; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15084 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15084
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiondihydrofolate synthetase isoform X1
Genome locationCarg_Chr16:425754..426785
RNA-Seq ExpressionCarg15084
SyntenyCarg15084
Gene Ontology termsGO:0006761 - dihydrofolate biosynthetic process (biological process)
GO:0009793 - embryo development ending in seed dormancy (biological process)
GO:0046901 - tetrahydrofolylpolyglutamate biosynthetic process (biological process)
GO:0005759 - mitochondrial matrix (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0004326 - tetrahydrofolylpolyglutamate synthase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0008841 - dihydrofolate synthase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001645 - Folylpolyglutamate synthetase
IPR018109 - Folylpolyglutamate synthetase, conserved site
IPR036565 - Mur-like, catalytic domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576673.1 Dihydrofolate synthetase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.4e-100100Show/hide
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KAG7014724.1 Dihydrofolate synthetase [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-106100Show/hide
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XP_022922898.1 dihydrofolate synthetase isoform X1 [Cucurbita moschata]6.5e-9998.91Show/hide
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XP_022922899.1 dihydrofolate synthetase isoform X2 [Cucurbita moschata]6.5e-9998.91Show/hide
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XP_022922900.1 dihydrofolate synthetase isoform X3 [Cucurbita moschata]6.5e-9998.91Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1E4S6 dihydrofolate synthetase isoform X23.1e-9998.91Show/hide
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A0A6J1E5E1 dihydrofolate synthetase isoform X43.1e-9998.91Show/hide
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A0A6J1E819 dihydrofolate synthetase isoform X13.1e-9998.91Show/hide
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A0A6J1EA44 dihydrofolate synthetase isoform X33.1e-9998.91Show/hide
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A0A6J1J6Z7 dihydrofolate synthetase isoform X11.1e-9697.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JYE9 Dihydrofolate synthetase4.6e-4765.25Show/hide
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           +GE VS   LN LF   K +L+QS++ ENG +SHFE+L
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P15925 Folylpolyglutamate synthase1.7e-0937.89Show/hide
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        TE + Y+ S     K G             D  R+  L+  LGNPQ + + IH+ GT GKGS A  ++++L A G +VG YTSP I    ERI +
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Q05865 Dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase7.6e-1844.23Show/hide
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        LGRMK+LM RLG+P+ K +A H+AGT GKGST AF+ ++L+  GY+VG +TSP+I T  ERIS+  +G  +S +    L  + K  ++   + E G+ + 
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        FE++
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Q12676 Dihydrofolate synthetase3.1e-1142.19Show/hide
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        L R+ +L+E LGNPQ+  + +HIAGT GKGS   +LS++L+ + Y +G +T+PH+  + + I++
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Q54CY5 Putative folylpolyglutamate synthase4.5e-1037.5Show/hide
