CuGenDBv2

Gene ID	Carg16166
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	Carg_Chr20:3644362..3644799
RNA-Seq Expression	Carg16166
Synteny	Carg16166
Gene Ontology terms	GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022943842.1 uncharacterized protein LOC111448454 [Cucurbita moschata]

1.4e-69

100

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA
        MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA

Query:  ASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        ASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
Subjt:  ASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

XP_022947464.1 uncharacterized protein LOC111451320 [Cucurbita moschata]

9.1e-61

86.84

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD  QTSP       DDG VIEE P S IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PITI LTPPIAR+LARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

XP_022971121.1 uncharacterized protein LOC111469888 [Cucurbita maxima]

5.3e-61

87.5

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD  QTSP       DDG VIEE P S IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITI LTPPIAR+LARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

XP_022986110.1 uncharacterized protein LOC111483951 [Cucurbita maxima]

1.9e-66

94.08

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP       DDGLVIEESPAS+ QSTVAQEPRTR
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

XP_023513086.1 uncharacterized protein LOC111777632 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

6.9e-69

99.31

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA
        MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA

Query:  ASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        ASTG ALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
Subjt:  ASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CXM4 uncharacterized protein LOC111015379

2.2e-60

86.18

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQ QT P       DDG VIEE P S+ QST  QEPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITI LTPPI+R+LARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

A0A6J1FU56 uncharacterized protein LOC111448454

6.7e-70

100

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA
        MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELA

Query:  ASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        ASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
Subjt:  ASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC111451320

4.4e-61

86.84

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD  QTSP       DDG VIEE P S IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PITI LTPPIAR+LARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

A0A6J1I2F7 uncharacterized protein LOC111469888

2.6e-61

87.5

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKD  QTSP       DDG VIEE P S IQSTV +EPR R
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITI LTPPIAR+LARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

A0A6J1JD52 uncharacterized protein LOC111483951

9.1e-67

94.08

Show/hide

Query:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR
        MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP       DDGLVIEESPAS+ QSTVAQEPRTR
Subjt:  MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSP-------DDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTR

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

1.7e-33

57.66

Show/hide

Query:  RFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELAASTGGALA
        R +E++KKYGKVA+GVHFSVS  SI+G Y+AIKNNVDVESLL+K  +  FSSK+    S D  L  + S  SD            N+T +LA S GGALA
Subjt:  RFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELAASTGGALA

Query:  LAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG
        LAVLCNKAL PIR+PIT+ LTPPIAR L +R I+++G
Subjt:  LAVLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

AT2G27290.1 Protein of unknown function (DUF1279)

8.3e-04

28.68

Show/hide

Query:  RELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELAASTGGALALA
        +ELL KYG   +    ++S  S +  YV + + VDV++LL K+   G S+                                 N T E      GA ALA
Subjt:  RELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELAASTGGALALA

Query:  VLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARR
           +KA  PIR P T+ LTP +A  + ++
Subjt:  VLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTTCTTCACCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTTAAGAAGTACGGGAAGGTCGCAATCGGAGTTCATTTCTCAGTATCGGCGGCTTCGATCACTGGCCTCTA
TGTCGCCATCAAGAACAATGTGGATGTTGAATCGCTACTCGATAAGTTACACATGGATGGATTCTCTTCCAAAGATCAGTCGCAGACTAGTCCCGATGATGGACTAGTGA
TCGAAGAAAGTCCTGCGTCGGATATTCAATCGACGGTGGCGCAGGAGCCGAGGACGAGGAATCGTACTGCAGAGCTTGCGGCGTCGACTGGCGGCGCGTTGGCTTTGGCC
GTTCTTTGCAACAAGGCATTGCTGCCTATTCGGATTCCGATAACGATTGGGCTGACGCCGCCGATTGCGAGGATGCTGGCGAGGCGAGGGATTATGAGAAGTGGTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAFFTGGGRFRELLKKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLDKLHMDGFSSKDQSQTSPDDGLVIEESPASDIQSTVAQEPRTRNRTAELAASTGGALALA
VLCNKALLPIRIPITIGLTPPIARMLARRGIMRSG

Carg16166 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome