; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg15991 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg15991
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRab family
Genome locationCarg_Chr07:2418573..2421057
RNA-Seq ExpressionCarg15991
SyntenyCarg15991
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143465.1 ras-related protein RABH1e [Cucumis sativus]8.3e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS +EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022132839.1 ras-related protein RABH1e [Momordica charantia]7.0e-10798.07Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS  EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022950086.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita moschata]2.8e-10899.52Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022962792.1 ras-related protein RABH1e-like [Cucurbita moschata]3.4e-109100Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_023003400.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita maxima]7.5e-10999.52Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGR9 Uncharacterized protein4.0e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS +EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1GDU2 ras-related protein RABH1e1.4e-10899.52Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1HDJ2 ras-related protein RABH1e-like1.6e-109100Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1IN20 ras-related protein RABH1e-like1.6e-109100Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1KRN2 ras-related protein RABH1e3.6e-10999.52Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b5.2e-9787.02Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++RQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSHTE
        TKWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE +AK+RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK +  N+S  +
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSHTE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A1.4e-8173.4Show/hide
Query:  SPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWI
        +PL K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAVVVYD++N  SF  TTKWI
Subjt:  SPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWI

Query:  EEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQQGGG
        ++VRTERGSDVII+LVGNKTDL +KRQVSIEEG+ K++E  VMFIETSAKAG+N+K LFR++AAALPGME+     +EDM+D+ L+       +E   GG
Subjt:  EEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQQGGG

Query:  CAC
        C+C
Subjt:  CAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e2.4e-10290.34Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        +KWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGD K+R++GV+FIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK + NS+  EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d2.3e-10088.89Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        +KWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGD+K RE+GVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T+ EDMVDVNLKP  NSS  +Q
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c6.2e-9080.84Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNRQ+FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSHT
        +KWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EG+ K +E+GVMFIETSAK  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK   NSS  
Subjt:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSHT

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D1.6e-10188.89Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        +KWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGD+K RE+GVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T+ EDMVDVNLKP  NSS  +Q
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein3.7e-9887.02Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++RQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSHTE
        TKWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE +AK+RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK +  N+S  +
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSHTE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C4.4e-9180.84Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNRQ+FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSHT
        +KWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EG+ K +E+GVMFIETSAK  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK   NSS  
Subjt:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSHT

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E1.7e-10390.34Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ
        +KWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGD K+R++GV+FIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK + NS+  EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A1.4e-8176.88Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFDT+YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAV+VYDV+++QSF+NT+KWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSH-TEQQGGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVSIEEG+ K+REFG +F+ETSAKAGFNIKPLF KI +AL G E +S T+QED+VDVNLKP + SS    QQ   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSH-TEQQGGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGATCAATCCGTTGGCAAAACTAGCATTATCACCCGCTTCATGTACGACAAGTTTGATACCAC
CTATCAGGCTACAATTGGAATCGACTTTTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGACCGAACAATTCGGTTGCAGCTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGATTTAGGAGTC
TTATTCCAAGTTATATAAGAGATTCCTCTGTCGCAGTAGTAGTCTATGATGTATCTAATAGACAATCATTCTTGAATACTACCAAGTGGATTGAGGAGGTACGAACAGAA
CGGGGCAGTGATGTGATAATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGAGAAAAGGCAAGTTTCAATCGAAGAAGGTGATGCCAAATCTCGCGAGTTTGGAGTCAT
GTTCATAGAAACTAGTGCCAAAGCTGGCTTCAACATCAAGCCTCTCTTCCGTAAGATTGCTGCAGCGCTGCCAGGGATGGAAACTCTGTCTTCTACAAGGCAGGAGGACA
TGGTTGACGTAAATTTGAAGCCTGCAGTGAATTCATCCCATACGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCGTGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGATCAATCCGTTGGCAAAACTAGCATTATCACCCGCTTCATGTACGACAAGTTTGATACCAC
CTATCAGGCTACAATTGGAATCGACTTTTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGACCGAACAATTCGGTTGCAGCTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGATTTAGGAGTC
TTATTCCAAGTTATATAAGAGATTCCTCTGTCGCAGTAGTAGTCTATGATGTATCTAATAGACAATCATTCTTGAATACTACCAAGTGGATTGAGGAGGTACGAACAGAA
CGGGGCAGTGATGTGATAATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGAGAAAAGGCAAGTTTCAATCGAAGAAGGTGATGCCAAATCTCGCGAGTTTGGAGTCAT
GTTCATAGAAACTAGTGCCAAAGCTGGCTTCAACATCAAGCCTCTCTTCCGTAAGATTGCTGCAGCGCTGCCAGGGATGGAAACTCTGTCTTCTACAAGGCAGGAGGACA
TGGTTGACGTAAATTTGAAGCCTGCAGTGAATTCATCCCATACGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCGTGCTAGAGGATATGTAAGTTCAATACATAAGAAAAATGCTGC
AGAAATGAAATAGTAAACGCAATCATTCACCGGTGAGTTAGTTCAACAAATTGACATCCGAAATTTTCTAACGATAAGATGTTTGTAATATTGTATGCCATTAGATTCTT
TTTGCGTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSHTEQQGGGCAC