; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16197 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16197
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionaquaporin TIP1-2-like
Genome locationCarg_Chr20:3804975..3806915
RNA-Seq ExpressionCarg16197
SyntenyCarg16197
Gene Ontology termsGO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
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GO:0015267 - channel activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000425 - Major intrinsic protein
IPR023271 - Aquaporin-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571043.1 ER lumen protein-retaining receptor, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-17499.69Show/hide
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KAG7010873.1 Aquaporin TIP1-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.4e-175100Show/hide
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XP_022944060.1 aquaporin TIP1-2-like [Cucurbita moschata]1.6e-17499.69Show/hide
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XP_022986191.1 aquaporin TIP1-2-like [Cucurbita maxima]5.2e-17097.81Show/hide
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XP_023512243.1 aquaporin TIP1-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-17298.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJ07 Uncharacterized protein1.0e-13178.59Show/hide
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A0A1S3C6M4 aquaporin TIP1-2-like4.2e-13379.94Show/hide
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A0A6J1CY31 aquaporin TIP1-2-like5.2e-13178.3Show/hide
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A0A6J1FYG0 aquaporin TIP1-2-like7.6e-17599.69Show/hide
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A0A6J1JAF0 aquaporin TIP1-2-like2.5e-17097.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P26587 Aquaporin TIP3-11.7e-1731.03Show/hide
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        Y +AQ LG+I+A LL+          + +  G    G     G+G    LVLE   TF ++YV  + ++D K    LG+  P+  G+I G++        
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         I     + G  +NPAR  GPA++  G  W  HW++WVGPF   A     Y + V +PT P
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Q94CS9 Probable aquaporin TIP1-23.3e-1832.91Show/hide
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        EL  P   KAA+ EF++  + VF  + S ++  K  +   + P  LI   +A  + LF+ + V   +SGG ++P   F A + G I+  +A VY +AQ L
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        GS++A LL+K A           GG  +     + G+G   A+V E   TF ++Y      +D K  D LG+  P+  G I G++ +A            
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        + G  +NPA   GPAV+ G  +W+ HWV+W+GPF
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Q9ATM0 Aquaporin TIP1-21.4e-1934.47Show/hide
Query:  ELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNE---SDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTF--PLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCL
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Query:  GSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGL--PMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAG
        GS++A LL+K A           GG  +     + G+G   A+VLE   TF ++Y      +D K  D LG+  P+  G I G++ +A            
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        + G  +NPA   GPAV+ G  +WE HWV+WVGP A
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Q9SV31 Probable aquaporin PIP2-53.1e-1629.48Show/hide
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        A EL     ++A + EF+AT L ++    +++     +++DP L            I  A   ++F+ +  T  +SGG ++P   F   L   +T  RA 
Subjt:  AHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPKLL-----------IPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRAA

Query:  VYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST-
        +Y++AQCLG+I    L+K A       +Y  G       G + G  I T +  E   TFV++Y   +    ++ +    +P++  +  G +   V ++T 
Subjt:  VYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST-

Query:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY
         IT      G G+NPAR LG A++    + W+ HW+FWVGPF  AA  A+Y
Subjt:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY

Q9XF58 Aquaporin PIP2-59.1e-1629.43Show/hide
Query:  IGAHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNE---SDPK--------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTR
        + A EL    +++A + EFVAT L ++    +++      +   S P         L I  A   ++F+ +  T  +SGG ++P   F   L   ++  R
Subjt:  IGAHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNE---SDPK--------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTR

Query:  AAVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVS
        A +YI+AQCLG+I    L+K   S     +Y  GG      G + G G+A     E   TFV++Y   +    ++ +    +P++  +  G +   V ++
Subjt:  AAVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVS

Query:  T-TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF---AACVAYYGFSVNLPTAPL
        T  IT      G G+NPAR LG AV+    + W+ HW+FWVGPF   A   AY+ + +    A L
Subjt:  T-TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF---AACVAYYGFSVNLPTAPL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G73190.1 Aquaporin-like superfamily protein1.2e-1831.03Show/hide
Query:  AHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLK----------SNESDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRAAV
        A E   P   +A + EF++T + VF    SI+S  K          +N     +L+ +A    LF  +     +SGG ++P   F A + G +T  RA  
Subjt:  AHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLK----------SNESDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRAAV

Query:  YILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGL--PMVCGMIAGSSAVAVFVST
        Y +AQ LG+I+A LL+          + +  G    G     G+G    LVLE   TF ++YV  + ++D K    LG+  P+  G+I G++        
Subjt:  YILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGL--PMVCGMIAGSSAVAVFVST

Query:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPF---AACVAYYGFSVNLPTAP
         I     + G  +NPAR  GPA++  G  W  HW++WVGPF   A     Y + V +PT P
Subjt:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPF---AACVAYYGFSVNLPTAP

AT2G36830.1 gamma tonoplast intrinsic protein7.6e-1830.8Show/hide
Query:  ELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNE---SDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTF--PLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCL
        E   P   KAA+ EF++T + V   + S ++  K  E   + P  L+  AV     LF+ V+    +SGG ++P   F A + G IT  R  +Y +AQ L
Subjt:  ELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNE---SDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTF--PLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCL

Query:  GSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLG--LPMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAG
        GS++A L++          K++ GG  +   G + G+G+  A V E   TF ++Y      +D K +  LG   P+  G I G++ +A            
Subjt:  GSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLG--LPMVCGMIAGSSAVAVFVSTTITGRAG

Query:  YGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPFA----ACVAYYGFSVN
        + G  +NPA   GPAV+     W  HWV+W GP      A + Y  F +N
Subjt:  YGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPFA----ACVAYYGFSVN

AT2G37170.1 plasma membrane intrinsic protein 22.5e-1629.53Show/hide
Query:  YIGAHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPK-----------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFT
        +  A EL    +++A + EFVAT L ++    +++      +SD K           L I  A   ++F+ +  T  +SGG ++P   F   L   ++  
Subjt:  YIGAHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPK-----------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFT

Query:  RAAVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFV
        RA +Y++AQCLG+I     +K A      ++Y  GG      G   G G+A     E   TFV++Y   +    ++ +    +P++  +  G +   V +
Subjt:  RAAVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFV

Query:  ST-TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY
        +T  IT      G G+NPAR  G AV+    + W+ HW+FWVGPF  AA  A+Y
Subjt:  ST-TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY

AT3G53420.1 plasma membrane intrinsic protein 2A2.5e-1629.37Show/hide
Query:  YIGAHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPK---------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRA
        +I   EL     ++A + EFVAT L ++    +++     +++D           L I  A   ++F+ +  T  +SGG ++P   F   L   ++  RA
Subjt:  YIGAHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPK---------LLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRA

Query:  AVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST
         +YI+AQCLG+I     +K A       +Y  GG      G + G G+A     E   TFV++Y   +    ++ +    +P++  +  G +   V ++T
Subjt:  AVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST

Query:  -TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY
          IT      G G+NPAR  G AV+    + W+ HW+FWVGPF  AA  A+Y
Subjt:  -TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY

AT3G54820.1 plasma membrane intrinsic protein 2;52.2e-1729.48Show/hide
Query:  AHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPKLL-----------IPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRAA
        A EL     ++A + EF+AT L ++    +++     +++DP L            I  A   ++F+ +  T  +SGG ++P   F   L   +T  RA 
Subjt:  AHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPKLL-----------IPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSPIFAFIAALRGVITFTRAA

Query:  VYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST-
        +Y++AQCLG+I    L+K A       +Y  G       G + G  I T +  E   TFV++Y   +    ++ +    +P++  +  G +   V ++T 
Subjt:  VYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSAVAVFVST-

