; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16383 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16383
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionbasic leucine zipper 4-like
Genome locationCarg_Chr12:3664524..3664946
RNA-Seq ExpressionCarg16383
SyntenyCarg16383
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585715.1 Basic leucine zipper 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-6798.57Show/hide
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KAG7020617.1 Basic leucine zipper 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.7e-69100Show/hide
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XP_022951865.1 basic leucine zipper 4-like [Cucurbita moschata]4.1e-6697.86Show/hide
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XP_023002896.1 basic leucine zipper 4-like [Cucurbita maxima]3.4e-5787.5Show/hide
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XP_023537896.1 basic leucine zipper 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-6091.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAH5 basic leucine zipper 82.9e-4170.83Show/hide
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A0A5A7V280 Basic leucine zipper 87.5e-4271.53Show/hide
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A0A6J1GK38 basic leucine zipper 4-like2.0e-6697.86Show/hide
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A0A6J1K7U1 bZIP transcription factor 22.4e-4070.92Show/hide
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        D+L R+L+RRH+VLR+ND LWMESVGLR+RLSDLCRI   M
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A0A6J1KML2 basic leucine zipper 4-like1.7e-5787.5Show/hide
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        VLNRRH+VLRQND LWME VGLRSRLSDLCRIL  MSS S T T
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9CA46 Basic leucine zipper 84.1e-0535.51Show/hide
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        Q L  +F+    L++  + S  S+ T  D  RK RR +SNRESARRSR RK+RH+E+L + + +L+ +N+ L D L++       V+ +N  L  E+   
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        R  + ++
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Q9FMC2 Basic leucine zipper 439.9e-0735.19Show/hide
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        T     + +SL   N++TSD ++ ++    + RK +R +SNRESARRSR RK+R +++L ++V  L  +N  L  +L  VL  +  V+ +N  L  E+  
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        L+  +SD+
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Q9LQ65 Basic leucine zipper 43.7e-1442.5Show/hide
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        T  EI ++L+    + + + S  +     D +K RR +SNRESA+RSR +KK+  E+L  EVNRL  +N++LK+RLA V++  + + R+N+ L  ESV L
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          RL +L R L AM SP  T
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Q9LZP8 bZIP transcription factor 535.8e-0738.24Show/hide
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        SL +     SD+ P   T TD RK +RM+SNRESARRSR RK++ L DL NEV  L   N  + +++     +   +  +N+ L  ++  L  RL  L  
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Query:  IL
        +L
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Q9SI15 bZIP transcription factor 22.0e-0737.5Show/hide
Query:  ATSDSQPSNPT----TTDPRKLRRMLSNRESARRSRWRKKRHLEDLNNEVNRLMTQNRDLKDRLARVLNRRHVVLRQNDCLWMESVGLRSRLSDLCRILT
        ++SD   +NP+    T D RK +RMLSNRESARRSR RK++H++DL  ++N+L   NR + + L         +  +N  L  +   L +RL  L  I+ 
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Query:  AMSS
         + S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13600.1 basic leucine-zipper 581.2e-1240.35Show/hide
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        + +N+  +++  Q+L++    N++TSD         D RK RRM+SNRESARRSR RK+RHL++L ++V RL T N  L D+L RV     + L++N  L
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Query:  WMESVGLRSRLSDL
          E+  LR  +S++
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AT1G59530.1 basic leucine-zipper 42.7e-1542.5Show/hide
Query:  TATEIQELLSLFLLNHATSDSQPSNPTTTDPRKLRRMLSNRESARRSRWRKKRHLEDLNNEVNRLMTQNRDLKDRLARVLNRRHVVLRQNDCLWMESVGL
        T  EI ++L+    + + + S  +     D +K RR +SNRESA+RSR +KK+  E+L  EVNRL  +N++LK+RLA V++  + + R+N+ L  ESV L
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Query:  RSRLSDLCRILTAMSSPSIT
          RL +L R L AM SP  T
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AT2G04038.1 basic leucine-zipper 482.3e-1140.87Show/hide
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        + +N+  +++  Q+L+   + N++TSD     +    D RK RRMLSNRESARRSR RK+RHL++L ++V RL  +N  L D+L RV   ++ VL++N  
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Query:  LWMESVGLRSRLSDL
        L  E+  LR  + +L
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AT3G49760.1 basic leucine-zipper 53.4e-1035.94Show/hide
Query:  AFTATEIQELLSLF---------------LLNHATSDSQPSNPTTTDPRKLRRMLSNRESARRSRWRKKRHLEDLNNEVNRLMTQNRDLKDRLARVLNRR
        +FT  +I  L S+F                +N   SD  P++   TD RK +R LSNRESA+RSR +K++HLE+++ ++N+L  QN++LK++L  VL   
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Query:  HVVLRQNDCLWMESVGLRSRLSDLCRIL
             +ND L ME   L  +L ++ ++L
Subjt:  HVVLRQNDCLWMESVGLRSRLSDLCRIL

AT4G37730.1 basic leucine-zipper 72.3e-1150Show/hide
Query:  PTTTDPRKLRRMLSNRESARRSRWRKKRHLEDLNNEVNRLMTQNRDLKDRLARVLNRRHVVLRQNDCLWMESVGLRSRLSDLCRIL
        P  TD RK +RM SNRESA+RSR RK+ H+++L  +VNRL  +NR+L +RL  VL++   V   N+ L  E   LR RLS++ RIL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGGAACAACATGTTGGGTTTCAGAGTGAGGTTCCTGACAACCATGCCTTCACTGCCACTGAAATCCAAGAGCTTTTATCCCTCTTTCTACTCAACCACGCCACCTC
CGACTCCCAGCCTTCCAATCCCACCACCACAGACCCGAGGAAGCTCCGCCGGATGTTATCCAACCGGGAGTCTGCCCGCCGCTCGCGGTGGAGGAAGAAAAGGCATTTGG
AAGATCTCAACAATGAAGTGAACCGGTTGATGACCCAGAACCGCGACTTGAAGGACCGACTCGCCCGGGTTCTCAACCGCCGTCATGTCGTTTTGAGACAAAATGATTGC
TTGTGGATGGAGTCCGTGGGCCTTCGGTCCAGGCTTTCGGATCTTTGCCGGATCTTGACCGCCATGTCATCGCCGTCCATCACGCTCACCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGGAACAACATGTTGGGTTTCAGAGTGAGGTTCCTGACAACCATGCCTTCACTGCCACTGAAATCCAAGAGCTTTTATCCCTCTTTCTACTCAACCACGCCACCTC
CGACTCCCAGCCTTCCAATCCCACCACCACAGACCCGAGGAAGCTCCGCCGGATGTTATCCAACCGGGAGTCTGCCCGCCGCTCGCGGTGGAGGAAGAAAAGGCATTTGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LWMESVGLRSRLSDLCRILTAMSSPSITLT