; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16205 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16205
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr06:2508547..2509044
RNA-Seq ExpressionCarg16205
SyntenyCarg16205
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596606.1 hypothetical protein SDJN03_09786, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.9e-8999.39Show/hide
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KAG7028145.1 hypothetical protein SDJN02_09325, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-89100Show/hide
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XP_022943016.1 uncharacterized protein LOC111447877 [Cucurbita moschata]7.6e-8898.79Show/hide
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XP_023005969.1 uncharacterized protein LOC111498829 [Cucurbita maxima]2.4e-8191.72Show/hide
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        VEEEEEREG+ESCECD KPDFDTTPFYTPCGSPPFF+PSPT DA DFPVQKDS DG    SFLAIEITH
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XP_038905411.1 uncharacterized protein LOC120091450 [Benincasa hispida]6.1e-3753.85Show/hide
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        SR LFTI EEEEEREGI  C         K D DTTPF+TPC SPP+F+P  SPTRD+ DFP  +    D+S   F  I+IT
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TPT7 Uncharacterized protein2.5e-2849.45Show/hide
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        MDGGLNKIAT LI LF   F  LLAQIL+   R R        +P Q C YLF WR ++RI+P EI S    D  S E A V      + EL KW+ LCG
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        PSR LFTI +EEEEREGI  C E ++     K D DTTPF+TPC SPP+ +PS +  + DFP  +   D +    F AI+IT
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A0A6J1F429 uncharacterized protein LOC1114422041.4e-3152Show/hide
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        MDGGLNKI   LI+LF +TFLLL+AQIL+  SR RH      P + C Y F WR + RIEP EIA  SK H +    E AA    +E+W+ L GPSR LF
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        TI +EEEE EGIES          T  F+TPCGSP ++     S SPTRDAG+FPV  D  D +    FLAIEI+
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A0A6J1FQJ7 uncharacterized protein LOC1114478773.7e-8898.79Show/hide
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A0A6J1J6W6 uncharacterized protein LOC1114817745.9e-3051.45Show/hide
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        TI +EEEE EG ES          T  F+TPCGSP  +   SPSPTR+AG+FPV  D  D +    FLA+EI+
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A0A6J1L0U5 uncharacterized protein LOC1114988291.1e-8191.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G11640.1 unknown protein3.1e-0733.53Show/hide
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        L      L+++     L+L A++ + F  RT   P+P   +    +L   +     +RIEP T I S   ++      AAV +E     +KWRV    SR
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         LFTI EE    E++ + + S E D+          +   D TPF TPC SPP+F  SPSP RD  D
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AT3G52480.1 unknown protein1.2e-0627.1Show/hide
Query:  GLNKIATALISLFAITFLLLLAQILF--------------------FFSRTRHHPTPTQPKQNCIYLFRWRTKTRIEPTEIASKVHDDSASPETAA---V
        GL   AT L+++FA   + + AQ  +                    F SR         P +  +Y F +  + +        ++   +A P  AA   V
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Query:  DQELEKWRV-----LCGPSRALFTIVE---------------------------EEEEREGIESCECDSKPDF----DTTPFYTPCGSPPFF--SPSPTR
        +    KW +     LCGPS  LFTI E                           +E E E + +   D + DF     TTPF TPC SPPF+  SPSP R
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Query:  DAGDFPVQKDSSDG
        D     V+++S  G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGGCGGCCTGAACAAGATCGCCACCGCACTCATCTCCCTCTTCGCCATCACTTTCCTACTCCTCCTCGCCCAAATCCTCTTCTTTTTCTCTCGCACGCGCCACCA
CCCCACCCCCACCCAACCCAAACAAAATTGCATCTACCTTTTCCGCTGGAGGACCAAAACCAGGATCGAACCCACAGAAATCGCGTCCAAAGTCCACGATGATTCCGCGT
CGCCGGAGACGGCGGCGGTCGACCAAGAATTGGAGAAGTGGCGGGTACTGTGCGGACCGTCCAGAGCGCTTTTCACTATCGTTGAAGAGGAAGAAGAGAGAGAAGGAATA
GAATCTTGCGAGTGTGATTCTAAACCGGATTTCGATACGACGCCGTTTTATACGCCCTGCGGTTCTCCTCCCTTCTTCTCGCCGTCCCCCACTCGTGACGCCGGTGACTT
CCCGGTCCAAAAAGATTCTTCCGACGGCTCGTTTTTGGCTATTGAGATTACCCACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACGGCGGCCTGAACAAGATCGCCACCGCACTCATCTCCCTCTTCGCCATCACTTTCCTACTCCTCCTCGCCCAAATCCTCTTCTTTTTCTCTCGCACGCGCCACCA
CCCCACCCCCACCCAACCCAAACAAAATTGCATCTACCTTTTCCGCTGGAGGACCAAAACCAGGATCGAACCCACAGAAATCGCGTCCAAAGTCCACGATGATTCCGCGT
CGCCGGAGACGGCGGCGGTCGACCAAGAATTGGAGAAGTGGCGGGTACTGTGCGGACCGTCCAGAGCGCTTTTCACTATCGTTGAAGAGGAAGAAGAGAGAGAAGGAATA
GAATCTTGCGAGTGTGATTCTAAACCGGATTTCGATACGACGCCGTTTTATACGCCCTGCGGTTCTCCTCCCTTCTTCTCGCCGTCCCCCACTCGTGACGCCGGTGACTT
CCCGGTCCAAAAAGATTCTTCCGACGGCTCGTTTTTGGCTATTGAGATTACCCACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDGGLNKIATALISLFAITFLLLLAQILFFFSRTRHHPTPTQPKQNCIYLFRWRTKTRIEPTEIASKVHDDSASPETAAVDQELEKWRVLCGPSRALFTIVEEEEEREGI
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