CuGenDBv2

Gene ID	Carg15847
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	nuclear pore complex protein NUP1-like
Genome location	Carg_Chr04:19259065..19266698
RNA-Seq Expression	Carg15847
Synteny	Carg15847
Gene Ontology terms	GO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process) GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process) GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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KAG6602242.1 Nuclear pore complex protein NUP1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7032922.1 Nuclear pore complex protein NUP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_022956154.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita moschata]

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XP_022990208.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita maxima]

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        NS SILSFG P+ESMSDKAGDK SSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLT AP
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Query:  SNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSASG
        SN EPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSS GGSVFQFGAAATTDSNK+PEN TSA G
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        NVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSF
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        STGF STPTGGF FGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTS ASSQPAFGNSNHGFTFGSTP ANNDQANMEDSMAEDT+QAVTLPTPTFG   
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        QQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAP PQNPSPF ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
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XP_023527371.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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96.72

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        ADLPGTQEGTN DFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR         FEIDRLTELLKSRVVDVPSG EERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG
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        ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP
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Query:  YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ
        YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ
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        STKVHPFSSSSGK LYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKD+SSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSS
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        KYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPI+K ISAGDGLGS VPTKDTVLSSRPQV+FVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTD
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        ISFDRREKMDGSL AMSKP+DTEAITVDKPQASAEVKPST SELNK+NGQRKSDVPV A KSPIFSFATASPPSI  NAKDPESTLRPEKNISPEAPKPA
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        NAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVA SESNVAPGKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKE AK GSSSV KAES
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Query:  NSSSILSFGVPKESMSDKAGDKSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTAAP
        NSSSILSFGVPKESMSDKAGDKSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTS+PSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLT AP
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Query:  SNGEPA-TTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAS
        SN EPA TTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSA 
Subjt:  SNGEPA-TTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAS

Query:  GNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPS
        GNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGS LFGSSAPASNLFS GTTFGLT TSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPS
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Query:  FSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTIQAVTLPTPTFGQQ
        FSTGF STPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSA SSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDT+QAVTLPTPTFGQQ
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Query:  PLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
        PLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAP PQNPSPF ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

0.0e+00

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        MATERE + YEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPP ALRNS G GWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKR+PPPPPSLP+SREANDEM  +N EEVA
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Query:  ADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG
        AD PGTQEGTN+DF PSI ++N HGV+DLE+ILKEKTFTR         FEIDRLTELLKSRV DVPSG E RKFE   STPVISY+IQEGSPKF AQ+G
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Query:  ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP
        +  H+VPT V+ ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM +HS KFGD+FA  N SKSS L+LVPRSPGNFDV EN FVTPRSRGRSALY+MARMP
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Query:  YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ
        YS V AT SIKNSVATTD+YRAT +SSSQ AWE+GR+L S QGALKRRSSVLDDE+G VGPIRR+RHKSNLL+P GLSLPSSSTSIPVSGIGSE +Q  Q
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Query:  STKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLED
        STKVHPFSS +GK  YS    R+LSK SAESEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+KLTPPK+KSS+LKL SV NNSP KLSPSMLHGPALRSLED
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Query:  VDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNG
        VDS+KYLENVEDI+SND R+LTS+K +K E+SS LK K+P +K IS G G+GS VP+KDTV SS  QVSFVG S  TKCAFQMS  EDFVD+D+E  SNG
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Query:  PVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEA
        PV+  SF+RREK+D SLVA+ KPSDTEAITVDKPQAS + KPS VSE+ KIN Q KSDVPVT  KS IFSF TASP S T N  +PEST RPEK  S E 
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Query:  PKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVN
        PK A APIFGFG+KLPSQK+   S+PTF FGNK   STNEQNAVP  TSE NVAP              KATFPIPA+ ATENGN   GSPFKFAS LVN
Subjt:  PKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVN

Query:  EKESAKGGSSSVSKAESNSSSI----LSFGVPKESMSDKAGD-KSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPA
        EKE AK GS+SV K+ES+SSS     LSFGVPKESMS+KAGD KSSSAGLSVGTS NL  SSVS ST  PSLFSFSSP+TNSNL NGSL STPS F SP+
Subjt:  EKESAKGGSSSVSKAESNSSSI----LSFGVPKESMSDKAGD-KSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPA

Query:  TTFSNNITNQNPSIKPSLTAAPSNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPA-LSAAETKTKQETT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGS
         TF +NITNQN SIKPSL AA SN EP TTTSLS  SP+PSFSAAPIFKFGS SVPSSSAP+ + + ETKTKQETT FGN+SGI PSDTSAAKV STG S
Subjt:  TTFSNNITNQNPSIKPSLTAAPSNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPA-LSAAETKTKQETT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGS

Query:  VFQFGAAATT-DSNKRPENSTSASGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSA
        VFQFGAA+TT DSNK+PE ST A  +VP+FGAPV PA+SGVASSTQSTPV PFSSSSTSFGL  NTGL+SG+SL GSSAPASNLF+SG TFG  G+SSSA
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Query:  NNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTSAAS---SQPAFGNSNHGFTFGSTPPAN
        NNSVSSGAGTSSSFFNWQ SS PSFS+GFGSTPTGGF FGL+SSSAAS+SSPMLFGSSTT +ASTTSMFSFTSAA+   SQPAFG SNHGFTFGSTPPAN
Subjt:  NNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTSAAS---SQPAFGNSNHGFTFGSTPPAN

Query:  NDQANMEDSMAEDTIQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKAN
        ND ANMEDSMAEDT+Q V  PT  P+FGQQPLTPPPSSGF+FGS AP P+ A+PFQF GSQQN P PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+N
Subjt:  NDQANMEDSMAEDTIQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKAN

Query:  RKYVKVKSKSRKK
        RK+VKVKSKSRKK
Subjt:  RKYVKVKSKSRKK

A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

77.31

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Query:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSREANDEMGNENHEEVA
        MATERE + YEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPP ALRNS G GWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKR+PPPPPSLP+SREANDEM  +N EEVA
Subjt:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSREANDEMGNENHEEVA

Query:  ADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG
        AD PGTQEGTN+DF PSI ++N HGV+DLE+ILKEKTFTR         FEIDRLTELLKSRV DVPSG E RKFE   STPVISY+IQEGSPKF AQ+G
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Query:  ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP
        +  H+VPT V+ ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM +HS KFGD+FA  N SKSS L+LVPRSPGNFDV EN FVTPRSRGRSALY+MARMP
Subjt:  ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP

Query:  YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ
        YS V AT SIKNSVATTD+YRAT +SSSQ AWE+GR+L S QGALKRRSSVLDDE+G VGPIRR+RHKSNLL+P GLSLPSSSTSIPVSGIGSE +Q  Q
Subjt:  YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ

Query:  STKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLED
        STKVHPFSS +GK  YS    R+LSK SAESEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+KLTPPK+KSS+LKL SV NNSP KLSPSMLHGPALRSLED
Subjt:  STKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLED

Query:  VDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNG
        VDS+KYLENVEDI+SND R+LTS+K +K E+SS LK K+P +K IS G G+GS VP+KDTV SS  QVSFVG S  TKCAFQMS  EDFVD+D+E  SNG
Subjt:  VDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNG

Query:  PVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEA
        PV+  SF+RREK+D SLVA+ KPSDTEAITVDKPQAS + KPS VSE+ KIN Q KSDVPVT  KS IFSF TASP S T N  +PEST RPEK  S E 
Subjt:  PVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEA

Query:  PKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVN
        PK A APIFGFG+KLPSQK+   S+PTF FGNK   STNEQNAVP  TSE NVAP              KATFPIPA+ ATENGN   GSPFKFAS LVN
Subjt:  PKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVN

Query:  EKESAKGGSSSVSKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGD-KSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFS
        EKE AK GS+SV K+ES+SSS LSFGVPKESMS+KAGD KSSSAGLSVGTS NL  SSVS ST  PSLFSFSSP+TNSNL NGSL STPS F SP+ TF 
Subjt:  EKESAKGGSSSVSKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGD-KSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFS

Query:  NNITNQNPSIKPSLTAAPSNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPA-LSAAETKTKQETT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQF
        +NITNQN SIKPSL AA SN EP TTTSLS  SP+PSFSAAPIFKFGS SVPSSSAP+ + + ETKTKQETT FGN+SGI PSDTSAAKV STG SVFQF
Subjt:  NNITNQNPSIKPSLTAAPSNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPA-LSAAETKTKQETT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQF

Query:  GAAATT-DSNKRPENSTSASGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSV
        GAA+TT DSNK+PE ST A  +VP+FGAPV PA+SGVASSTQSTPV PFSSSSTSFGL  NTGL+SG+SL GSSAPASNLF+SG TFG  G+SSSANNSV
Subjt:  GAAATT-DSNKRPENSTSASGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSV

Query:  SSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTSAAS---SQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA
        SSGAGTSSSFFNWQ SS PSFS+GFGSTPTGGF FGL+SSSAAS+SSPMLFGSSTT +ASTTSMFSFTSAA+   SQPAFG SNHGFTFGSTPPANND A
Subjt:  SSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTSAAS---SQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA

Query:  NMEDSMAEDTIQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYV
        NMEDSMAEDT+Q V  PT  P+FGQQPLTPPPSSGF+FGS AP P+ A+PFQF GSQQN P PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NRK+V
Subjt:  NMEDSMAEDTIQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYV

Query:  KVKSKSRKK
        KVKSKSRKK
Subjt:  KVKSKSRKK

A0A6J1GY88 nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

98.13

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Query:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSREANDEMGNENHEEVA
        MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSREANDEMGNENHEEVA
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Query:  ADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG
        ADLPGTQEGTN DFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR         FEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG
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        ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPK+TPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP
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        YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ
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        STKVHPFSSSSGKGLYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSS
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        KYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTD
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        ISFDRREKMD SLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTA KSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEAPKPA
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        NAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAPGKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAK GSSSV KAES
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        NSSSILSFGVPKESMSDKAGDKS SAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLT AP
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Query:  SNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSASG
        SN EPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSA G
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Query:  NVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSF
        NVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSF
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        STGF STPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAF NSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDT+QAVTLPTPTFGQQP
Subjt:  STGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTIQAVTLPTPTFGQQP

Query:  LTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
        LTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAP PQNPSPF ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
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A0A6J1JSL2 nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

95.64

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        MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSREANDEMGNENHEEVA
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Query:  ADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG
        ADL GTQEG N DFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR         FEIDRLTELLKSRVVDVPSG EERKFE A STPVISYEIQEGSPKFRAQDG
Subjt:  ADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG

Query:  ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP
        ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMASHSHKF D+FASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP
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Query:  YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ
        YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLA ERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ
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Query:  STKVHPFSSSSGKGLYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSS
        STKVHPF SSSGKGLYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKS KLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSS
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Query:  KYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTD
        KYLENVEDIQSNDARELTSQK NKVEESSSLKYKLPINK ISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTD
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Query:  ISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEAPKPA
        ISFDRREKMDGSLVAMSKP+DTEAITVDKPQASAEVKPST SELNKINGQ KSDVPVTA KSPI SFATASPPSIT NAKDPES LRPEKNIS EAPK A
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Query:  NAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAPGKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKGGSSSVSKAES
        NAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAPGKATFPIPANAATENGNKNTG+PFKFASPLVNEKES K GSSSV KAES
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Query:  NSSSILSFGVPKESMSDKAGDKSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTAAP
        NS SILSFG P+ESMSDKAGDK SSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLT AP
Subjt:  NSSSILSFGVPKESMSDKAGDKSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTAAP

Query:  SNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSASG
        SN EPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKVSS GGSVFQFGAAATTDSNK+PEN TSA G
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Query:  NVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSF
        NVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSF
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Query:  STGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTIQAVTLPTPTFG---
        STGF STPTGGF FGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTS ASSQPAFGNSNHGFTFGSTP ANNDQANMEDSMAEDT+QAVTLPTPTFG   
Subjt:  STGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTIQAVTLPTPTFG---

Query:  QQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
        QQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAP PQNPSPF ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
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A0A6J1K059 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

76.78

Show/hide

Query:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSREANDEMGNENHEEVA
        MATEREE+RYEGGRGGKFQKRPLRR+HTTPYDRPP ALRNSAG GWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKR+PPPPPSLP+ REANDEM  +N EEVA
Subjt:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSREANDEMGNENHEEVA

Query:  ADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG
        AD PGTQEGTN+DF PSI ++N HGV+DLE+ILKEKTFTR         FEIDRLTELLKSRV DVPSG E RKFE+ PSTPVISY+IQEGSPKF AQ+ 
Subjt:  ADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDG

Query:  ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP
        +  H+VP  V+ ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM +HS KFGD+FA  N SKSS L+LVPRSPGNFDV EN FVTPRSRGRSALY+MARMP
Subjt:  ISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMP

Query:  YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ
        YS V AT SIKNSVATTD+YRA+ +SSSQ AWE+GR+L S QGALKRRSSVLDDE+G VGPIRR+RHKSNLL+P GLSLPSSSTSIPVSGIGSE  Q  Q
Subjt:  YSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQ

Query:  STKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLED
        STKVHPFSS++GK  YS    R+LSK SAESEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+KLTPPK+KSS+LKL SV NNSP KLSPSMLHGPALRSLED
Subjt:  STKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLED

Query:  VDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNG
        VDS+KYLENVEDI+SND R+LTS+KN+K E+SS LK ++P +K IS G G+GS VP+KDTV SS  QVSFVG S  TKCAFQMS  EDFVD+D+E  SNG
Subjt:  VDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNG

Query:  PVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEA
        PV   SF+RREK+D SLVA+ KPSD EAI VDKPQAS + KPSTVSE+ KIN Q KSD+PVT  KS IFSF TASP S T    +PEST RPEK    E 
Subjt:  PVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEA

Query:  PKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVN
        PK A APIFGFG+K PSQK+   S+PTF FGNK   STNEQNAVP  TSE NVAP              KATFPIPA+  TENGN   GSPFKFAS LVN
Subjt:  PKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVN

Query:  EKESAKGGSSSVSKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGD-KSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFS
        EKE AK GS+SV K+ES+SSSILSFGVPKE MS+KAGD KSSSAGLSVGTS NL  SSVS ST  PSLFSFSSP+TNSNL NGSL STPS F SP+ TF 
Subjt:  EKESAKGGSSSVSKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGD-KSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFS

