; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15382 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15382
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAWPM-19-like protein
Genome locationCarg_Chr03:9517294..9518411
RNA-Seq ExpressionCarg15382
SyntenyCarg15382
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581397.1 hypothetical protein SDJN03_21399, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-8098.8Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        M AIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSS+ANNLPLAANLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNVR
        AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNVR
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNVR

KAG7034682.1 hypothetical protein SDJN02_04412 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-81100Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNVR
        AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNVR
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNVR

XP_022925784.1 uncharacterized protein LOC111433089 [Cucurbita moschata]5.9e-7294.97Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        MKAIA SIL FNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFY   SDANNLPLAANLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS
        AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEA +IILSVTQFIYTAIIVCT TS
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS

XP_022978777.1 uncharacterized protein LOC111478636 [Cucurbita maxima]1.7e-6686.75Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        M+AIA+SI FFNFC S++IFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFY R S+ N      NLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNV
        AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTS HLMALEA +IILSVTQFIYTAIIV T TS STRNNV
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNV

XP_023543821.1 uncharacterized protein LOC111803574 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-7295.6Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISG FY   SDANNLPLAANLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS
        AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEA+VIILSVTQFIYTAIIV T TS
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AZB2 uncharacterized protein LOC1034844071.6e-5980.5Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        MKAIA+ ILFFNFC  IVIFGIGGWVMNH+IDNGFVIGA F+VP YFSPIFFQIGN+ATGFFV+FALIAAVA VAS ISG+FY R SD      AANLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS
        AAS+AL+ACFLTFLAMGFAWKEI+ TVTSGHL+ALEAL+I+LSVTQF+YTAIIV T TS
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS

A0A5A7UGF2 AWPM-19-like protein1.6e-5980.5Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        MKAIA+ ILFFNFC  IVIFGIGGWVMNH+IDNGFVIGA F+VP YFSPIFFQIGN+ATGFFV+FALIAAVA VAS ISG+FY R SD      AANLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS
        AAS+AL+ACFLTFLAMGFAWKEI+ TVTSGHL+ALEAL+I+LSVTQF+YTAIIV T TS
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS

A0A5D3CS83 Uncharacterized protein1.6e-5980.5Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        MKAIA+ ILFFNFC  IVIFGIGGWVMNH+IDNGFVIGA F+VP YFSPIFFQIGN+ATGFFV+FALIAAVA VAS ISG+FY R SD      AANLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS
        AAS+AL+ACFLTFLAMGFAWKEI+ TVTSGHL+ALEAL+I+LSVTQF+YTAIIV T TS
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS

A0A6J1ED64 uncharacterized protein LOC1114330892.9e-7294.97Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        MKAIA SIL FNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFY   SDANNLPLAANLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS
        AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEA +IILSVTQFIYTAIIVCT TS
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTS

A0A6J1IM08 uncharacterized protein LOC1114786368.0e-6786.75Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        M+AIA+SI FFNFC S++IFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFY R S+ N      NLPP
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNV
        AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTS HLMALEA +IILSVTQFIYTAIIV T TS STRNNV
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L3.7e-0834.64Show/hide
Query:  KAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPPA
        + + + +L  N    +++ G   W +NH       I  E   P          GN AT +F+VFA++A V   AS ++G  ++RS  A+      +L   
Subjt:  KAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPPA

Query:  ASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSG-HLMALEALVIILSVTQFIYTAII
        A+SALIA  +T LA G A KEI      G  L  LEA VIIL+ TQ +Y A++
Subjt:  ASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSG-HLMALEALVIILSVTQFIYTAII

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein9.9e-0935.1Show/hide
Query:  IASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPPAAS
        IA+ +LF N    +++ G   W +N  I NG      F             GN AT FF+ F+++AAV  VAS ++G+ ++R     N  LAA    A +
Subjt:  IASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPPAAS

Query:  SALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSG-HLMALEALVIILSVTQFIYTAII
        S+++A  +T LAMG A K+I+     G  L  +EA +IIL+ TQ +Y  +I
Subjt:  SALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSG-HLMALEALVIILSVTQFIYTAII

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein6.8e-3450.98Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        +K +AS +L  NFC  +++ GIGGW MN +ID+GF +G   E+P +FSPI+F +GN ATGFFV+FAL+A V   AS ISG  ++RS          +LP 
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAII
        AA++A IA  LT LAMGFAWKEI     +  L  +EA +IILSVTQ IY A +
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAII

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein5.8e-1739.47Show/hide
Query:  KAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPPA
        K+ A  +L  N     VI  I  W +NH I+      +   +P    PI+F +GN ATGFFV+F LIA V  +A+ ++G   +   D      + NL  A
Subjt:  KAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPPA

Query:  ASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAII
        A+S+LI+  LT LAMG A KEI+   T  +L  LE L II+S TQ + T  I
Subjt:  ASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAII

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein4.1e-3150.33Show/hide
Query:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP
        MK +AS +L  NFC   ++ GIG W MN +I++GF+IGA++ +P +FSPI F +GN ATGFF++FALIA VA  ASVISG  +L+S          +LP 
Subjt:  MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPP

Query:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAII
        A S+A IA  LT LAMGF  KEI   + +  L  +EA +IILS TQ +Y A I
Subjt:  AASSALIACFLTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAII


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGGCCATTGCTTCGTCGATTTTGTTCTTCAATTTCTGCGCTAGCATCGTCATTTTCGGGATCGGTGGCTGGGTGATGAATCACTCAATTGATAATGGATTTGTTAT
TGGTGCTGAGTTTGAAGTCCCTGTATATTTTTCTCCAATTTTCTTCCAAATTGGGAACACTGCCACTGGGTTCTTCGTTGTTTTTGCTTTGATTGCTGCTGTTGCTACTG
TTGCATCTGTCATCTCTGGAAGCTTCTACTTACGTTCTTCCGACGCTAACAACTTGCCCCTCGCTGCCAACTTGCCCCCCGCTGCTTCATCAGCTCTCATCGCCTGCTTC
CTAACTTTTCTCGCTATGGGGTTTGCTTGGAAAGAGATCTCCCAAACTGTCACCAGTGGTCATCTGATGGCATTGGAGGCTCTCGTAATTATCCTTTCAGTTACGCAGTT
TATTTACACTGCAATCATTGTGTGCACCCCAACCAGCCAGTCGACTCGAAATAACGTTCGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATGAACTCTCAAGTTTAAAGCCATAAACAAAACTCTTTCATCTCAAAACCCTTCTTTCTTCTATACAACCCATTTGAAGATATGAAGGCCATTGCTTCGTCGATTTTGT
TCTTCAATTTCTGCGCTAGCATCGTCATTTTCGGGATCGGTGGCTGGGTGATGAATCACTCAATTGATAATGGATTTGTTATTGGTGCTGAGTTTGAAGTCCCTGTATAT
TTTTCTCCAATTTTCTTCCAAATTGGGAACACTGCCACTGGGTTCTTCGTTGTTTTTGCTTTGATTGCTGCTGTTGCTACTGTTGCATCTGTCATCTCTGGAAGCTTCTA
CTTACGTTCTTCCGACGCTAACAACTTGCCCCTCGCTGCCAACTTGCCCCCCGCTGCTTCATCAGCTCTCATCGCCTGCTTCCTAACTTTTCTCGCTATGGGGTTTGCTT
GGAAAGAGATCTCCCAAACTGTCACCAGTGGTCATCTGATGGCATTGGAGGCTCTCGTAATTATCCTTTCAGTTACGCAGTTTATTTACACTGCAATCATTGTGTGCACC
CCAACCAGCCAGTCGACTCGAAATAACGTTCGGTGAACGCTTAGTTAGTGGGGTTTGCTTTCAAATTTTCTTTCCTTTCCATTCTTTATTTTTCTCTACTTCAGCTCTAT
ATGTAAATGGGGAGAAACTCACAGTTGGTGTGCAAAAAAAGAATAAAATTTCAATGACTTTGATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKAIASSILFFNFCASIVIFGIGGWVMNHSIDNGFVIGAEFEVPVYFSPIFFQIGNTATGFFVVFALIAAVATVASVISGSFYLRSSDANNLPLAANLPPAASSALIACF
LTFLAMGFAWKEISQTVTSGHLMALEALVIILSVTQFIYTAIIVCTPTSQSTRNNVR