; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15268 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15268
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProtein of unknown function (DUF803)
Genome locationCarg_Chr09:7741587..7743823
RNA-Seq ExpressionCarg15268
SyntenyCarg15268
Gene Ontology termsGO:1903830 - magnesium ion transmembrane transport (biological process)
GO:0005769 - early endosome (cellular component)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0015095 - magnesium ion transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008521 - Magnesium transporter NIPA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592246.1 putative magnesium transporter NIPA6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-47100Show/hide
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KAG7025092.1 putative magnesium transporter NIPA6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-47100Show/hide
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XP_022932550.1 probable magnesium transporter NIPA6 [Cucurbita moschata]1.3e-47100Show/hide
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XP_022976923.1 probable magnesium transporter NIPA6 [Cucurbita maxima]1.3e-47100Show/hide
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XP_038897340.1 probable magnesium transporter NIPA6 isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-4697.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K4P7 Probable magnesium transporter5.9e-4695.88Show/hide
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A0A1S3CF57 Probable magnesium transporter4.5e-4696.91Show/hide
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A0A6J1DPZ1 Probable magnesium transporter1.0e-4290.72Show/hide
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A0A6J1F2H7 Probable magnesium transporter6.3e-48100Show/hide
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A0A6J1INJ5 Probable magnesium transporter6.3e-48100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B3LFA3 Probable magnesium transporter NIPA29.2e-1251.35Show/hide
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F4JKQ7 Probable magnesium transporter NIPA51.3e-1073.33Show/hide
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Q8GWX2 Probable magnesium transporter NIPA66.8e-1551.19Show/hide
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Q8GYS1 Probable magnesium transporter NIPA71.3e-1362.5Show/hide
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Q9LIR9 Probable magnesium transporter NIPA12.1e-1171.74Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G21120.1 Protein of unknown function (DUF803)4.8e-1651.19Show/hide
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AT3G23870.1 Protein of unknown function (DUF803)1.5e-1271.74Show/hide
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AT4G09640.1 Protein of unknown function (DUF803)9.5e-1273.33Show/hide
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AT4G13800.1 Protein of unknown function (DUF803)6.5e-1351.35Show/hide
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AT4G38730.1 Protein of unknown function (DUF803)9.1e-1562.5Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGGGACCGTCGTCTTGCACGATACAAGATCGCCCGATCCTGCCTCTGTTTCAGAGATGTACATGTCTGTCTCGCCTCAAGTGTCGTGGTATTTCCCCGCAAATGGCGATA
CCTGGAAACGACAATCCGAAGAAATGCTATTGCCAGATTTTGATGCAATCCTCAAACAAGACCATTTCACATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CACATCTTTCACCATCTTCGCCAGTGTCATAATGTTCAAGGATTGGTCTGGTCAGAGTGCTAGCAGCATTGCATCAGAACTCTGTGGATTTGTAACCATACTTTCCGGGA
CCGTCGTCTTGCACGATACAAGATCGCCCGATCCTGCCTCTGTTTCAGAGATGTACATGTCTGTCTCGCCTCAAGTGTCGTGGTATTTCCCCGCAAATGGCGATACCTGG
AAACGACAATCCGAAGAAATGCTATTGCCAGATTTTGATGCAATCCTCAAACAAGACCATTTCACATGAGATCAAAGGTAATTCATGCACATTACTTACTAATGCATCTC
CACTGCAACACCAAACAAATGCAACTAAATTTTGGGAGAAATCTGCATATATAGTTAGTTTAATGCGTTATTTGGTAGAACGGTTTCAGCGGAGTTTCGTTTTCTTTCTC
CGCTCGGCCGTTCGAGATTGAAGAACGAGTAGGGCTTGTGGGACGTAGTATGTACTTTGTAACTATTCATTTTGTTCCTAAGAATTGAAACACAGCTTCTTCCCATCCCT
TTTCACCTTTAGGTCTCTAACACCTCCCTCTCTCTTAACATTATTTTGTAAAGTAGAACAGATCTTGTGGATCAAAAATGTAATCTGCTTTGTTTTGTGTGTATTCTTTT
TATTCACTCATTCTCTTAGCCATGGAAATGTGAGATATTTGATGCTAAAATGTCACGGCCCAAGCTCACCGCTGGTAGATATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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