Query:  NNITNQNPSIKPSLTAAPSNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAP-ALSAAETKTKQETT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQF
        +NITNQN SIKPSL AA SN EP TTTSLS  SP+PSFSAAPIFKFGS SVPS+SAP    + ETKTKQETT FGN+SGI PSDTSAAKV STG SVFQF
Subjt:  NNITNQNPSIKPSLTAAPSNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAP-ALSAAETKTKQETT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQF

Query:  GAAATT-DSNKRPENSTSASGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSV
        GAA+TT DSNK PE ST A  +VP+FGAPV PA+SGVASSTQSTPV PFSSSSTSFGL  NTGL+SG+SL GSSAPASNLF+SG TFG  G+SSSANNSV
Subjt:  GAAATT-DSNKRPENSTSASGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSV

Query:  SSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTS---AASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA
        SSGAGTSSSFFNWQ SS PSFS+GFGSTPTGGF FGL+SSSAAS+S+PMLFGSS+T +ASTTSMFSFTS   AASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND A
Subjt:  SSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTS---AASSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA

Query:  NMEDSMAEDTIQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYV
        NMEDSMAEDT+Q V LPT  P+FGQQPLTPPPSSGFMFGS AP P+ A+PFQF GSQQN   PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NRK+V
Subjt:  NMEDSMAEDTIQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYV

Query:  KVKSKSRKK
        KVKSKSRKK
Subjt:  KVKSKSRKK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP1

8.8e-102

33.87

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRI---------PPPPPSLPVSREANDEMGNENH
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF S+ RKR+         P     LP  R  N E     H
Subjt:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRI---------PPPPPSLPVSREANDEMGNENH

Query:  EEVAADLPG-----TQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEG
        +E  ++L         E TN    P        G TDLE+IL+ KTFTR          E+DRLT LL+S+  D  +  EE++ E      V+ +     
Subjt:  EEVAADLPG-----TQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEG

Query:  SPKFRAQDGISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LSMASHSHKFGDSFASEN--LSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRS
          +    +G  + +V T       LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L +   + +    F +      KS  ++LV + P     +ENGFVTPRS
Subjt:  SPKFRAQDGISSHVVPTQVMRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LSMASHSHKFGDSFASEN--LSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRS

Query:  RGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQG---ALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSST
        RGRSA+Y+MAR PYS        ++SV     ++A+ S      WE     GS+QG    LKRRSSVLD+++G VGP+RR+R KSN        L S S 
Subjt:  RGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQG---ALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSST

Query:  SIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPS
        ++PVS                P S  +  G  +   SK SAE   D+ P SSF+ +P +SSEMASKIL+QL+KL   ++K            SP+KLSPS
Subjt:  SIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPS

Query:  MLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSR----PQVSFVGASPQTKCAFQMS
        ML GPAL+SL++V++ K+L N+ + ++N + + + QK     ES S +      K   A DG      +KD  +  +    P  + +   P  K +F+MS
Subjt:  MLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSR----PQVSFVGASPQTKCAFQMS

Query:  AHEDFVDIDEE-GCSNGPVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFA--------TAS
        AHEDF+++D++ G ++ P          +++ S ++M           +KP   +E  PST    N    Q  S+  +   ++   +F          AS
Subjt:  AHEDFVDIDEE-GCSNGPVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFA--------TAS

Query:  PPS---ITTNAKDPESTLRP---EKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQ-------------KESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQ----NAVPVATSESN
         P+   I    K   S+ +P   EK I  E PK   A         P+              K   +S+  F     +A  T  +    N+   A S ++
Subjt:  PPS---ITTNAKDPESTLRP---EKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQ-------------KESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQ----NAVPVATSESN

Query:  VAP--GKATFPIPANAAT---ENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKGGSSSVSK--AESNSSSI---LSFGVPKESMSDKAGDKSSSAGLSVGTSENLFS
         AP    + F   ANA T    NG+  +   F  +   +    S     S+V    A  NSSSI   L       S S  A   SS++    G     FS
Subjt:  VAP--GKATFPIPANAAT---ENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKGGSSSVSK--AESNSSSI---LSFGVPKESMSDKAGDKSSSAGLSVGTSENLFS

Query:  S-SVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTAAPSNGEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSS
        + +VS S+   S  +    +T  N +        S   S    F    + +N S    +  + S    +T    +  +  P  S + IF   S S P + 
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           +SA+   T    +    S    + + ++ V    +STG SVF F A  +A+  S++   ++   +GN  T         SG  +STQS P     S 
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        S+ SFGL+ N+ L+S SS FG S     +F+S +T  L+ T+SSA++S +  +   GTS    N   +S P FS+ F   STPT  F FG SS++  S++
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        +  +FG+ST +  S + +F F               S   SQ  FGNS  GF FG+        NN Q +MEDSMAEDT QA   ++  P FGQ  ++ P
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         P+  F  G+A  PP  A+PFQFG Q  A   QN SPFQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDK+ R+  K K  +RKK
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)

