; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15943 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15943
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr08:7270346..7270936
RNA-Seq ExpressionCarg15943
SyntenyCarg15943
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575030.1 hypothetical protein SDJN03_25669, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-8286.73Show/hide
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KAG6593932.1 hypothetical protein SDJN03_13408, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-99100Show/hide
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XP_022930480.1 uncharacterized protein LOC111436920 [Cucurbita moschata]9.6e-9898.98Show/hide
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XP_023000029.1 uncharacterized protein LOC111494337 [Cucurbita maxima]8.4e-9495.92Show/hide
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XP_023514741.1 uncharacterized protein LOC111778959 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-9697.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCP9 Uncharacterized protein3.5e-7782.5Show/hide
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A0A1S3C7J3 uncharacterized protein LOC1034979046.3e-7983.5Show/hide
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A0A5A7SWA1 Uncharacterized protein6.3e-7983.5Show/hide
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A0A6J1EX01 uncharacterized protein LOC1114369204.6e-9898.98Show/hide
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A0A6J1KIS0 uncharacterized protein LOC1114943374.1e-9495.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G25250.1 unknown protein1.3e-0429.79Show/hide
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        P + K+ ++N+   S S   S       +      +V IL+RGE ++ K   E    +++        ++G  P  +   IRI + +      A  YAG 
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          S SP PS +PLP+F   K V+      AT DL ++LRLD
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AT3G21570.1 unknown protein1.2e-1334.67Show/hide
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        MGTEI+RPQ+CL  R+                 DS    +NSR N        +P+QR+RF              S++ +  T ++V       R+GES 
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        DS +  +  K                                P V   D+YAGS+ F++SP+PSSLPLPSFSKKK  S +V    DDSA++DLRRLLRL
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AT4G02040.1 unknown protein1.2e-0530.14Show/hide
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        +Y+S+++R           + R   N S     ++ S     S     +LVME V IL+RGE+L +            T+   LK   D +L+V  T R+
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        GP PE+++KQI  + ++         +AG+  S+SP PS +P+P F
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AT4G32020.1 unknown protein5.2e-0930.85Show/hide
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        MG  +L PQDCLK           P     R++ +  N+ +      S+S+R S+     P    R   +   P  + + S       +N++ +  V IL
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        +RGE +  +T    L  E  +L    T R+GP P ++  QIR+   +      A  YAG     SP PS +PLP+F  KK         AT DL R+LRL
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Query:  D
        D
Subjt:  D


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGACTGAGATTCTACGACCTCAGGATTGTTTGAAAGGAAGGATCGGAGTTCCACTGGTGGCCTTTTGTCGTCGCCGGGGTTCTTATGGAAACTCTGATTCGAATGT
TTATAACTATAATTCTAGATCCAACCGGAAATCTGCGGCTAGGTCGGATAGGCCGGAGCAGCGGAAACGGTTTGTTTCGAATCAATCAGAGCCATCGGTCTCGAAGAGAT
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AAGGAAGCTGATAATCTGGTCGTGTGTGGGACCGAGAGGTTGGGGCCGGCGCCGGAAATGGTACTGAAGCAGATCCGGATCGTCGACGTTAGGTGTCCGATTGTTGGAAA
AGCCGATGTTTACGCCGGATCAGCGTTTTCGATGTCTCCATCTCCTAGTTCTCTTCCATTACCGTCGTTCTCGAAGAAGAAACAGGTATCCACCATCGTTGACGACTCGG
CCACAAGAGATCTGAGGCGTTTGCTTCGTCTCGACGCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGACTGAGATTCTACGACCTCAGGATTGTTTGAAAGGAAGGATCGGAGTTCCACTGGTGGCCTTTTGTCGTCGCCGGGGTTCTTATGGAAACTCTGATTCGAATGT
TTATAACTATAATTCTAGATCCAACCGGAAATCTGCGGCTAGGTCGGATAGGCCGGAGCAGCGGAAACGGTTTGTTTCGAATCAATCAGAGCCATCGGTCTCGAAGAGAT
CGAGTTCCGAGGATTCGAAGATCAGGACGAATAGTTTGGTGATGGAAAATGTTACGATCTTGAGGCGAGGTGAATCGCTCGATTCGAAGACGAAGGGCGAAGCTCTGAAG
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CCACAAGAGATCTGAGGCGTTTGCTTCGTCTCGACGCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTEILRPQDCLKGRIGVPLVAFCRRRGSYGNSDSNVYNYNSRSNRKSAARSDRPEQRKRFVSNQSEPSVSKRSSSEDSKIRTNSLVMENVTILRRGESLDSKTKGEALK
KEADNLVVCGTERLGPAPEMVLKQIRIVDVRCPIVGKADVYAGSAFSMSPSPSSLPLPSFSKKKQVSTIVDDSATRDLRRLLRLDA