; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15373 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15373
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAgamous-like putative transcription factor
Genome locationCarg_Chr03:9481463..9485752
RNA-Seq ExpressionCarg15373
SyntenyCarg15373
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001292633.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucumis sativus]7.0e-11697.38Show/hide
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XP_022978760.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucurbita maxima]2.8e-11799.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KID6 Uncharacterized protein3.4e-11697.38Show/hide
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A0A6J1ECE2 floral homeotic protein AGAMOUS1.6e-118100Show/hide
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A0A6J1IR53 floral homeotic protein AGAMOUS1.4e-11799.13Show/hide
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O64958 CUM13.4e-11697.38Show/hide
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Q9SBK1 Agamous-like putative transcription factor3.4e-11697.38Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q40168 Floral homeotic protein AGAMOUS1.9e-8773.42Show/hide
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Q40872 Floral homeotic protein AGAMOUS4.9e-8875.76Show/hide
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Q40885 Floral homeotic protein AGAMOUS1.2e-8977.06Show/hide
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Q43585 Floral homeotic protein AGAMOUS2.8e-9177.64Show/hide
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Q93XH4 Agamous-like MADS-box protein MADS11.5e-8173.33Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42830.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein1.4e-6963.68Show/hide
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AT2G42830.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein4.4e-6863.14Show/hide
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         QI ++QN NR++LGESL SL+ K+LK+LES+LEKGISR+RSKK+E+L AEIEYM+KR  EI+L N+N  LR+KI E       E +    G  +E    
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AT3G58780.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein3.9e-7264.83Show/hide
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Query:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER-NANMM------------GGEF
         QI ++QNSNR+++GESL SL+ K+LK+LE +LEKGISR+RSKKNELL AEIEYM+KRE++L +NN  LRAKIAE  R N +               G  
Subjt:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER-NANMM------------GGEF

Query:  ELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
           QS  Y+ R++  VN L+ N Q+  QD   LQLV
Subjt:  ELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

AT3G58780.3 K-box region and MADS-box transcription factor family protein5.8e-6858.62Show/hide
Query:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNS-------------------------VKATIDRYKKAS
        +K+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVAL++FS+RGRLYEYANNS                         V+ TI+RYKKA 
Subjt:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNS-------------------------VKATIDRYKKAS

Query:  SDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAE
        SD+ N  S +EANTQ+YQQEA+KLR QI ++QNSNR+++GESL SL+ K+LK+LE +LEKGISR+RSKKNELL AEIEYM+KRE++L +NN  LRAKIAE
Subjt:  SDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAE

Query:  SER-NANMM------------GGEFELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
          R N +               G     QS  Y+ R++  VN L+ N Q+  QD   LQLV
Subjt:  SER-NANMM------------GGEFELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

AT4G18960.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.7e-8169.71Show/hide
Query:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA
        SP RK GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEY+NNSVK TI+RYKKA SD+SNTGS +E N Q+YQQE+A
Subjt:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA

Query:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN----ANMMGGE--FELM-
        KLR QI ++QNSNR ++GE++ S+S K+L++LE +LE+ I+RIRSKKNELLF+EI+YM+KRE+DLHN+NQ+LRAKIAE+ERN    + M GG    +LM 
Subjt:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN----ANMMGGE--FELM-

