; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15893 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15893
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionCRC domain-containing protein TSO1-like
Genome locationCarg_Chr08:6948601..6949964
RNA-Seq ExpressionCarg15893
SyntenyCarg15893
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR044522 - CRC domain-containing protein TSO1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593881.1 CRC domain-containing protein TSO1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.4e-14699.63Show/hide
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KAG7026226.1 CRC domain-containing protein TSO1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.1e-159100Show/hide
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XP_022999801.1 protein tesmin/TSO1-like CXC 2 [Cucurbita maxima]1.9e-14297.06Show/hide
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XP_023514922.1 CRC domain-containing protein TSO1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-14197.06Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNU4 CRC domain-containing protein5.0e-8063.9Show/hide
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        SSSSFR TLP IGLHLNA+AATLKH   +N+      S PSSSA I + NS  DQ L+ASS  E ENP  E ANL GE ++  NPK N   MENA +GAC
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A0A1S3BP37 CRC domain-containing protein TSO12.4e-8264.95Show/hide
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        A   STP + P E+V+ DAGEV      IS+EA E   +     +C  D+   NK L NLQSGNM RRCLDFEMAG PN+A      GD SI   SSSSS
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        SS R TLPGIGLHLN++AATLK+   +NL      S PSSSASI + NS +DQ L+ASS  + ENP  E ANL GE LN INPKKN  LMENA IGACKR
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A0A5D3E4C7 CRC domain-containing protein TSO12.4e-8264.95Show/hide
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A0A6J1ER31 CRC domain-containing protein TSO1-like3.2e-14397.45Show/hide
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A0A6J1KE48 protein tesmin/TSO1-like CXC 29.3e-14397.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JIF5 Protein tesmin/TSO1-like CXC 22.5e-1529.89Show/hide
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                                VP  PT  +DGS    GM+                 ES+           +PDA E                   G
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        +  + M+  S++ E E+ ++   + +  L  G + RRCLDFEM G   T+         S   +++  SS RC +P IGLHLNAI  + K    N++   
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        S SA+I      S +++QD      +    +     P     + LNL +PKK    +++ E  +CKRCNCKKSKCLKL
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Q8L548 Protein tesmin/TSO1-like CXC 34.8e-1129.29Show/hide
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          ++ +  + ++  SD  + E                                              N D   N+      L++    + RRCLDFE+ G
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Query:  TPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAIAATLKHENLSHP-SSSASISSPNSIQDQPLMASSATEI-ENPSHE---------PANLNG
          N   T          G SSSS    C +P IGLHLN IA + K +N+++  S S +I         P++ S    + EN S +         P +L  
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         +L  I+PKK     E +  G  +CKRCNCKKSKCLKL
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Q9LUI3 CRC domain-containing protein TSO16.5e-1630.3Show/hide
Query:  QDSPVFNFINSLSPIKPLKSIHITQTFNSISFPS-LPVFTSP-----KRPNF---PNPSRSSPPVSSNEGTVI---IMDQLLEIF---------------
        +DSPVFN+I++LSPI+ +KSI   QTF+S+SF S  PVFTSP     +   F    N    S  + S +G+ +   ++  L+E                 
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Query:  ----VPEIPTADDGSTPGMQPP--------ESVNPDAGEVGISSEAMELG--------------------SDEAE-------------------------
            +P+I   D  ++     P         S +P  G+ G SSE + +G                    SD  E                         
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Query:  ------------------DENCDSFGNKPL---------LNLQSGNMPRRCLDFEMAG--TPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAI
                            N  S  N+PL          NL  G M RRCLDFEM G    +      +  D ++ G SSSS    C +PGIGLHLNA+
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Query:  AATLKHENLS--HPSS------SASISSPNSIQDQPLMASSATEIENPSHE--PANLNGENLNLINPKKNGTLMENAEIG-ACKRCNCKKSKCLKL
        A + K  N+S  H  S       +   S   IQ Q  +  ++ + EN   E  P  L    LNL + KK     E A  G +CKRCNCKKSKCLKL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G22760.1 Tesmin/TSO1-like CXC domain-containing protein3.4e-1229.29Show/hide
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          ++ +  + ++  SD  + E                                              N D   N+      L++    + RRCLDFE+ G
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Query:  TPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAIAATLKHENLSHP-SSSASISSPNSIQDQPLMASSATEI-ENPSHE---------PANLNG
          N   T          G SSSS    C +P IGLHLN IA + K +N+++  S S +I         P++ S    + EN S +         P +L  
Subjt:  TPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAIAATLKHENLSHP-SSSASISSPNSIQDQPLMASSATEI-ENPSHE---------PANLNG

