; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16091 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16091
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionheterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
Genome locationCarg_Chr20:3213980..3216961
RNA-Seq ExpressionCarg16091
SyntenyCarg16091
Gene Ontology termsGO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR034131 - DAZ-associated protein 1, RNA recognition motif 2
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1JFM3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like1.5e-26799.37Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS-
        MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS 
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVS-

Query:  -PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY
         PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY
Subjt:  -PGPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGY

Query:  NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG
        NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG
Subjt:  NYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESG

Query:  NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL
        NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL
Subjt:  NGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTVL

Query:  PPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
        PP SSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
Subjt:  PPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O94432 Uncharacterized RNA-binding protein C660.159.7e-4644.2Show/hide
Query:  DSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPG
        + GK+F+GG++W+T +D L++YF  FGEV++  +M+D TTGR RGFGF+ F +P   + V+ ++H++DG++++ KRA+PR +Q                 
Subjt:  DSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPG

Query:  RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPK
        +T K+FVGG+    TE EF+N+F+QFG + D  +M D +T RPRGFGF+TY++E AVE  + + +  ++GK VEVKRA PK
Subjt:  RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPK

Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 13.2e-6540.23Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
        M +D GKLFVGGISW+TDED+L+E+F+ +GEV +A++M+D+ TGR RGFGF++F+DPSV DRV++EKH+ID R V+ KRA+ R +Q + GRT G++N S 
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP

Query:  GPG-----RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPL
          G     +T+KIFVGGL  T+T+ EF+ YF+ +G +TDV +MYD  T RPRGFGF+++DSE+AV+ VL KTFH+L+GK VEVKRA+PK+ +PG     +
Subjt:  GPG-----RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPL

Query:  GGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGR--FSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLN-PGYGGSSNFTNNL-NYGRGLSPYYTGNSDRFG
        GG   G         GY QGY  +    Y  RMD        S G  + +  SSGYG G  +  G N  GYG    +T +   YG G +  Y   +    
Subjt:  GGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGR--FSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLN-PGYGGSSNFTNNL-NYGRGLSPYYTGNSDRFG

Query:  NIGYESGNG---------------GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNS--------------ANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQG
          GY S  G               GN  + S A  + +G  G    T S              + S++  G+ +  G +GG        N GS G +  G
Subjt:  NIGYESGNG---------------GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNS--------------ANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQG

Query:  GGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSIGAGGYGR
         G+  + +  +  YGG    Y+ G G  G+
Subjt:  GGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSIGAGGYGR

Q96EP5 DAZ-associated protein 11.6e-4538.62Show/hide
Query:  GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGP--
        GKLFVGG+ W T ++ L+ YFS +GEVV+ VIMKD+TT + RGFGF+ F DP+    V+  + H +DGR ++ K   PR  Q    RT        GP  
Subjt:  GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGP--

Query:  --GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
           ++ KIFVGG+     E+E + YF +FG +T+VV++YD    RPRGFGFIT++ E++V++ +   FH++ GK VEVKRA P++        P G   +
Subjt:  --GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY

Query:  GQSRVNSFLNGYT--------QGY--------SSSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FSSGYGMGVNFEIGLNP
        G   V +  NG+         QGY        +   IGGYG    GR +P          VS+    F P   F  GYG    F  G  P
Subjt:  GQSRVNSFLNGYT--------QGY--------SSSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FSSGYGMGVNFEIGLNP

Q98SJ2 DAZ-associated protein 14.3e-4640.28Show/hide
Query:  GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGR-TSGSINVSPGP-
        GKLFVGG+ W T ++ L+ YFS +GEVV+ VIMKD+TT + RGFGF+ F DP+    V+  + H +DGR ++ K   PR  Q    R   G     P   
Subjt:  GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGR-TSGSINVSPGP-

Query:  -GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNYG
          R+ KIFVGG+     E+E K YF++FG +T+VV++YD    RPRGFGFIT++ E++V++ +   FH++ GK VEVKRA P++ S   +  P G   +G
Subjt:  -GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNYG

Query:  QSRVNSFLNGYT-------QGYS--------SSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FSSGYGMGVNFEIGLNP
           + S  NG+T       QGYS          TIGGYG +  GR  P          VS+    F P   F  GY     F  G  P
Subjt:  QSRVNSFLNGYT-------QGYS--------SSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FSSGYGMGVNFEIGLNP

Q9C652 RNA-binding protein 13.3e-4648.24Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRND-----------QNIV
        M  D  KLFVGGI+ +T E+ LK+YFS +G V+EAV+ K++ TG+ RGFGF+ FA+     + +R+ H I G+ V+ ++A+ +++           +  V
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRND-----------QNIV

Query:  GRTSGSINVSPGPG---RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKE
         + +G +      G   RT+KIFVGGL+S  TE EFK+YF++FG  TDVVVM+D  T RPRGFGF+TYDSE++VE V+   FHEL+ K VEVKRA+PKE
Subjt:  GRTSGSINVSPGPG---RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07810.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein8.4e-16263.93Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS
        MQ+D+GKLF+GGISWDT+E+RLKEYFS+FGEV+EAVI+KDRTTGR RGFGF+VFADP+VA+ VI EKHNIDGR+VEAK+AVPR+DQN+V R+ S SI  S
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS

Query:  P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G
        P GPGRTRKIFVGGL S+VTES+FK YF+QFGT TDVVVMYDHNT RPRGFGFITYDSEEAVEKVL+KTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG G
Subjt:  P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G

Query:  YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE
        Y+YG +RVN+ LNGY QG++ + +GGYG+RMDGRFSPV +GRS F  +SSGYGM VNF+ GL  G+ G +N+  N++YGRG+SPYY GN++RFG  +GYE
Subjt:  YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE

Query:  SGN-GGNSSFFSSATQNLWGSGG---LNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSG-NHNYGGI-DSSYSIGAGGY
         GN GGNSSFFSS T+NLWG+ G    NN   ++NSN ++G +S G       F NSGVNWG     + GGGNN  SN      YGG  +S + +G GGY
Subjt:  SGN-GGNSSFFSSATQNLWGSGG---LNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSG-NHNYGGI-DSSYSIGAGGY

Query:  -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFY--NASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNA--ASDVSSR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
          RN G     P+SSF     T+  G+D    A+FY   A Y D TWRS   E +   PF YG+G    +SDVS+R SSPG++G +SVN+RQ NRG  T
Subjt:  -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFY--NASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNA--ASDVSSR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT

AT3G07810.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.1e-16164.11Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS
        MQ+D+GKLF+GGISWDT+E+RLKEYFS+FGEV+EAVI+KDRTTGR RGFGF+VFADP+VA+ VI EKHNIDGR+VEAK+AVPR+DQN+V R+ S SI  S
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS

Query:  P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G
        P GPGRTRKIFVGGL S+VTES+FK YF+QFGT TDVVVMYDHNT RPRGFGFITYDSEEAVEKVL+KTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG G
Subjt:  P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G

Query:  YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE
        Y+YG +RVN+ LNGY QG++ + +GGYG+RMDGRFSPV +GRS F  +SSGYGM VNF+ GL  G+ G +N+  N++YGRG+SPYY GN++RFG  +GYE
Subjt:  YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE

Query:  SGN-GGNSSFFSSATQNLWGSGG---LNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSG-NHNYGGI-DSSYSIGAGGY
         GN GGNSSFFSS T+NLWG+ G    NN   ++NSN ++G +S G       F NSGVNWG     + GGGNN  SN      YGG  +S + +G GGY
Subjt:  SGN-GGNSSFFSSATQNLWGSGG---LNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSG-NHNYGGI-DSSYSIGAGGY

Query:  -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFY--NASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNA--ASDVSSR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRG
          RN G     P+SSF     T+  G+D    A+FY   A Y D TWRS   E +   PF YG+G    +SDVS+R SSPG++G +SVN+RQ NRG
Subjt:  -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFY--NASYGDLTWRSSNFERDVSGPFGYGLGNA--ASDVSSR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRG

AT4G26650.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein6.8e-10348.39Show/hide
Query:  TDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSIN-VSP-
        +D GKLF+GGISWDTDE+RL+EYF  +G++VEAVIM+DRTTGR RGFGFIVFADPSVA+RVI +KH IDGR VEAK+AVPR+DQ ++ R +  ++ +SP 
Subjt:  TDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSIN-VSP-

Query:  -----GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SPGPSRSP
             G  RT+KIFVGGL S++TE+EFKNYFDQFGTI DVVVMYDHNT RPRGFGFIT+DSEE+V+ VL KTFHELNGKMVEVKRAVPKEL S  P+RSP
Subjt:  -----GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SPGPSRSP

Query:  LGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGR--GLSPYYTGN
        L GY  NYG    +S  NS+ N +  GY+++ +G       GRFSP+ SGR+ F    S +G+G+N E+ LN  + G     N L Y R  G   + + +
Subjt:  LGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGR--GLSPYYTGN

Query:  SDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSI
         +R+ + IGY  G+    S ++ + ++LWG     N ++S+    +LG  SVG   G         NWG S ++S            N+ YG    SY  
Subjt:  SDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSI

Query:  GAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNAS--YGDLTW-------RSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
        G+G  G           SF  +T GFDG   + Y  S  Y D TW       +SSN    +S  +G+G+ N  SD S+ +S G+ G ++V  RQ++RG
Subjt:  GAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNAS--YGDLTW-------RSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG

AT4G26650.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein6.8e-10348.39Show/hide
Query:  TDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSIN-VSP-
        +D GKLF+GGISWDTDE+RL+EYF  +G++VEAVIM+DRTTGR RGFGFIVFADPSVA+RVI +KH IDGR VEAK+AVPR+DQ ++ R +  ++ +SP 
Subjt:  TDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSIN-VSP-

Query:  -----GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SPGPSRSP
             G  RT+KIFVGGL S++TE+EFKNYFDQFGTI DVVVMYDHNT RPRGFGFIT+DSEE+V+ VL KTFHELNGKMVEVKRAVPKEL S  P+RSP
Subjt:  -----GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SPGPSRSP

Query:  LGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGR--GLSPYYTGN
        L GY  NYG    +S  NS+ N +  GY+++ +G       GRFSP+ SGR+ F    S +G+G+N E+ LN  + G     N L Y R  G   + + +
Subjt:  LGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGR--GLSPYYTGN

Query:  SDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSI
         +R+ + IGY  G+    S ++ + ++LWG     N ++S+    +LG  SVG   G         NWG S ++S            N+ YG    SY  
Subjt:  SDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSI

Query:  GAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNAS--YGDLTW-------RSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
        G+G  G           SF  +T GFDG   + Y  S  Y D TW       +SSN    +S  +G+G+ N  SD S+ +S G+ G ++V  RQ++RG
Subjt:  GAGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYNAS--YGDLTW-------RSSNFERDVSGPFGYGLGNAASDVSSRSSPGFIGGHSVNRRQSNRG

AT5G47620.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein6.5e-9846.54Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
        M+ +S KLF+GGISW+T EDRL++YF +FGEV+EAVIMKDR TGR RGFGF+VFADP+VA+RV+  KH IDG++VEAK+AVPR+D  +  +++ S+  SP
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFSAFGEVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRMVEAKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP

Query:  GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
        GP  ++KIFVGGLAS+VTE+EFK YF QFG ITDVVVMYDH T RPRGFGFI+YDSEEAV+KVL KTFHELNGKMVEVK AVPK+++    R+ +   ++
Subjt:  GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY

Query:  GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
        G SR++S LN YTQG+S S I GYGV+ + R+SP    R  F+PF  GYG+ +NFE      YG  S+      +GR  SP Y  +  RFG+   ESG  
Subjt:  GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFSSGYGMGVNFEIGLNPGYGGSSNFTNNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG

Query:  --GNSSFFSSATQN-LWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASVGGGIGGTAFANSGVNWGSSGILSQGGGNNVFSNSGNHNYGGIDSSYSIGAGGYGRNSGTV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTAG
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AATTTTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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