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        E    F +  M+   + L     +   IH+AGTKGKGST A   +I+R +G+S G +TSPH+ + RERI +  +GEM+S +  +  F    +LL  D   
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Query:  KLEN
        +L N
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G55630.1 DHFS-FPGS homolog D3.5e-1037.5Show/hide
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        S+ K IH+AGTKGKGST  F  +ILR  G   G +TSPH+  +RER  L    E+   K +N+    F + KE     V +        GR     V+ +
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Query:  AVCC
         V C
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AT3G55630.2 DHFS-FPGS homolog D2.3e-0941.98Show/hide
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        S+ K IH+AGTKGKGST  F  +ILR  G   G +TSPH+  +RER  L    E+   K +N+    F + KE     V +
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AT3G55630.3 DHFS-FPGS homolog D2.3e-0941.98Show/hide
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        S+ K IH+AGTKGKGST  F  +ILR  G   G +TSPH+  +RER  L    E+   K +N+    F + KE     V +
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AT5G05980.2 DHFS-FPGS homolog B3.0e-0937.23Show/hide
Query:  EFMEYLDSLKNYEKLGVPTGAGTESEDGFDLGRMKRLMERLGNPQSKFKAIHIAGTKGKGSTAAFLSNILRAEGYSVGCYTSPHIETIRERISL
        E +  L SL         +  G   E  FD  ++  L E +     K   IH+AGTKGKGST  F  +I+R  G+  G +TSPH+  +RER  L
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AT5G41480.1 Folylpolyglutamate synthetase family protein3.3e-4865.25Show/hide
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        +ED ++ +F+ +L+SLKNYEK GVP GAGT+S+DGFDLGRMKRLM RL NP  K+K +H+AGTKGKGST+AFLSNILRA GYSVGCY+SPHI +I+ERIS
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Query:  LGRSGEMVSGKALNFLFKRNKELLDQSVKLENGRISHFEVL
           +GE VS   LN LF   K +L+QS++ ENG +SHFE+L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATCTCTTCAAATATCATCATCACTTCCGCCCGCAGATTCACGGAAGGCTTCTCCTAAATTATTTCGTTGGTGAAGGGCCTTCTATCAGTAGCCGAATTGGGTCCAA
ACAATGCTTCGGCAATCACTCAGAAGATCAAGACATGACGGAATTCATGGAATACTTGGATTCCCTGAAGAACTACGAGAAGTTGGGTGTGCCCACAGGCGCAGGGACGG
AGTCTGAGGATGGGTTCGATCTCGGAAGGATGAAAAGACTGATGGAGCGCCTGGGTAATCCACAATCCAAGTTTAAGGCAATTCACATTGCGGGAACCAAGGGAAAAGGG
TCGACTGCGGCCTTCCTGTCTAACATTTTACGAGCAGAGGGATACTCTGTTGGTTGTTATACTAGTCCTCATATTGAAACTATAAGGGAACGTATTTCACTTGGTAGATC
TGGAGAGATGGTCTCTGGAAAGGCACTAAATTTTCTTTTCAAAAGGAACAAAGAGTTACTTGACCAATCGGTAAAACTTGAAAATGGACGTATAAGCCACTTCGAGGTAT
TATATCGTGCAGTCTGTTGTTGTGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGGAGGATTGTCGCAAGTCCAAGTGTTCCAACAGTTCTCGCTCAATCAGCTATTCTTCAAGCTTGCAAGTCGCATTTCCTACCATTTTTTTTCTCAAGAAAGAATGCCC
ATTTCACAATGAATCTCTTCAAATATCATCATCACTTCCGCCCGCAGATTCACGGAAGGCTTCTCCTAAATTATTTCGTTGGTGAAGGGCCTTCTATCAGTAGCCGAATT
GGGTCCAAACAATGCTTCGGCAATCACTCAGAAGATCAAGACATGACGGAATTCATGGAATACTTGGATTCCCTGAAGAACTACGAGAAGTTGGGTGTGCCCACAGGCGC
AGGGACGGAGTCTGAGGATGGGTTCGATCTCGGAAGGATGAAAAGACTGATGGAGCGCCTGGGTAATCCACAATCCAAGTTTAAGGCAATTCACATTGCGGGAACCAAGG
GAAAAGGGTCGACTGCGGCCTTCCTGTCTAACATTTTACGAGCAGAGGGATACTCTGTTGGTTGTTATACTAGTCCTCATATTGAAACTATAAGGGAACGTATTTCACTT
GGTAGATCTGGAGAGATGGTCTCTGGAAAGGCACTAAATTTTCTTTTCAAAAGGAACAAAGAGTTACTTGACCAATCGGTAAAACTTGAAAATGGACGTATAAGCCACTT
CGAGGTATTATATCGTGCAGTCTGTTGTTGTGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNLFKYHHHFRPQIHGRLLLNYFVGEGPSISSRIGSKQCFGNHSEDQDMTEFMEYLDSLKNYEKLGVPTGAGTESEDGFDLGRMKRLMERLGNPQSKFKAIHIAGTKGKG
STAAFLSNILRAEGYSVGCYTSPHIETIRERISLGRSGEMVSGKALNFLFKRNKELLDQSVKLENGRISHFEVLYRAVCCCD