CuGenDBv2

Gene ID	Carg16202
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase
Genome location	Carg_Chr06:2483587..2485828
RNA-Seq Expression	Carg16202
Synteny	Carg16202
Gene Ontology terms	GO:0009691 - cytokinin biosynthetic process (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0005829 - cytosol (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0102682 - N6-(Delta2-isopentenyl)-adenosine 5'-monophosphate phosphoribohydrolase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR005269 - Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG IPR031100 - LOG family

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7028142.1 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_022940555.1 cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7-like [Cucurbita moschata]

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XP_023005654.1 cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7-like [Cucurbita maxima]

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XP_023540869.1 cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038903675.1 cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7 isoform X1 [Benincasa hispida]

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A0A0A0LEQ3 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase

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A0A6J1CSQ5 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase

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A0A6J1FQZ0 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase

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A0A6J1J161 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase

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A0A6J1KZV7 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase

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B9F166 Probable cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOGL2

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Q8GW29 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG7

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Q8H7U8 Probable cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOGL3

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Q8L8B8 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG3

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Q9LFH3 Cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG4

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Arabidopsis top hits

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AT2G28305.1 Putative lysine decarboxylase family protein

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AT2G35990.1 Putative lysine decarboxylase family protein

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AT2G37210.1 lysine decarboxylase family protein

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AT3G53450.1 Putative lysine decarboxylase family protein

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AT5G06300.1 Putative lysine decarboxylase family protein

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTGGAGAGAAGAATTGATCTTGTTTATGGAGGAGGCAGCGTGGGATTGATGGGTCTTGTTTCTCGAGCTGTTCATGATGGCGGCCGTCATGTTCTAGGAATAATTCCACG
AACCCTAATGCCGGTTGAGATCACTGGTGGGACTGTTGGAGAAGTCAAACCGGTGTCGGATATGCATCAAAGAAAGGCCGAGATGGCTCGCCAAGCTGATGCTTTCATCG
CTTTACCAGGAGGATATGGGACCCTTGAAGAGCTTCTTGAAGTTATTACATGGGCACAACTTGGGATCCATCGCAAGCCAGTGGGACTGTTGAATGTGGATGGATACTAC
AATTCGTTGCTGAGTTTCATCGATAAAACAGTTGATGAAGGCTTTGTTTCGCCAACTGCACGTCGAATTATTGTGTCTGCTCCAACTGCTAAGCTTTTAGTCCAACAACT
CGAGGAATACGAACCTAAGTACGACGAGATAATATCACAGTTGGTGTGGGAAGATGTGGACAGGAGGAGTTACGTGGCCGAATCAGAGATTGCCACGTAATACATGTGGT
TTTGGTCAAAGTGCTTGATGGAAAAAAAGCGGGGGTGTTTTGTCTTTACTTGGGTATACAATATTTTATAATAAAGATATAATATTATATAAACTTCAACACAGGAACAC
AGGAACACAGGAACACAGGAACACAGGGAACTATCCCTTTTTTTCCCTTTTCTTTTTATTATTTTCTTGTGGGCATTTATGTATAAATGTTGGCAGTGAAAACAAAAAGA
AATTGGGAAAATAAAGGCTTTGTTTATATATATATATATATATA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

VERRIDLVYGGGSVGLMGLVSRAVHDGGRHVLGIIPRTLMPVEITGGTVGEVKPVSDMHQRKAEMARQADAFIALPGGYGTLEELLEVITWAQLGIHRKPVGLLNVDGYY
NSLLSFIDKTVDEGFVSPTARRIIVSAPTAKLLVQQLEEYEPKYDEIISQLVWEDVDRRSYVAESEIAT

Carg16202 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome