELR------MKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR--GRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAM

Query:  ----ELRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
            EL+K L+ KWR P NE DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  ----ELRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

A0A6J1GR10 uncharacterized protein LOC1114567111.4e-11699.08Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ

Query:  RGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNETD
        RGNERRPETELRMKWSES+SLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELR PLMKKWRFPGNETD
Subjt:  RGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNETD

Query:  MKDNLKWWAHAVASTVR
        MKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  MKDNLKWWAHAVASTVR

A0A6J1KR35 uncharacterized protein LOC1114957103.6e-6763.01Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPEN----PLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------M
        MD+EQ+LNLF+S WFEREIFN HPF +NPQNP+PEN    PLKN PP     EEPFV +I  RSISE L+SKL+FMS+S+SP+SVLFSPKLQT      +
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPEN----PLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------M

Query:  AGNESPENSQRGNERRPETELR------MKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR---------GRKEGEEEMGGEILRPYL
        AG E PE S+R   R+   + R      ++ SESRSLSELEFEELKGFMD+GFVF+E DK SSLAWIVP LNR           +E EEE+GG I RPYL
Subjt:  AGNESPENSQRGNERRPETELR------MKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR---------GRKEGEEEMGGEILRPYL

Query:  SEAWEAM----ELRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
        SEAW AM    E++K L+ KWR P NE DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  SEAWEAM----ELRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42760.1 unknown protein1.5e-2035.85Show/hide
Query:  EQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQP--ENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISE----YLASKLSFMSNSN-----SPNSVL----FSPKLQ
        E+LL LF   W ER IF     + N ++ +   E  +      EE  +   V  +  R++S+      +SK S  S+S+     SP SVL       KLQ
Subjt:  EQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQP--ENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISE----YLASKLSFMSNSN-----SPNSVL----FSPKLQ

Query:  T-MAGNE------------SPENSQRGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEED-KDSSLAWIVPALNR--------GRKEGEEEM
        T ++G E              E  ++  +++ ++ +R +  + +S+S+LE+EELKGFMD+GFVF+E+D KDS L  I+P L R         ++E EEE 
Subjt:  T-MAGNE------------SPENSQRGNERRPETELRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEED-KDSSLAWIVPALNR--------GRKEGEEEM

Query:  -----GGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMK-----KWRFP----GNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
             G    RPYLSEAW+    RK   +     KWR P     +E D+KDNL+ WAHAVAST+R
Subjt:  -----GGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMK-----KWRFP----GNETDMKDNLKWWAHAVASTVR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTTGAGCAACTTCTAAATCTCTTCAATTCCGTCTGGTTTGAGCGTGAAATTTTCAACAACCACCCCTTTTCATCTAACCCCCAAAACCCACAACCAGAAAATCC
CTTAAAAAACCCGCCGCCGCCGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCCTTTCGTCCGACAGATTCGAACGAGGTCAATAAGCGAATACTTAGCCTCCAAATTGAGCTTTATGTCCA
ATTCCAACTCACCCAATTCAGTTCTGTTTTCGCCAAAACTTCAAACGATGGCCGGAAACGAGTCGCCGGAGAACAGCCAGAGAGGAAATGAACGGCGGCCGGAAACAGAG
TTGAGAATGAAATGGTCGGAAAGTAGGAGCTTGTCGGAGCTGGAATTCGAGGAGCTAAAAGGGTTTATGGATATGGGATTTGTTTTCACGGAGGAGGATAAAGATTCTAG
CTTGGCGTGGATTGTTCCGGCATTGAACAGAGGCCGGAAGGAAGGAGAAGAAGAGATGGGTGGGGAAATTTTGAGGCCTTATCTTTCGGAAGCTTGGGAAGCTATGGAGT
TGAGGAAGCCATTGATGAAGAAATGGAGGTTTCCTGGTAATGAGACTGATATGAAGGATAATCTCAAATGGTGGGCTCATGCTGTGGCTTCTACCGTTAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCTTGAGCAACTTCTAAATCTCTTCAATTCCGTCTGGTTTGAGCGTGAAATTTTCAACAACCACCCCTTTTCATCTAACCCCCAAAACCCACAACCAGAAAATCC
CTTAAAAAACCCGCCGCCGCCGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCCTTTCGTCCGACAGATTCGAACGAGGTCAATAAGCGAATACTTAGCCTCCAAATTGAGCTTTATGTCCA
ATTCCAACTCACCCAATTCAGTTCTGTTTTCGCCAAAACTTCAAACGATGGCCGGAAACGAGTCGCCGGAGAACAGCCAGAGAGGAAATGAACGGCGGCCGGAAACAGAG
TTGAGAATGAAATGGTCGGAAAGTAGGAGCTTGTCGGAGCTGGAATTCGAGGAGCTAAAAGGGTTTATGGATATGGGATTTGTTTTCACGGAGGAGGATAAAGATTCTAG
CTTGGCGTGGATTGTTCCGGCATTGAACAGAGGCCGGAAGGAAGGAGAAGAAGAGATGGGTGGGGAAATTTTGAGGCCTTATCTTTCGGAAGCTTGGGAAGCTATGGAGT
TGAGGAAGCCATTGATGAAGAAATGGAGGTTTCCTGGTAATGAGACTGATATGAAGGATAATCTCAAATGGTGGGCTCATGCTGTGGCTTCTACCGTTAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQRGNERRPETE
LRMKWSESRSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRKPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR