; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16109 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16109
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr20:3305261..3308714
RNA-Seq ExpressionCarg16109
SyntenyCarg16109
Gene Ontology termsGO:0010228 - vegetative to reproductive phase transition of meristem (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6570949.1 Protein NOI4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.3e-17094.89Show/hide
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KAG7010788.1 hypothetical protein SDJN02_27584 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.9e-198100Show/hide
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XP_022943893.1 uncharacterized protein LOC111448482 [Cucurbita moschata]1.0e-19599.12Show/hide
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XP_022985722.1 uncharacterized protein LOC111483692 [Cucurbita maxima]1.5e-19197.07Show/hide
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XP_023511914.1 uncharacterized protein LOC111776784 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.2e-19799.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA76 Uncharacterized protein2.2e-15981.95Show/hide
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A0A1S3CKU4 uncharacterized protein LOC1035021035.3e-15881.38Show/hide
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A0A6J1CIN4 uncharacterized protein LOC1110113187.4e-15279.01Show/hide
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        NGGEGRDWTTSILLFV WA LM+YVF LAPNQTPSTDLYFLKKLL LK+DDGFKMNEVLVSLWY+MGLWPL+Y MLLLPSGRSSNSNVPVWPFL LS FL
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A0A6J1FXH1 uncharacterized protein LOC1114484824.9e-19699.12Show/hide
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A0A6J1J5P7 uncharacterized protein LOC1114836927.3e-19297.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04360.1 unknown protein8.5e-10053.04Show/hide
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        M+ +I+LISCN         FS+L  L K  TR   +T    S+S+   + +R  SS  ++ L  K+            ++ +P   + T ++       
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Query:  GGGNGGEGRDWTTSILLFVLWAGLMFYVFILAPNQTPSTDLYFLKKLLNLKNDDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPLIYSMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLGLS
              EGRDW++SILLF LW  L++Y F LAP+QTP+ DLYFLKKLLNLK DDGF+MN++LV LWYIMGLWPL+Y+MLLLP+G    S  P WPF+ LS
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Query:  FFLGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEEDELERWPLNFLESKFTAGITFAAGLGLLFYAGLAGESAWKEFYQYFRESRFIHATSIDFMLLSSFAPFWVYNDMSA
        FF G Y LLPYF LW PP PPV E EL +WPLN LESK TAG+T  AGLG++ Y+ +     W EFYQYFRES+FIH TS+DF LLS+FAPFWVYNDM+ 
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        RKW+D+GSWLLP S++PFLGP+LYL+LRP  + T  P D A+S+P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTACTGTTTGTATTGTGGGCTGGTCTTATGTTTTATGTGTTCATTCTCGCTCCAAATCAGACTCCGTCAACGGACTTGTATTTCTTGAAGAAGCTTCTGAACTTGAAAAA
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GAGCTCGAGAGATGGCCTTTGAATTTTCTCGAGTCGAAATTTACTGCTGGGATAACATTTGCTGCAGGACTAGGCTTATTATTCTACGCTGGATTAGCTGGTGAGAGTGC
GTGGAAGGAATTCTATCAGTACTTCAGAGAAAGCAGATTTATCCATGCTACGAGCATTGATTTCATGCTGTTATCTTCATTTGCTCCGTTTTGGGTTTACAATGACATGT
CTGCTCGAAAATGGTATGACCAAGGTTCTTGGCTTCTTCCATTTTCGTTGGTGCCGTTCTTGGGTCCTGCCTTGTATCTCGTCCTACGACCAATGCCAACGACGACTCCC
GTTCCACTCGACCGTGCTGCTTCTGAACCGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATTATTTTATACTTGAAAGAATTGGCTCTCAGTCAGAAATGAATGTGTGGTTCGACACTTGTTTTTCTATAATCAAGTTCAAGTCGGCCATGAATTGGTGACGGAAAAA
GCTTCGGATTCTTATGTTTCTTCATCCGCTCCCGCCACCGTTCTAAAACCCACAAAACTTGTCGCCAATTCCTAATCAAAATCCAAATTCAAACATGATAACCAATATCA
ATCTTATCTCCTGCAACTCTTTCTCACCGTCTCCTCCTTCAAGATTCTCAAAGCTTGGAATTCTCCATAAAACCCAAACTCGAAACCCCCAAATCACCCCCTTCAAGTAT
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GGGCTGGTCTTATGTTTTATGTGTTCATTCTCGCTCCAAATCAGACTCCGTCAACGGACTTGTATTTCTTGAAGAAGCTTCTGAACTTGAAAAATGACGATGGTTTCAAA
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