; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15679 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15679
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionX8 domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr19:8926478..8927968
RNA-Seq ExpressionCarg15679
SyntenyCarg15679
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572453.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-107100Show/hide
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KAG7012047.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.3e-115100Show/hide
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XP_023554113.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.2e-10699.03Show/hide
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XP_038887351.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-9792.72Show/hide
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XP_038887352.1 major pollen allergen Ole e 10-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.1e-9792.72Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3M5 X8 domain-containing protein3.1e-9587.56Show/hide
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A0A0A0K8Y4 X8 domain-containing protein3.7e-9688.94Show/hide
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A0A1S4DWJ2 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like2.8e-9690.34Show/hide
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A0A5A7SSE1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like1.4e-9587.91Show/hide
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A0A6J1D2V3 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like5.3e-9588.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q84V39 Major pollen allergen Ole e 103.6e-1641.32Show/hide
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        F GT  ITS+DPS  +C + S
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Q8VYE5 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 121.5e-1735.84Show/hide
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           +  C+F G +V    DPS   C Y     +     T       + G + +  SP A+        +Q+++
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Q9FJU9 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 132.8e-1642.74Show/hide
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         T +  +T      S+P
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 16.6e-1842.4Show/hide
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        S ASWC+     S T LQ  LDYACG+ G DC+  +  Q C+NP+ + +H +YA NS++Q K   P SCNF GTA  T++DPS   C + ++++ SS   
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             TTN KGS     +P S + S
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Q9ZU91 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 35.6e-1737.14Show/hide
Query:  SWCIASQSASQTALQVALDYACGHGGTDCSAIQTGQRCYNPNTIHNHASYAFNSYYQK-NPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSIL-NTT
        ++CIA +   +  LQ ALD+ACG G  DCSA+  G+ CY P+ +  H++YAFN+YYQK      SC+F G A +T+TDPS   C +  ++ S+  L N T
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Query:  N----SKGSTVFGGVPSSPSPSAATCQEINVVQQLLLVTM
        +    S  ST  G +P       A+  ++ ++  LL++ +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.4e-2641.97Show/hide
Query:  PVSTTQRDITTPITTVPTIILSNPTASTPFLNPTSTSDTYSPTMESPKRS-SPPLSGASWCIASQSASQTALQVALDYACGHGGTDCSAIQTGQRCYNPN
        PV T      TP  T P   ++NP    P   P+ T     P +  P  S SP +SG SWC+A   ASQ +LQ ALDYACG    DCS +Q G  CY+P 
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        ++ +HAS+AFNSYYQKNP P SC+FGG A + +T+PST +C Y + S++S    T  + G+T       +P+PS  T  +  V    ++ T G
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein4.3e-2852.85Show/hide
Query:  LSGASWCIASQSASQTALQVALDYACGHGGTDCSAIQTGQRCYNPNTIHNHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQYTSTSTSSSILN
        +    WCIA  +AS T+LQVALDYACG+GG DC  IQ G  CY PNTI +HAS+AFNSYYQK+P  +SCNFGG A +TSTDPS  +C ++S+S + S  +
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          +      F   PSS  P   T
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AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein6.6e-3750Show/hide
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        ++DITTP+ T PT   + PT   P  +  +++   +P T+ S           SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G  CYNPN++  H
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        AS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DPS  +C + STSTS SILN T+  G  +FG +PS P+P
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AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein5.6e-2850Show/hide
Query:  QRDITTPITTVPTIILSNPTASTPFLNPTSTSDTYSP-TMESPKRSSPPLSGASWCIASQSASQTALQVALDYACGHGGTDCSAIQTGQRCYNPNTIHNH
        ++DITTP+ T PT   + PT   P  +  +++   +P T+ S           SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G  CYNPN++  H
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        AS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DPS
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AT5G55180.1 O-Glycosyl hydrolases family 17 protein5.0e-2151.09Show/hide
Query:  PPLSGASWCIASQSASQTALQVALDYACGHGGTDCSAIQTGQRCYNPNTIHNHASYAFNSYYQKNP-VPNSCNFGGTAVITSTDPSTMACQY
        P L G +WC+A+   ++  LQ  LDYACG GG DC  IQ G  CYNP ++  HASYAFNSYYQKN     +CNFGG A + S  P    C++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAGGACACACAAGAGAGCTGAACCATGAGAATCAGAAATTCAGTTCCCCAGTTTCCACCACTCAAAGGGATATCACCACCCCTATAACAACTGTTCCCACAATAAT
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TACTAGCACTGACCCAAGTACAATGGCATGTCAGTATACATCCACTAGCACAAGTTCATCAATTCTAAACACCACAAATTCCAAAGGATCAACAGTGTTTGGAGGTGTAC
CCTCAAGCCCCTCTCCATCAGCAGCAACTTGTCAAGAAATAAATGTTGTGCAACAATTGTTGTTGGTGACCATGGGAACAGACATATCTGGGCCATGTGTTTTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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