6.2e-103

33.87

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          +    +G  + +V T       LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L +   + +    F +      KS  ++LV + P     +ENGFVTPRS
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        RGRSA+Y+MAR PYS        ++SV     ++A+ S      WE     GS+QG    LKRRSSVLD+++G VGP+RR+R KSN        L S S 
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        ++PVS                P S  +  G  +   SK SAE   D+ P SSF+ +P +SSEMASKIL+QL+KL   ++K            SP+KLSPS
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        ML GPAL+SL++V++ K+L N+ + ++N + + + QK     ES S +      K   A DG      +KD  +  +    P  + +   P  K +F+MS
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        AHEDF+++D++ G ++ P          +++ S ++M           +KP   +E  PST    N    Q  S+  +   ++   +F          AS
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         P+   I    K   S+ +P   EK I  E PK   A         P+              K   +S+  F     +A  T  +    N+   A S ++
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Query:  VAP--GKATFPIPANAAT---ENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKGGSSSVSK--AESNSSSI---LSFGVPKESMSDKAGDKSSSAGLSVGTSENLFS
         AP    + F   ANA T    NG+  +   F  +   +    S     S+V    A  NSSSI   L       S S  A   SS++    G     FS
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        + +VS S+   S  +    +T  N +        S   S    F    + +N S    +  + S    +T    +  +  P  S + IF   S S P + 
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Query:  APALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKV----SSTGGSVFQFGA--AATTDSNKRPENSTSASGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPV-LPFSS
           +SA+   T    +    S    + + ++ V    +STG SVF F A  +A+  S++   ++   +GN  T         SG  +STQS P     S 
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Query:  SSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGA---GTSSSFFNWQTSSTPSFSTGF--GSTPTGGFPFGLSSSSAASNS
        S+ SFGL+ N+ L+S SS FG S     +F+S +T  L+ T+SSA++S +  +   GTS    N   +S P FS+ F   STPT  F FG SS++  S++
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        +  +FG+ST +  S + +F F               S   SQ  FGNS  GF FG+        NN Q +MEDSMAEDT QA   ++  P FGQ  ++ P
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         P+  F  G+A  PP  A+PFQFG Q  A   QN SPFQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDK+ R+  K K  +RKK
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AT5G20200.1 nucleoporin-related

8.9e-17

23.79

Show/hide

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        GG GGK +++  RR   TPY RP           W+S++VDPA ++I+  A R+    F      P    PP      +   +   ++++     +    
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Query:  EGTNHDFGPSIKTDNTH--------------------GVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKFEIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYE
        E  + + G    T N +                     +++LE++++ KTF++          EIDRL E++ SR +D+P    + +  + P        
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Query:  IQEGSPK-----FRAQDGISSH-------VVPTQVMRANVLDEDV------ASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHK--------FGDSFASENLSK
        ++EG+ K      +A++ I            PT + ++ +LD D        SPAE+AKAYMG +   ++     + + K         G S  +   SK
Subjt:  IQEGSPK-----FRAQDGISSH-------VVPTQVMRANVLDEDV------ASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHK--------FGDSFASENLSK

Query:  SSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRS-ALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDD--EMGH
         SA       PG     ++GF TP+SR  S  L N  R PYS    ++S       +   +    SS  L+      L S   +++RR   L    + G 
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Query:  VGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLYSRS-LSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEK
         GP RR R  +     +  S P            S  A +F+++ +   S +      SRS ++      E +V   +    +P  SS++A  IL+ LE+
Subjt:  VGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLYSRS-LSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEK

Query:  L---TPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSND
            + PK+K+++LKL +   +  +  +            +D  S+K  E++++I S +
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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TCTGAGAAACTCTGCTGGAAACGGATGGCTCTCTAAGCTTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTCATCACCTCCAGTGCACATAGGCTGTTTTCTAGTGTGTTTCGTAAACGTA
TTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCCGTTTCTCGAGAGGCTAATGATGAGATGGGAAATGAGAACCATGAAGAAGTTGCAGCTGATCTCCCTGGAACTCAAGAAGGGACG
AACCACGATTTTGGTCCGAGTATCAAAACTGATAACACACATGGGGTGACTGACCTTGAGCAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGGCAAGTATTTGAGTGTTTGTT
GGTTAAATTTGAGATTGATCGCTTGACTGAACTTTTGAAATCAAGAGTTGTTGATGTTCCAAGTGGGGCTGAAGAGAGGAAATTTGAACAGGCCCCTTCTACGCCTGTTA
TCAGTTATGAAATACAGGAAGGATCTCCAAAATTTCGAGCTCAAGATGGAATTAGCTCTCACGTGGTTCCAACTCAAGTTATGAGAGCAAATGTCCTTGATGAGGATGTT
GCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCATACATGGGCAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGCGTCCCATAGTCACAAGTTTGGGGATAGTTTTGCTTCAGA
AAATCTCTCGAAATCCTCTGCTTTAACTCTTGTGCCGAGATCTCCTGGAAATTTTGATGTTATTGAAAATGGTTTTGTCACCCCAAGATCTCGAGGCAGATCTGCTCTGT
ACAATATGGCTCGAATGCCATATTCCGGAGTTAGTGCAACCCATAGCATAAAGAATAGTGTAGCGACAACAGATGCTTACAGGGCAACAGGGTCCTCATCATCTCAGTTA
GCATGGGAGCGAGGGAGAGTTCTGGGGTCTAAACAAGGGGCTTTAAAACGCAGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATGGGACATGTTGGTCCTATTCGTAGACTTCGTCA
CAAATCCAATCTCCTTTACCCAACAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTAAGTGGAATTGGTTCTGAGAATGCCCAGCAGTTTCAGTCTACAAAAG
TGCATCCATTTTCATCTTCTTCTGGGAAGGGACTTTATTCGCGTAGTTTGTCCAAACGGTCTGCAGAGTCCGAAAATGATGTGAAACCTAGTTCAAGTTTTTCTCAAATT
CCTCTCAGGTCAAGTGAGATGGCCTCAAAAATACTCGAGCAGCTTGAGAAATTGACCCCTCCAAAGGATAAGTCTTCGAAACTAAAGCTGCTTAGTGTGACGAATAACTC
ACCCACAAAGTTGTCGCCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTGGATTCATCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGACATTCAGTCTAATGATG
CCCGGGAGCTTACTTCTCAAAAGAACAACAAGGTTGAGGAAAGCAGTTCATTAAAATATAAATTACCCATTAATAAGGAAATTTCTGCAGGTGATGGATTAGGTTCTCCA
GTTCCTACGAAGGACACCGTACTTAGTTCTCGTCCGCAAGTTTCATTCGTTGGTGCTTCCCCACAAACAAAATGTGCTTTCCAAATGAGTGCACATGAGGATTTTGTAGA
TATTGATGAAGAAGGATGTTCTAATGGGCCAGTGACTGATATATCGTTTGATAGGCGAGAAAAAATGGATGGCTCATTAGTGGCAATGAGCAAGCCGAGTGATACTGAAG
CCATCACAGTAGATAAGCCTCAGGCTTCAGCTGAGGTTAAACCATCCACTGTATCTGAACTGAACAAAATAAATGGCCAGAGAAAATCTGATGTTCCTGTGACTGCTGTG
AAGAGCCCCATCTTTTCCTTTGCTACAGCATCTCCACCTAGCATTACAACCAATGCAAAAGATCCTGAATCAACCTTGAGACCTGAAAAAAATATTTCACCTGAGGCCCC
AAAGCCCGCTAATGCCCCTATATTTGGCTTTGGAGATAAGCTGCCATCACAAAAGGAATCATTTTCTTCTGCTCCCACCTTTGCGTTTGGAAACAAGTTTGCCCCCTCAA
CGAATGAACAAAATGCTGTTCCTGTTGCAACTTCTGAAAGCAATGTTGCACCAGGAAAAGCTACATTTCCTATTCCTGCAAATGCTGCCACAGAAAATGGAAATAAGAAT
ACAGGGTCTCCGTTTAAATTTGCATCGCCTTTAGTCAATGAAAAAGAAAGTGCTAAAGGGGGCAGCTCTTCGGTTTCTAAAGCGGAGAGTAATAGTAGCAGCATCCTGTC
ATTTGGAGTTCCAAAAGAGTCCATGTCAGACAAAGCTGGTGATAAGAGTTCGAGTGCTGGTCTCTCGGTTGGTACATCTGAGAATTTGTTTTCGTCATCTGTCTCGACAT
CGACATCAGCTCCCAGCTTATTTTCCTTCAGCTCCCCTAGCACTAATTCAAATCTTAATAATGGATCTCTTGTTTCTACCCCATCTATATTTTCCTCCCCAGCCACCACC
TTTTCGAATAATATAACAAATCAAAATCCATCCATCAAACCGTCCCTCACTGCTGCCCCTAGCAACGGCGAACCCGCCACCACTACTAGCCTTTCTATGCCTTCTCCTGT
GCCATCTTTTTCAGCTGCACCTATTTTCAAATTTGGGAGCCCTAGTGTTCCTTCATCTTCCGCTCCAGCTCTATCAGCAGCGGAAACCAAGACCAAGCAAGAGACAACCT
TTGGTAATTTAAGTGGCATTCCTCCAAGCGACACGTCTGCTGCTAAAGTATCTAGTACTGGAGGCAGCGTTTTTCAATTTGGAGCTGCAGCTACTACAGATTCTAATAAA
CGACCAGAAAATTCGACTTCTGCTTCAGGCAATGTCCCTACATTTGGTGCTCCGGTTTTTCCTGCTAATAGTGGGGTTGCATCTTCTACTCAGAGTACACCTGTTTTGCC
ATTCAGTTCATCATCTACATCATTTGGTTTGGCTGCGAATACGGGTTTGTCTTCTGGCAGTTCTCTGTTTGGTTCTTCAGCTCCAGCGTCGAATTTGTTCTCTTCTGGCA
CGACGTTTGGGCTTACTGGTACAAGTTCTTCTGCTAATAATTCTGTCAGCTCTGGTGCTGGTACCAGCTCTAGCTTCTTTAACTGGCAGACATCCTCCACGCCATCATTT
TCCACTGGATTCGGCTCAACTCCAACTGGAGGGTTCCCTTTTGGTCTTTCATCTTCTTCCGCTGCTTCTAATAGTTCACCTATGCTCTTTGGGTCATCAACAACTAGTGC
ATCGACAACGTCAATGTTCTCATTTACTTCCGCTGCATCGTCACAGCCTGCTTTCGGTAATTCTAATCATGGCTTCACTTTTGGTTCAACTCCCCCTGCCAATAATGATC
AAGCAAATATGGAGGATAGCATGGCTGAGGATACCATCCAGGCAGTCACGCTGCCTACGCCTACTTTTGGGCAACAGCCCCTTACACCACCTCCATCATCAGGGTTTATG
TTTGGTTCAGCGGCCCCTCCTCCGGTAGCAGCAAGTCCTTTCCAGTTCGGCAGCCAGCAAAATGCACCTGCCCCACAAAATCCCTCTCCATTTCAGGCGTCTGGTAGCTT
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mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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GAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGGCCGCCGACTGCTCTGAGAAACTCTGCTGGAAACGGATGGCTCTCTAAGCTTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTCATCACCTCC
AGTGCACATAGGCTGTTTTCTAGTGTGTTTCGTAAACGTATTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCCGTTTCTCGAGAGGCTAATGATGAGATGGGAAATGAGAACCATGA
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AGGAGAAGACCTTTACAAGGCAAGTATTTGAGTGTTTGTTGGTTAAATTTGAGATTGATCGCTTGACTGAACTTTTGAAATCAAGAGTTGTTGATGTTCCAAGTGGGGCT
GAAGAGAGGAAATTTGAACAGGCCCCTTCTACGCCTGTTATCAGTTATGAAATACAGGAAGGATCTCCAAAATTTCGAGCTCAAGATGGAATTAGCTCTCACGTGGTTCC
AACTCAAGTTATGAGAGCAAATGTCCTTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCATACATGGGCAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGG
CGTCCCATAGTCACAAGTTTGGGGATAGTTTTGCTTCAGAAAATCTCTCGAAATCCTCTGCTTTAACTCTTGTGCCGAGATCTCCTGGAAATTTTGATGTTATTGAAAAT
GGTTTTGTCACCCCAAGATCTCGAGGCAGATCTGCTCTGTACAATATGGCTCGAATGCCATATTCCGGAGTTAGTGCAACCCATAGCATAAAGAATAGTGTAGCGACAAC
AGATGCTTACAGGGCAACAGGGTCCTCATCATCTCAGTTAGCATGGGAGCGAGGGAGAGTTCTGGGGTCTAAACAAGGGGCTTTAAAACGCAGAAGCTCAGTTTTAGATG
ATGAAATGGGACATGTTGGTCCTATTCGTAGACTTCGTCACAAATCCAATCTCCTTTACCCAACAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTAAGTGGA
ATTGGTTCTGAGAATGCCCAGCAGTTTCAGTCTACAAAAGTGCATCCATTTTCATCTTCTTCTGGGAAGGGACTTTATTCGCGTAGTTTGTCCAAACGGTCTGCAGAGTC
CGAAAATGATGTGAAACCTAGTTCAAGTTTTTCTCAAATTCCTCTCAGGTCAAGTGAGATGGCCTCAAAAATACTCGAGCAGCTTGAGAAATTGACCCCTCCAAAGGATA
AGTCTTCGAAACTAAAGCTGCTTAGTGTGACGAATAACTCACCCACAAAGTTGTCGCCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTGGATTCATCT
AAGTATTTGGAAAATGTTGAAGACATTCAGTCTAATGATGCCCGGGAGCTTACTTCTCAAAAGAACAACAAGGTTGAGGAAAGCAGTTCATTAAAATATAAATTACCCAT
TAATAAGGAAATTTCTGCAGGTGATGGATTAGGTTCTCCAGTTCCTACGAAGGACACCGTACTTAGTTCTCGTCCGCAAGTTTCATTCGTTGGTGCTTCCCCACAAACAA
AATGTGCTTTCCAAATGAGTGCACATGAGGATTTTGTAGATATTGATGAAGAAGGATGTTCTAATGGGCCAGTGACTGATATATCGTTTGATAGGCGAGAAAAAATGGAT
GGCTCATTAGTGGCAATGAGCAAGCCGAGTGATACTGAAGCCATCACAGTAGATAAGCCTCAGGCTTCAGCTGAGGTTAAACCATCCACTGTATCTGAACTGAACAAAAT
AAATGGCCAGAGAAAATCTGATGTTCCTGTGACTGCTGTGAAGAGCCCCATCTTTTCCTTTGCTACAGCATCTCCACCTAGCATTACAACCAATGCAAAAGATCCTGAAT
CAACCTTGAGACCTGAAAAAAATATTTCACCTGAGGCCCCAAAGCCCGCTAATGCCCCTATATTTGGCTTTGGAGATAAGCTGCCATCACAAAAGGAATCATTTTCTTCT
GCTCCCACCTTTGCGTTTGGAAACAAGTTTGCCCCCTCAACGAATGAACAAAATGCTGTTCCTGTTGCAACTTCTGAAAGCAATGTTGCACCAGGAAAAGCTACATTTCC
TATTCCTGCAAATGCTGCCACAGAAAATGGAAATAAGAATACAGGGTCTCCGTTTAAATTTGCATCGCCTTTAGTCAATGAAAAAGAAAGTGCTAAAGGGGGCAGCTCTT
CGGTTTCTAAAGCGGAGAGTAATAGTAGCAGCATCCTGTCATTTGGAGTTCCAAAAGAGTCCATGTCAGACAAAGCTGGTGATAAGAGTTCGAGTGCTGGTCTCTCGGTT
GGTACATCTGAGAATTTGTTTTCGTCATCTGTCTCGACATCGACATCAGCTCCCAGCTTATTTTCCTTCAGCTCCCCTAGCACTAATTCAAATCTTAATAATGGATCTCT
TGTTTCTACCCCATCTATATTTTCCTCCCCAGCCACCACCTTTTCGAATAATATAACAAATCAAAATCCATCCATCAAACCGTCCCTCACTGCTGCCCCTAGCAACGGCG
AACCCGCCACCACTACTAGCCTTTCTATGCCTTCTCCTGTGCCATCTTTTTCAGCTGCACCTATTTTCAAATTTGGGAGCCCTAGTGTTCCTTCATCTTCCGCTCCAGCT
CTATCAGCAGCGGAAACCAAGACCAAGCAAGAGACAACCTTTGGTAATTTAAGTGGCATTCCTCCAAGCGACACGTCTGCTGCTAAAGTATCTAGTACTGGAGGCAGCGT
TTTTCAATTTGGAGCTGCAGCTACTACAGATTCTAATAAACGACCAGAAAATTCGACTTCTGCTTCAGGCAATGTCCCTACATTTGGTGCTCCGGTTTTTCCTGCTAATA
GTGGGGTTGCATCTTCTACTCAGAGTACACCTGTTTTGCCATTCAGTTCATCATCTACATCATTTGGTTTGGCTGCGAATACGGGTTTGTCTTCTGGCAGTTCTCTGTTT
GGTTCTTCAGCTCCAGCGTCGAATTTGTTCTCTTCTGGCACGACGTTTGGGCTTACTGGTACAAGTTCTTCTGCTAATAATTCTGTCAGCTCTGGTGCTGGTACCAGCTC
TAGCTTCTTTAACTGGCAGACATCCTCCACGCCATCATTTTCCACTGGATTCGGCTCAACTCCAACTGGAGGGTTCCCTTTTGGTCTTTCATCTTCTTCCGCTGCTTCTA
ATAGTTCACCTATGCTCTTTGGGTCATCAACAACTAGTGCATCGACAACGTCAATGTTCTCATTTACTTCCGCTGCATCGTCACAGCCTGCTTTCGGTAATTCTAATCAT
GGCTTCACTTTTGGTTCAACTCCCCCTGCCAATAATGATCAAGCAAATATGGAGGATAGCATGGCTGAGGATACCATCCAGGCAGTCACGCTGCCTACGCCTACTTTTGG
GCAACAGCCCCTTACACCACCTCCATCATCAGGGTTTATGTTTGGTTCAGCGGCCCCTCCTCCGGTAGCAGCAAGTCCTTTCCAGTTCGGCAGCCAGCAAAATGCACCTG
CCCCACAAAATCCCTCTCCATTTCAGGCGTCTGGTAGCTTAGACTTCAATGCCAGTGCTGGAGGGAGCTTCTCATTAGGTGCGGGTGGCGGTGACAAAGCGAACCGAAAA
TACGTGAAAGTTAAAAGCAAATCACGAAAGAAGTAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSREANDEMGNENHEEVAADLPGTQEGT
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Carg15847 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome