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++ RRS S S SSSRSRS S S S S S S S S S S + SRS SSSSS S S+SS S SP P R+ + RR+R+ KR ++ SP
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Query: LVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASKRDG
+HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L A P R + +R
Subjt: LVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASKRDG
Query: PKPENVGADAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: PKPENVGADAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q5XG24 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-A | 7.3e-18 | 42.15 | Show/hide |
Query: SRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSPVRES
++ RRS S S SSS SRS S S S S S S S S S S + SRS SSSSS S S+SS S SP P R+ + RR+R+ KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSPVRES
Query: LVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTL---PQR--QKMASPPRTAAAA
+HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P R + SPPR
Subjt: LVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTL---PQR--QKMASPPRTAAAA
Query: SKRDGPKPENVGADAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
R P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: SKRDGPKPENVGADAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q9SEE9 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 2.8e-110 | 70.1 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSP
MAKPSRGRRS PS SGSSSRS S S S S S SRS SRSR S SRS+SSSSSPSRS SS SRSPP + KS ARR R+ PPP + + P K +
Subjt: MAKPSRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSP
Query: VRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASK
V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK++SPP+ +AA K
Subjt: VRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASK
Query: RDGPKPENVGADAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLGRRHRSPPRP
RD PK +N ADAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR D+PPRRRPASP RG SP RR+RSPPR
Subjt: RDGPKPENVGADAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLGRRHRSPPRP
Query: SPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPGRSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVARRV--SRSPRRPLR
SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRPGRSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++ R++ SRSP+RPLR
Subjt: SPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPGRSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVARRV--SRSPRRPLR
Query: G-RSSSRSSSSSSPPRKP
G RSSS SSSSSSPP P
Subjt: G-RSSSRSSSSSSPPRKP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16610.1 arginine/serine-rich 45 | 2.0e-111 | 70.1 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSP
MAKPSRGRRS PS SGSSSRS S S S S S SRS SRSR S SRS+SSSSSPSRS SS SRSPP + KS ARR R+ PPP + + P K +
Subjt: MAKPSRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSP
Query: VRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASK
V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK++SPP+ +AA K
Subjt: VRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASK
Query: RDGPKPENVGADAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLGRRHRSPPRP
RD PK +N ADAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR D+PPRRRPASP RG SP RR+RSPPR
Subjt: RDGPKPENVGADAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLGRRHRSPPRP
Query: SPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPGRSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVARRV--SRSPRRPLR
SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRPGRSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++ R++ SRSP+RPLR
Subjt: SPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPGRSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVARRV--SRSPRRPLR
Query: G-RSSSRSSSSSSPPRKP
G RSSS SSSSSSPP P
Subjt: G-RSSSRSSSSSSPPRKP
|
|
| AT1G16610.2 arginine/serine-rich 45 | 1.9e-109 | 69.47 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSP
MAKPSRGRRS PS SGSSSRS S S S S S SRS SRSR S SRS+SSSSSPSRS SS SRSPP + KS ARR R+ PPP + + P K +
Subjt: MAKPSRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSP
Query: VRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASK
V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK++SPP+ +AA K
Subjt: VRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASK
Query: RDGPKPENVGADAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLGRRHRSPPRPSP
RD PK +N ADAEKD R+ PR + SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR D+PPRRRPASP RG SP RR+RSPPR SP
Subjt: RDGPKPENVGADAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLGRRHRSPPRPSP
Query: RRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPGRSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-
RRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRPGRSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++ R++ SRSP+RPLRG
Subjt: RRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPGRSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-
Query: RSSSRSSSSSSPPRKP
RSSS SSSSSSPP P
Subjt: RSSSRSSSSSSPPRKP
|
|
| AT1G16610.3 arginine/serine-rich 45 | 3.2e-109 | 68.22 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSP
MAKPSRGRRS PS SGSSSRS S S S S S SRS SRSR S SRS+SSSSSPSRS SS SRSPP + KS ARR R+ PPP + + P K +
Subjt: MAKPSRGRRSPPSRSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSHSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSSTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSP
Query: VRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASK
V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK++SPP+ +AA K
Subjt: VRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMASPPRTAAAASK
Query: RDGPKPENVGADAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLGRRHRSPPRP
RD PK +N ADAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR D+PPRRRPASP RG SP RR+RSPPR
Subjt: RDGPKPENVGADAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLGRRHRSPPRP
Query: SPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPGRSRSRSFSPRR----------GRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVARRV-
SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRPGRSRS S SPR+ G G AGRRGRSSSYS+SPSPR++ R++
Subjt: SPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPGRSRSRSFSPRR----------GRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVARRV-
Query: -SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: -SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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