Query:  ENLNLINPKKNGTLMENAEIG--ACKRCNCKKSKCLKL
         +L  I+PKK     E +  G  +CKRCNCKKSKCLKL
Subjt:  ENLNLINPKKNGTLMENAEIG--ACKRCNCKKSKCLKL

AT3G22780.1 Tesmin/TSO1-like CXC domain-containing protein4.6e-1730.3Show/hide
Query:  QDSPVFNFINSLSPIKPLKSIHITQTFNSISFPS-LPVFTSP-----KRPNF---PNPSRSSPPVSSNEGTVI---IMDQLLEIF---------------
        +DSPVFN+I++LSPI+ +KSI   QTF+S+SF S  PVFTSP     +   F    N    S  + S +G+ +   ++  L+E                 
Subjt:  QDSPVFNFINSLSPIKPLKSIHITQTFNSISFPS-LPVFTSP-----KRPNF---PNPSRSSPPVSSNEGTVI---IMDQLLEIF---------------

Query:  ----VPEIPTADDGSTPGMQPP--------ESVNPDAGEVGISSEAMELG--------------------SDEAE-------------------------
            +P+I   D  ++     P         S +P  G+ G SSE + +G                    SD  E                         
Subjt:  ----VPEIPTADDGSTPGMQPP--------ESVNPDAGEVGISSEAMELG--------------------SDEAE-------------------------

Query:  ------------------DENCDSFGNKPL---------LNLQSGNMPRRCLDFEMAG--TPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAI
                            N  S  N+PL          NL  G M RRCLDFEM G    +      +  D ++ G SSSS    C +PGIGLHLNA+
Subjt:  ------------------DENCDSFGNKPL---------LNLQSGNMPRRCLDFEMAG--TPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAI

Query:  AATLKHENLS--HPSS------SASISSPNSIQDQPLMASSATEIENPSHE--PANLNGENLNLINPKKNGTLMENAEIG-ACKRCNCKKSKCLKL
        A + K  N+S  H  S       +   S   IQ Q  +  ++ + EN   E  P  L    LNL + KK     E A  G +CKRCNCKKSKCLKL
Subjt:  AATLKHENLS--HPSS------SASISSPNSIQDQPLMASSATEIENPSHE--PANLNGENLNLINPKKNGTLMENAEIG-ACKRCNCKKSKCLKL

AT4G14770.1 TESMIN/TSO1-like CXC 21.7e-1629.89Show/hide
Query:  QDSPVFNFINSLSPIKPLKSIHITQTFNSISFPSLP-VFTSPKRPNFPNPSR--------SSPPVSSNEGT-------------------VIIMDQLLE-
        +DSPVFN+INSLSPI+P++SI     F+S++F S P VFTSP   +    SR        SS P +S E                     + I D + E 
Subjt:  QDSPVFNFINSLSPIKPLKSIHITQTFNSISFPSLP-VFTSPKRPNFPNPSR--------SSPPVSSNEGT-------------------VIIMDQLLE-

Query:  ----------------------IFVPEIPT-ADDGSTP--GMQPP---------------ESV-----------NPDAGEV------------------G
                                VP  PT  +DGS    GM+                 ES+           +PDA E                   G
Subjt:  ----------------------IFVPEIPT-ADDGSTP--GMQPP---------------ESV-----------NPDAGEV------------------G

Query:  ISSEAMELGSDEAEDENCDSFGNKPLLNLQSGNMPRRCLDFEMAGTPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAIAATLK--HENLSHP-
        +  + M+  S++ E E+ ++   + +  L  G + RRCLDFEM G   T+         S   +++  SS RC +P IGLHLNAI  + K    N++   
Subjt:  ISSEAMELGSDEAEDENCDSFGNKPLLNLQSGNMPRRCLDFEMAGTPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAIAATLK--HENLSHP-