Query:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY
         IT      G G+NPAR LG A++    + W+ HW+FWVGPF  AA  A+Y
Subjt:  TITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVL-RGGRLWEGHWVFWVGPF--AACVAYY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCACTGGACCTGCCGAGGAGGAGGGGCTTGCTTTGCCGGTTGACGACGGAGGAGGAAGCTCCGGTGGAGATCACGCCTCCTTTCTCTCCACATTTCTTCTTTA
CATTGGTGCCCATGAGCTTTTCTCACCACAGATGTGGAAAGCGGCCATGACAGAGTTCGTAGCAACAGCCTTACTGGTATTTTGCTTAACAACCTCCATCGTCTCGTGCT
TGAAATCCAACGAATCAGATCCAAAGCTCTTAATCCCAATCGCCGTTTTCATCATCCTCTTCCTCTTCCTCCTCGTCACTTTCCCTCTCTCCGGCGGTTTTTTGAGCCCC
ATTTTCGCCTTCATCGCTGCCCTAAGAGGCGTCATAACCTTCACTCGCGCCGCCGTCTACATTCTCGCTCAATGTCTCGGCTCCATCATAGCCTTTCTCCTAATCAAGGA
CGCAATGAGTCCCGATGTTGCCGAAAAGTACTCTCTCGGCGGCTGCACCATCCACGGCACCGGCGACACCCCTGGCATCGGTATCGCCACGGCTCTGGTTCTCGAATTCG
CCTGCACCTTCGTGGTTCTCTATGTCGGAGTGACGGTGGTGCTCGACCAGAAGATGAGCGACCGGCTCGGTCTGCCGATGGTGTGCGGGATGATCGCGGGGAGTTCGGCG
GTGGCGGTTTTCGTCTCCACCACGATTACAGGGCGGGCTGGGTACGGTGGGGTGGGGCTGAATCCGGCGAGGTGTTTAGGGCCGGCGGTGTTGAGAGGAGGACGGTTGTG
GGAGGGGCATTGGGTGTTTTGGGTGGGGCCGTTTGCGGCGTGTGTGGCTTATTATGGATTTTCGGTCAATTTGCCGACGGCGCCGTTGGTTGGAGCGAAGGGGGATATCG
GGATTTTGAAAATGGCCGGCAGTTGTTGGCGGTGGCGCCGCCGCCGGAGGTTGGAGGAAAAATTAGGGCAAAATGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCACTGGACCTGCCGAGGAGGAGGGGCTTGCTTTGCCGGTTGACGACGGAGGAGGAAGCTCCGGTGGAGATCACGCCTCCTTTCTCTCCACATTTCTTCTTTA
CATTGGTGCCCATGAGCTTTTCTCACCACAGATGTGGAAAGCGGCCATGACAGAGTTCGTAGCAACAGCCTTACTGGTATTTTGCTTAACAACCTCCATCGTCTCGTGCT
TGAAATCCAACGAATCAGATCCAAAGCTCTTAATCCCAATCGCCGTTTTCATCATCCTCTTCCTCTTCCTCCTCGTCACTTTCCCTCTCTCCGGCGGTTTTTTGAGCCCC
ATTTTCGCCTTCATCGCTGCCCTAAGAGGCGTCATAACCTTCACTCGCGCCGCCGTCTACATTCTCGCTCAATGTCTCGGCTCCATCATAGCCTTTCTCCTAATCAAGGA
CGCAATGAGTCCCGATGTTGCCGAAAAGTACTCTCTCGGCGGCTGCACCATCCACGGCACCGGCGACACCCCTGGCATCGGTATCGCCACGGCTCTGGTTCTCGAATTCG
CCTGCACCTTCGTGGTTCTCTATGTCGGAGTGACGGTGGTGCTCGACCAGAAGATGAGCGACCGGCTCGGTCTGCCGATGGTGTGCGGGATGATCGCGGGGAGTTCGGCG
GTGGCGGTTTTCGTCTCCACCACGATTACAGGGCGGGCTGGGTACGGTGGGGTGGGGCTGAATCCGGCGAGGTGTTTAGGGCCGGCGGTGTTGAGAGGAGGACGGTTGTG
GGAGGGGCATTGGGTGTTTTGGGTGGGGCCGTTTGCGGCGTGTGTGGCTTATTATGGATTTTCGGTCAATTTGCCGACGGCGCCGTTGGTTGGAGCGAAGGGGGATATCG
GGATTTTGAAAATGGCCGGCAGTTGTTGGCGGTGGCGCCGCCGCCGGAGGTTGGAGGAAAAATTAGGGCAAAATGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAATGPAEEEGLALPVDDGGGSSGGDHASFLSTFLLYIGAHELFSPQMWKAAMTEFVATALLVFCLTTSIVSCLKSNESDPKLLIPIAVFIILFLFLLVTFPLSGGFLSP
IFAFIAALRGVITFTRAAVYILAQCLGSIIAFLLIKDAMSPDVAEKYSLGGCTIHGTGDTPGIGIATALVLEFACTFVVLYVGVTVVLDQKMSDRLGLPMVCGMIAGSSA
VAVFVSTTITGRAGYGGVGLNPARCLGPAVLRGGRLWEGHWVFWVGPFAACVAYYGFSVNLPTAPLVGAKGDIGILKMAGSCWRWRRRRRLEEKLGQNV