Query:  ----QSHPYDPRDFFQVNGLQ-HNHQYP---RQDNMALQLV
            QS P+D R++FQV  LQ +NH Y    RQD  ALQLV
Subjt:  ----QSHPYDPRDFFQVNGLQ-HNHQYP---RQDNMALQLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGACTCACCTCAGAGGAAGATGGGAAGAGGAAAGATTGAGATTAAGAGGATCGAAAATACAACAAATCGTCAAGTCACTTTCTGTAAGAGACGAAATGGGCTGCT
TAAAAAAGCTTATGAACTTTCTGTTCTCTGTGATGCCGAAGTTGCTCTCATCGTTTTCTCAAGCCGCGGTCGCCTCTATGAGTATGCTAACAACAGTGTGAAGGCAACCA
TTGATAGATACAAGAAAGCATCCTCAGATTCCTCAAACACTGGATCTACTTCTGAAGCTAACACTCAGTTTTACCAACAAGAAGCTGCCAAACTTCGAGTTCAGATTGGT
AACTTGCAGAATTCAAACAGGAACATGCTGGGTGAGTCTCTAAGTTCTTTGAGTGTAAAAGATCTGAAAAGCCTCGAGAGCAAACTTGAGAAAGGAATCAGCAGGATTAG
GTCCAAAAAGAATGAACTCCTCTTTGCTGAAATTGAGTATATGCGGAAAAGGGAAATTGATTTGCACAACAACAATCAGCTGCTTCGAGCAAAGATTGCTGAGAGTGAAA
GAAATGCCAACATGATGGGAGGAGAATTCGAGCTGATGCAATCTCATCCCTACGATCCCCGAGACTTCTTCCAAGTGAACGGCTTACAACATAATCACCAGTATCCACGC
CAAGACAACATGGCTCTTCAATTAGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATACACACACCTCTTTCGCTACCTTACTTCCATTTCTTCTTCTCCTCCTCCTCCCCTAATCTTTGAGGGATACAAAGGCTGTGTGATTCCATCTCTTAAGGAATCAACAG
TTGTTGGGAAATGGAGATTTGGGTTTTGATTTTGATGAGTGATCTGTTTGGAATTGATTTAGGTAAGCTGCAAATAAGAAGAGAGGATGTCAGACTCACCTCAGAGGAAG
ATGGGAAGAGGAAAGATTGAGATTAAGAGGATCGAAAATACAACAAATCGTCAAGTCACTTTCTGTAAGAGACGAAATGGGCTGCTTAAAAAAGCTTATGAACTTTCTGT
TCTCTGTGATGCCGAAGTTGCTCTCATCGTTTTCTCAAGCCGCGGTCGCCTCTATGAGTATGCTAACAACAGTGTGAAGGCAACCATTGATAGATACAAGAAAGCATCCT
CAGATTCCTCAAACACTGGATCTACTTCTGAAGCTAACACTCAGTTTTACCAACAAGAAGCTGCCAAACTTCGAGTTCAGATTGGTAACTTGCAGAATTCAAACAGGAAC
ATGCTGGGTGAGTCTCTAAGTTCTTTGAGTGTAAAAGATCTGAAAAGCCTCGAGAGCAAACTTGAGAAAGGAATCAGCAGGATTAGGTCCAAAAAGAATGAACTCCTCTT
TGCTGAAATTGAGTATATGCGGAAAAGGGAAATTGATTTGCACAACAACAATCAGCTGCTTCGAGCAAAGATTGCTGAGAGTGAAAGAAATGCCAACATGATGGGAGGAG
AATTCGAGCTGATGCAATCTCATCCCTACGATCCCCGAGACTTCTTCCAAGTGAACGGCTTACAACATAATCACCAGTATCCACGCCAAGACAACATGGCTCTTCAATTA
GTTTAAGTTAATAATAGTATGGTTTGAAGCTCTCTGGTTGGTGGATTATAAGGAGCGCCCCATCTCTGCTGATTGAAAGGTACTTGAAAGGAACTTGAAGATCATACCTC
ATCTATGCCTTAGCAAAGTCTTAGCTTCTGGACTCTAAAAAAAGACATATTCCAATATATATATATGTATGTATGTAATGTTGTTGTCTGGTATGCATCCAAAACATTAA
TAACCTATCTTATCTTTGTGTTAAAATCTATGTCTGTCATACAAACAACTAACATATTGTCTCATACTTCTGTCTTGTTTTCTGTTTCACTGTCTCAACTTTCTGTGATT
CTTATTTTGTTTCTAATTATGATGTAATGGCTGATTATTGAGAAGATTGAAACTTTTTAATTGATTACTTAGCTTAAGTGCAAGAGGGAAATAAGAGAACAATGATTGAA
AGCTTTGTATGTTTTTTGGGTTTATTTATGGGTTTTTCCTTTCGGGCTTCACTGCAAGGTTTTAAGACGTGTCTACTAGTAAAATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQIG
NLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNANMMGGEFELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPR
QDNMALQLV