Query:  SSSASIS-----SPNSIQDQPLMASSATEIENPSHEPANLNGENLNLINPKKNGTLMENAEIGACKRCNCKKSKCLKL
        S SA+I      S +++QD      +    +     P     + LNL +PKK    +++ E  +CKRCNCKKSKCLKL
Subjt:  SSSASIS-----SPNSIQDQPLMASSATEIENPSHEPANLNGENLNLINPKKNGTLMENAEIGACKRCNCKKSKCLKL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GTGAAGCTTCGAGATCTGGTTAAGAACTTGTTAATTTTGCATTTTAATTTAACGAAATTCTCTAATTTACTGCAGGATTCCCCCGTTTTCAACTTCATTAACAGCCTCTC
ACCCATCAAGCCTCTGAAATCCATCCACATTACTCAAACATTCAACTCCATTTCCTTCCCTTCCCTTCCAGTTTTCACTTCCCCCAAAAGGCCGAATTTTCCCAACCCAT
CAAGATCCTCCCCACCAGTTTCTTCAAATGAAGGAACTGTTATAATAATGGATCAGTTACTCGAGATTTTCGTGCCGGAAATTCCTACCGCCGACGACGGTTCTACTCCC
GGAATGCAGCCGCCGGAGTCTGTCAATCCCGACGCCGGTGAGGTTGGGATTAGCTCAGAAGCTATGGAGTTGGGGAGTGATGAAGCCGAAGATGAGAATTGTGATTCGTT
TGGAAACAAGCCTCTCCTTAACCTACAGAGCGGGAACATGCCGAGGCGATGTCTAGATTTCGAAATGGCGGGAACGCCCAACACGGCGGCGACGGCCACGGCGGGTGGCG
ATGGTTCAATCCGCGGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTTCGATGCACTTTGCCTGGAATCGGTTTGCACTTGAATGCTATTGCAGCGACTTTGAAGCATGAGAATCTA
AGTCATCCCAGCTCTTCGGCATCTATTTCTAGTCCTAATTCCATTCAAGATCAACCTCTTATGGCTTCATCGGCTACTGAAATTGAAAACCCTTCTCATGAACCTGCGAA
TCTGAATGGGGAAAATCTCAATCTCATCAACCCTAAAAAGAATGGGACATTGATGGAAAATGCTGAAATTGGGGCGTGTAAACGTTGTAACTGTAAGAAATCTAAGTGTT
TGAAGCTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGAAGCTTCGAGATCTGGTTAAGAACTTGTTAATTTTGCATTTTAATTTAACGAAATTCTCTAATTTACTGCAGGATTCCCCCGTTTTCAACTTCATTAACAGCCTCTC
ACCCATCAAGCCTCTGAAATCCATCCACATTACTCAAACATTCAACTCCATTTCCTTCCCTTCCCTTCCAGTTTTCACTTCCCCCAAAAGGCCGAATTTTCCCAACCCAT
CAAGATCCTCCCCACCAGTTTCTTCAAATGAAGGAACTGTTATAATAATGGATCAGTTACTCGAGATTTTCGTGCCGGAAATTCCTACCGCCGACGACGGTTCTACTCCC
GGAATGCAGCCGCCGGAGTCTGTCAATCCCGACGCCGGTGAGGTTGGGATTAGCTCAGAAGCTATGGAGTTGGGGAGTGATGAAGCCGAAGATGAGAATTGTGATTCGTT
TGGAAACAAGCCTCTCCTTAACCTACAGAGCGGGAACATGCCGAGGCGATGTCTAGATTTCGAAATGGCGGGAACGCCCAACACGGCGGCGACGGCCACGGCGGGTGGCG
ATGGTTCAATCCGCGGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTTCGATGCACTTTGCCTGGAATCGGTTTGCACTTGAATGCTATTGCAGCGACTTTGAAGCATGAGAATCTA
AGTCATCCCAGCTCTTCGGCATCTATTTCTAGTCCTAATTCCATTCAAGATCAACCTCTTATGGCTTCATCGGCTACTGAAATTGAAAACCCTTCTCATGAACCTGCGAA
TCTGAATGGGGAAAATCTCAATCTCATCAACCCTAAAAAGAATGGGACATTGATGGAAAATGCTGAAATTGGGGCGTGTAAACGTTGTAACTGTAAGAAATCTAAGTGTT
TGAAGCTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
VKLRDLVKNLLILHFNLTKFSNLLQDSPVFNFINSLSPIKPLKSIHITQTFNSISFPSLPVFTSPKRPNFPNPSRSSPPVSSNEGTVIIMDQLLEIFVPEIPTADDGSTP
GMQPPESVNPDAGEVGISSEAMELGSDEAEDENCDSFGNKPLLNLQSGNMPRRCLDFEMAGTPNTAATATAGGDGSIRGSSSSSSSFRCTLPGIGLHLNAIAATLKHENL
SHPSSSASISSPNSIQDQPLMASSATEIENPSHEPANLNGENLNLINPKKNGTLMENAEIGACKRCNCKKSKCLKL