; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15106 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15106
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein REVEILLE 6-like isoform X1
Genome locationCarg_Chr16:544302..547266
RNA-Seq ExpressionCarg15106
SyntenyCarg15106
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR006447 - Myb domain, plants
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576695.1 Protein REVEILLE 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-14093.19Show/hide
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XP_023552288.1 protein REVEILLE 6-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.0e-14092.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
C0SVG5 Protein REVEILLE 52.3e-6349.82Show/hide
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        PPPRPKRKA+ PYP K   N +A  S P  S+   LEP Y+   DS S     +  A  S+   + S +    VIE             NN C   D T 
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        R R  TK + EE  +   RV+P+F +VY+FIGSVFDP  S HLQ+LKQMD I++ETV+LLM+NL++NLT P+F + ++++SSY A
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Q6R0G4 Protein REVEILLE 41.1e-5446.91Show/hide
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              LPDF +VYNFIGSVFDP +   ++KLK+MD I+ ETV+LLMRNL +NL+ PDFE   + + + +   EH
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Q6R0H0 Protein REVEILLE 32.8e-6149.26Show/hide
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        PKRKA  PYPQK     L+  +  FQ   L        +++S P          +V+   S    VI+       NCC  SS+    R R  T+++ +E 
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             RV P+F +VYNFIGSVFDPK + H+++LK+MD I++ETV+LLM+NL++NLT P+F++ +K++SSY+A
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Q8H0W3 Protein REVEILLE 65.1e-7958.7Show/hide
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        +S  +DL K+ RKPYTITK RESWTEPEHDKFLEA+Q                   LFDRDWKKIEAF+GSKTVIQIRSHAQKYFLKV+KSGTGEHLPPP
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        RPKRKAA PYPQK   N    V G F+S+S   +P+++ +P+SSS    +P +  A    N+ Q ++F+   + G    NNC SS++ T R R  +    
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Query:  EEHNKL--QLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYD
         +H  +   LRVLPDF QVY FIGSVFDP AS+HLQKLK+MD IDVETV+LLMRNL+INL+ PDFEDH+++LSSYD
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Q8RWU3 Protein REVEILLE 81.9e-5747.06Show/hide
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        P  T+  ++ +   K+ RKPYTITK RESWTE EHDKFLEA+Q                   LFDRDWKKIE FVGSKTVIQIRSHAQKYFLKV+K+GT 
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Query:  EHLPPPRPKRKAARPYPQKTSTNALALVS----------------GPFQSSSLEPNYIIKPDSSSAP-ASFMAD-NSTQMVNFSQ-SARGQVIENNCCSS
         H+PPPRPKRKAA PYPQK S NA   +                   +  +S+  N +I P    A      AD  S  ++N S  S  G    +   S 
Subjt:  EHLPPPRPKRKAARPYPQKTSTNALALVS----------------GPFQSSSLEPNYIIKPDSSSAP-ASFMAD-NSTQMVNFSQ-SARGQVIENNCCSS

Query:  TDRTTRARFPTKSSVEEHNKLQLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYD
        ++   +A+ P            L  +PDF +VYNFIGSVFDP+   H++KLK+MD I+ ETV+LLMRNL +NL+ PD E  +KVL SYD
Subjt:  TDRTTRARFPTKSSVEEHNKLQLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G01520.1 Homeodomain-like superfamily protein2.0e-6249.26Show/hide
Query:  SLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHLPPPR
        S  +D  K+ RKPYTITK RE+WTE EHDKFLEA+                    LFDRDWKKI+AFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKV+K+GT EHLPPPR
Subjt:  SLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHLPPPR

Query:  PKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSSSLEPNYIIKPDSSSAPASFMADNSTQMVNFSQSARGQVIE------NNCC--SSTDRTTRARFPTKSSVEEH
        PKRKA  PYPQK     L+  +  FQ   L        +++S P          +V+   S    VI+       NCC  SS+    R R  T+++ +E 
Subjt:  PKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSSSLEPNYIIKPDSSSAPASFMADNSTQMVNFSQSARGQVIE------NNCC--SSTDRTTRARFPTKSSVEEH

Query:  NKLQLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYDA
             RV P+F +VYNFIGSVFDPK + H+++LK+MD I++ETV+LLM+NL++NLT P+F++ +K++SSY+A
Subjt:  NKLQLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYDA

AT4G01280.1 Homeodomain-like superfamily protein1.2e-6450Show/hide
Query:  TAATSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHL
        T+  S  +D   + RKPYTI K RE+WT+ EHDKFLEA+                    LFDRDWKKIEAFVGSKTV+QIRSHAQKYFLKV+KSG  EHL
Subjt:  TAATSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHL

Query:  PPPRPKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSS--SLEPNYIIKPDSSS--APASFMADNSTQMVNFSQSARGQVIE------------NNCCSSTDRTTR
        PPPRPKRKA+ PYP K   N +A  S P  S+   LEP Y+   DS S     +  A  S+   + S +    VIE            NN C   D T R
Subjt:  PPPRPKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSS--SLEPNYIIKPDSSS--APASFMADNSTQMVNFSQSARGQVIE------------NNCCSSTDRTTR

Query:  ARFPTKSSVEEHNKLQLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYDA
         R  TK + EE  +   RV+P+F +VY+FIGSVFDP  S HLQ+LKQMD I++ETV+LLM+NL++NLT P+F + ++++SSY A
Subjt:  ARFPTKSSVEEHNKLQLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYDA

AT4G01280.2 Homeodomain-like superfamily protein1.6e-6449.82Show/hide
Query:  TAATSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHL
        T+  S  +D   + RKPYTI K RE+WT+ EHDKFLEA+                    LFDRDWKKIEAFVGSKTV+QIRSHAQKYFLKV+KSG  EHL
Subjt:  TAATSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHL

Query:  PPPRPKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSS--SLEPNYIIKPDSSS--APASFMADNSTQMVNFSQSARGQVIE-------------NNCCSSTDRTT
        PPPRPKRKA+ PYP K   N +A  S P  S+   LEP Y+   DS S     +  A  S+   + S +    VIE             NN C   D T 
Subjt:  PPPRPKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSS--SLEPNYIIKPDSSS--APASFMADNSTQMVNFSQSARGQVIE-------------NNCCSSTDRTT

Query:  RARFPTKSSVEEHNKLQLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYDA
        R R  TK + EE  +   RV+P+F +VY+FIGSVFDP  S HLQ+LKQMD I++ETV+LLM+NL++NLT P+F + ++++SSY A
Subjt:  RARFPTKSSVEEHNKLQLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYDA

AT5G52660.1 Homeodomain-like superfamily protein1.5e-8158.91Show/hide
Query:  TSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHLPPP
        +S  +DL K+ RKPYTITK RESWTEPEHDKFLEA+Q                   LFDRDWKKIEAF+GSKTVIQIRSHAQKYFLKV+KSGTGEHLPPP
Subjt:  TSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHLPPP

Query:  RPKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSSS--LEPNYIIKPDSSS----APASFMA---DNSTQMVNFSQSARGQVIENNCCSSTDRTTRARFPTKSSVE
        RPKRKAA PYPQK   N    V G F+S+S   +P+++ +P+SSS    +P +  A    N+ Q ++F+   +G    NNC SS++ T R R  +     
Subjt:  RPKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSSS--LEPNYIIKPDSSS----APASFMA---DNSTQMVNFSQSARGQVIENNCCSSTDRTTRARFPTKSSVE

Query:  EHNKL--QLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYD
        +H  +   LRVLPDF QVY FIGSVFDP AS+HLQKLK+MD IDVETV+LLMRNL+INL+ PDFEDH+++LSSYD
Subjt:  EHNKL--QLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYD

AT5G52660.2 Homeodomain-like superfamily protein3.6e-8058.7Show/hide
Query:  TSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHLPPP
        +S  +DL K+ RKPYTITK RESWTEPEHDKFLEA+Q                   LFDRDWKKIEAF+GSKTVIQIRSHAQKYFLKV+KSGTGEHLPPP
Subjt:  TSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHLPPP

Query:  RPKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSSS--LEPNYIIKPDSSS----APASFMA---DNSTQMVNFSQSAR-GQVIENNCCSSTDRTTRARFPTKSSV
        RPKRKAA PYPQK   N    V G F+S+S   +P+++ +P+SSS    +P +  A    N+ Q ++F+   + G    NNC SS++ T R R  +    
Subjt:  RPKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSSS--LEPNYIIKPDSSS----APASFMA---DNSTQMVNFSQSAR-GQVIENNCCSSTDRTTRARFPTKSSV

Query:  EEHNKL--QLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYD
         +H  +   LRVLPDF QVY FIGSVFDP AS+HLQKLK+MD IDVETV+LLMRNL+INL+ PDFEDH+++LSSYD
Subjt:  EEHNKL--QLRVLPDFGQVYNFIGSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTACCGTTCGACACTGCTGCTACGTCGTTGCGAGATGACCTATTGAAGAGAGCTCGGAAACCTTACACCATCACCAAGTGCAGAGAGAGCTGGACTGAGCCTGA
GCACGATAAGTTCCTCGAAGCTATACAACTGTATATTCTTCTCTCTCCGATATATTTTCGAGCTTCTTTGTTCTTCTTCATCCTCCTATTTGATCGCGACTGGAAGAAGA
TTGAGGCCTTTGTAGGGTCGAAAACCGTCATTCAGATACGAAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTGAAGGTTGAGAAGAGTGGGACAGGCGAACACCTACCTCCTCCACGA
CCAAAGAGGAAAGCTGCTCGTCCATATCCTCAAAAGACTTCAACAAATGCTCTTGCGCTAGTGTCAGGGCCATTTCAATCTTCTTCTCTTGAACCGAATTATATTATAAA
GCCAGATTCCTCTTCTGCTCCTGCGAGTTTCATGGCGGATAACTCTACCCAGATGGTTAATTTCTCTCAGAGTGCAAGAGGGCAAGTTATAGAAAACAATTGTTGCAGTA
GCACAGACCGCACTACAAGAGCACGCTTTCCAACTAAATCAAGCGTCGAGGAACATAATAAGCTTCAGTTGAGAGTTCTGCCAGATTTTGGTCAAGTCTACAACTTCATT
GGCAGCGTGTTCGACCCAAAAGCCTCGGATCATTTGCAGAAGTTAAAACAGATGGACCAAATAGACGTCGAAACTGTGATGTTGCTCATGAGAAACCTGGCCATTAATCT
CACCGGCCCCGACTTTGAGGACCATAAAAAGGTACTCTCGTCATATGATGCCTTCATGGAACATGGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGTTACCGTTCGACACTGCTGCTACGTCGTTGCGAGATGACCTATTGAAGAGAGCTCGGAAACCTTACACCATCACCAAGTGCAGAGAGAGCTGGACTGAGCCTGA
GCACGATAAGTTCCTCGAAGCTATACAACTGTATATTCTTCTCTCTCCGATATATTTTCGAGCTTCTTTGTTCTTCTTCATCCTCCTATTTGATCGCGACTGGAAGAAGA
TTGAGGCCTTTGTAGGGTCGAAAACCGTCATTCAGATACGAAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTGAAGGTTGAGAAGAGTGGGACAGGCGAACACCTACCTCCTCCACGA
CCAAAGAGGAAAGCTGCTCGTCCATATCCTCAAAAGACTTCAACAAATGCTCTTGCGCTAGTGTCAGGGCCATTTCAATCTTCTTCTCTTGAACCGAATTATATTATAAA
GCCAGATTCCTCTTCTGCTCCTGCGAGTTTCATGGCGGATAACTCTACCCAGATGGTTAATTTCTCTCAGAGTGCAAGAGGGCAAGTTATAGAAAACAATTGTTGCAGTA
GCACAGACCGCACTACAAGAGCACGCTTTCCAACTAAATCAAGCGTCGAGGAACATAATAAGCTTCAGTTGAGAGTTCTGCCAGATTTTGGTCAAGTCTACAACTTCATT
GGCAGCGTGTTCGACCCAAAAGCCTCGGATCATTTGCAGAAGTTAAAACAGATGGACCAAATAGACGTCGAAACTGTGATGTTGCTCATGAGAAACCTGGCCATTAATCT
CACCGGCCCCGACTTTGAGGACCATAAAAAGGTACTCTCGTCATATGATGCCTTCATGGAACATGGTTAGTAACAAGAGCAAAGCTGGAGACCTCAACCGTTGGAAATGG
CAACGGCAGCTACTACTTCACCGAACTGTACCTAATTGAGCCTTCCTTAATGCTACTGAACTAGATAACTAGTATTGTATTGCTGTTGCATATTCGCCCACGGTCGCTTC
TTAGAGCAAGAAGGAAGAATGTTCCTCTCGTCCCCGTTCCGCGTATGTGGACAGTGCGAGGTTGCTTCTGTATCTTATAGCTTTCACGTGAAGTACGGATATTTGTTTCC
TAGAAATAATTTATTAGGGCACAGAGAAGATAAATGCGGAAGAAAAGAAGTATCTGTTCGTATATTGAAGTAACATCCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALPFDTAATSLRDDLLKRARKPYTITKCRESWTEPEHDKFLEAIQLYILLSPIYFRASLFFFILLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVEKSGTGEHLPPPR
PKRKAARPYPQKTSTNALALVSGPFQSSSLEPNYIIKPDSSSAPASFMADNSTQMVNFSQSARGQVIENNCCSSTDRTTRARFPTKSSVEEHNKLQLRVLPDFGQVYNFI
GSVFDPKASDHLQKLKQMDQIDVETVMLLMRNLAINLTGPDFEDHKKVLSSYDAFMEHG