; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15610 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15610
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr11:11112461..11112973
RNA-Seq ExpressionCarg15610
SyntenyCarg15610
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588944.1 LOB domain-containing protein 25, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-8999.41Show/hide
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KAG7022712.1 LOB domain-containing protein 25, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-90100Show/hide
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XP_022928544.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita moschata]9.2e-8998.83Show/hide
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XP_022989224.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita maxima]5.6e-8697.06Show/hide
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XP_023530211.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.8e-8898.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein1.1e-7990.29Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.1e-7990.29Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like4.9e-8088.27Show/hide
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A0A6J1EL51 LOB domain-containing protein 25-like4.5e-8998.83Show/hide
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A0A6J1JNR8 LOB domain-containing protein 25-like2.7e-8697.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 63.5e-3862.5Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC P+CVFAPYFP + PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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           L +Y  +   A ++S+S
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 25.3e-3950.58Show/hide
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        +S+ +NSPCAACKFLRRKC P CVFAPYFP ++PQKFANVHK+FGASNV+KLLNE+ P QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCVG IS+LQ Q+ +LQ +
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        L    + L +Y    + A +  S      + +     ++    Y H+        + GL    P G+++D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.1e-4982.88Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  +CVFAPYFP EEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQREL
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Query:  DATNANLIRYA
        + TNA+L+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 63.5e-3862.5Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC P+CVFAPYFP + PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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Query:  NANLIRYACSELPAPSSSSS
           L +Y  +   A ++S+S
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES2.8e-4880Show/hide
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Query:  ELDATNANLIRYACS
        ELDA NA+L  Y  S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 258.1e-5182.88Show/hide
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Query:  DATNANLIRYA
        + TNA+L+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.0e-4980Show/hide
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Query:  ELDATNANLIRYACS
        ELDA NA+L  Y  S
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.0e-4980Show/hide
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Query:  ELDATNANLIRYACS
        ELDA NA+L  Y  S
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.0e-4980Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFP EEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQ+
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Query:  ELDATNANLIRYACS
        ELDA NA+L  Y  S
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.0e-4980Show/hide
Query:  SSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPNCVFAPYFPSEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQR
        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFP EEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQ+
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Query:  ELDATNANLIRYACS
        ELDA NA+L  Y  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGTCTCCCGAACTGCGTTTTCGCGCCGTATTTCCCGTCGGAGGAGCCACA
AAAGTTCGCCAATGTTCACAAGATCTTCGGAGCTAGCAATGTCAGCAAACTACTAAACGAGGTCCAGCCACACCAACGAGAGGATGCCGTGAACTCGCTCGCTTACGAGG
CCGAGGCGAGGATGAAAGACCCCGTCTACGGCTGCGTCGGCGCCATCTCGATCCTCCAAAGACAAGTCATCAAGCTTCAAAGAGAACTCGATGCTACCAACGCTAACCTC
ATTCGCTACGCCTGCAGTGAACTCCCCGCCCCGTCGTCATCGTCGTCGCAATATGCTCGGAGATCGTCATCGACAAGCCACGTCGGAAGCTCGTCGACCTCTAGCTATGG
CCATTACTATTCTGGCCTCTACTTTTGTGGCCCTTGTGGAGATGACCATGACAAAGGAGAAGAACACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGTCTCCCGAACTGCGTTTTCGCGCCGTATTTCCCGTCGGAGGAGCCACA
AAAGTTCGCCAATGTTCACAAGATCTTCGGAGCTAGCAATGTCAGCAAACTACTAAACGAGGTCCAGCCACACCAACGAGAGGATGCCGTGAACTCGCTCGCTTACGAGG
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CCATTACTATTCTGGCCTCTACTTTTGTGGCCCTTGTGGAGATGACCATGACAAAGGAGAAGAACACAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPNCVFAPYFPSEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQRELDATNANL
IRYACSELPAPSSSSSQYARRSSSTSHVGSSSTSSYGHYYSGLYFCGPCGDDHDKGEEHK